据美国媒体报道，在日本F-35A坠毁事故、飞行员失踪事故之前，日本航空自卫队曾发生过5架F35A战斗机7次紧急着陆事故，据认为当时冷却和导航系统有问题。有问题的5架F35A战斗机包括美国组装的1架F35A战斗机，其余4架都在日本境内组装。消息人士表示，此次坠毁的日本第一架自行组装的F35A战斗机发生了两次紧急着陆事故。同时，日本军事专家认为，此次坠机事件的最大疑点是飞行员为什么没有跳伞逃生，甚至F35A的弹射逃生系统也有问题。
第二次世界大战后期，德国空军发明了新的逃跑方式，一个接一个地弹出降落伞。飞机事故发生时，利用弹射装置，使飞行员突然跳出机舱，避开下方飞机，然后打开降落伞对抗气流，避免尾翼切割，安全逃生。战后弹射座椅在英国、美国、俄罗斯、瑞典等国迅速发展，成为高速军用飞机不可缺少的救生设备。就像日本军事专家认为的那样，如果弹射系统没有问题，飞行员是否应该获救？事实上，逃跑成功有三个条件。
第一，第一是子弹的速度和高度要合适。如果初始速度太小，上升高度不会到达尾翼，加速度过大，速度过快，那么“载荷”就会太高，对飞行员的身体造成严重损伤。早期弹道式弹射座椅使用火药推进是因为发射时间短，所以效果不太好。此后发展起来的弹射座椅都采用了“火箭式弹射”，将小火箭和座椅固定在一起，弹射后通。火箭的推力持续加速，加速时间长，子弹的轨迹高。
第二，飞机舱盖是否对飞行员造成伤害。第一个想法是用“扔盖子后的子弹”，用气流或火药整体扔掉舱盖，但由于降落伞时间延迟，或者舱盖没有脱落，弹窗启动，飞行员的头部撞向驾驶舱盖的惨剧发生了。于是，又出现了“盖式子弹”。没有掀起盖子，而是利用弹射座椅的动能打破舱顶，但会伤害飞行员的头部和脊椎。直到20世纪70年代，出现了另一项新技术，在舱盖上铺设微型爆炸电缆，子弹的时候，立即把舱盖炸得粉碎。
第三，机舱装置是否对飞行员造成伤害。由于飞行员射舱的速度非常快，如果身体姿势不符合驾驶舱内的装置，就会对飞行员构成致命威胁。后期发达的弹射器都装有固定飞行员四肢的自动装置，子弹前的自动装置将飞行员四肢和躯干都牢牢固定在座位上，也有专门的保护。
2018年底，美国政府的相关调查显示，F-35的弹射座椅仍然存在问题。在弹射的时候，飞行员会感到剧痛，甚至会导致颈椎受伤。但是由于同样的问题，这次日本飞行员没有弹射就活了下来，直到飞机残骸从海底打捞上来，一切都没有结论。
