李教授的考古队在秦汉时期的古墓中出土了三具棺材，其中两具尸体和一具无头男尸，第三具棺材只有一个宝箱。
最让人吃惊的是古尸和物品保存极其完美，技术远远超出历代古墓，接近了现在的最高水平。大家欢欣鼓舞之际，易教授的儿子易小川却溜出去和女友高岩谈分手。还没入正题，两个跆拳道高手却因为别的事情动起手来。高岩追打小川来到考古队的庆功宴上，却发现所有人都昏倒在地；小川的孪生哥哥易大川、高岩的哥哥高要、还有宝盒都被歹徒劫走了。小川夺回宝盒，救下高要，两人无意间打开了宝盒，金光四射……高岩救回大川赶到时，只看到紧闭的宝盒。
小川和高要失踪了！宝盒成为唯一的线索。易教授找到前妻易妈妈帮忙。两个老冤家见面就吵，但为了儿子决定联手。大川、高岩、易教授和易妈妈组成了一支探险队，开始了不断破解谜团，探寻历史，寻找亲人的历险经历。（类似《国家宝藏》的架构）。
小川并没有失踪，而是被穿越时空送到了秦朝的断头台上！幸亏项羽来劫法场，顺手救了他。逃亡途中，两人成了莫逆之交，结拜为兄弟。随后小川又结识了刘邦，两人也结拜成兄弟，相约同去咸阳。途中，小川巧遇也被传送过来的高要。两人寻访到汤巫山的世外高人，希望得到宝盒回到现代，却被告知六十年后再来。到了咸阳，刘邦却把两人出卖：小川成了关外修长城的苦力；高要被剁去男根成了太监，从此性格大变。
易小川(蒙毅)胡歌饰演 穿越线索人物,蒙家军头领,千年老妖,玉漱的爱人
高要(赵高)张世饰演 穿越线索人物,中车府令,黑袍人
玉漱白冰饰演 图安公主,大秦丽妃,小川的爱人
高岚、小月(虞姬)张萌饰演 易小川在现代第27任女友,高要的妹妹，赵高的干妹妹,西楚霸王项羽爱姬爱得至死不渝
神话第25集
第二十五集公子扶苏与小川并驾齐驱，相谈甚欢，让赵高撞见，扶苏是秦皇爱子，举贤堂又是势力庞大，他只得转头让路。朝上议事难免会有争执不下，赵高发现大臣分为两派，一派站在李斯这边，一派站在蒙恬这边。于是赵高找机会与李斯密谈，要与之联手扶起胡亥，与扶苏，蒙恬对抗。 不久，挂名胡亥公子和丞相李斯的“忠义馆”居然在举贤堂对面敲锣打鼓地开张了，引来路人围观。赵高派人乔装平民混在其中煽动，说忠义馆可以直接给官。三宝也被赵高拉住，赵高以优厚条件做诱饵让三宝也入了忠义馆，并将其灌醉。赵高手下在举贤堂门口搭起台，项羽对着忠义馆的人就是一顿猛揍。乔装平民的赵高手下与举贤堂众人在街上混战起来。小川赶到，抓起忠义馆的人，李斯指责小川徇私包庇。项羽不愿连累小川，站出要一人做事一人当，小川无奈将他拿下。危机当头，公子扶苏前来，请小川退出举贤堂，顺利化解危机。赵高跟踪发现原来扶苏有高人指点，此人正是蒙恬。朝堂上赵高想要开口，扶苏和蒙恬立马站出弹劾赵高宦官乱政，要依据律法剁去双脚。赵高吓得赶紧向秦皇请罪，心里对之更加恨之入骨，将二人写上黑名单。长城工地上，孟姜女前来寻夫。善良的她帮民伕们又是煮饭又是洗衣，大伙表示一定帮着她寻找丈夫。
神话第26集
第二十六集不久孟姜女的故事就传遍了咸阳城。玉漱见小月回宫面有泪痕，小月告诉玉漱街上听说的感人故事，玉漱也不禁流泪，心想平凡女子尚且如此有勇气，自己为何不能，于是冒险出宫与小川相会。她请小川帮助孟姜女寻夫，小川告诉她有一个人一定能帮她。蒙恬陪护玉漱外出狩猎，玉漱叫出扮成随同宫女的孟姜女，请求蒙恬帮助。图安王后来到大秦探望女儿，秦皇在大殿上为其设宴，并同意玉漱搬去王后行辕暂住。大川高岚想到平时经常趴在车上研究地图，摄像头可能录下了地图画面，终于复原了地图被烧掉了那一块，得出他们的下一个目的地是长城。王后到来其实是打探大秦朝中两大派系，不料玉漱从未关心秦朝政事，王后指责她忘记了自己的使命，要教女儿利用权力手段动摇大秦社稷，玉漱大惊失色。赵高为报复蒙恬密派三煞到长城搞破坏。夜里一段长城坍塌，赵高立刻启奏秦皇，秦皇不为所动，要亲自问蒙恬。蒙恬却早已连夜赶往出事工地。庞副将来寻小川帮忙，小川决定请玉漱向秦皇求情。第二天早蒙恬来到工地，却看到孟姜女跪在倒塌的长城前大哭。众人以为是老天被她感动，都跪下磕头。咸阳城内，孟姜女哭倒长城的故事传遍了大街小巷。项羽和小川相视而笑。易教授一行人来到长城，遇到女导游韩青青呼救。
神话第27集
第二十七集李斯在朝堂上弹劾蒙恬，几位大臣却向秦皇奏明孟姜女哭倒长城之传闻。朝堂上就此事是否可信吵得不可开交。关键时刻，庞副将带着当地官名联名写下的千人长卷，为孟姜女请命。秦皇终于相信，决定顺应天意立碑表彰孟姜女。下朝后，心中早已有几分洞明的秦皇质问赵高为何李斯与他如出一辙弹劾蒙恬，并罚其跪两个时辰反思。大殿上，出海归来的术士卢生上殿呈上“天书”，上书“亡秦者胡也”。蒙恬大喜，向秦皇进言说，“胡”所指胡亥，应该将他赶出宫去。李斯赶紧出列说胡指的当是胡人，因此要加强边防。秦皇命蒙恬出征，蒙恬只能遵命。赵高高兴这真是一场反败为胜！多亏韩青青指路，大川和高岚找到了易教授和易妈妈。韩青青告诉他们自己从小就在这里出生，因此对这里十分熟悉。易教授发现一块石碑，就是当年秦皇为表彰孟姜女所立之碑。原来她就是“土行者”后代。他们终于找到了第三枚戒指。蒙恬出征离开咸阳。赵高将儒生写于衣衫上的牢骚忤逆之言给秦皇看，并告知这些都是扶苏举贤堂门下的智囊。秦皇大怒，命赵高彻查。
神话第28集
第二十八集赵高来到举贤堂搜捕儒生。扶苏和项梁，小川一同商讨解救大计。扶苏在殿上为儒生说话，劝诫秦皇要听得忠言逆耳，秦皇大怒，命人将他轰出大殿，离开咸阳好好反省。小川意识到整个举贤堂都要遭殃，赶紧让项梁项羽逃亡。赵高带人围住举贤堂，小川用血在名册上写下自己的名字，重新加入举贤堂与众兄弟同生共死，在小川的劝说下，全体举贤堂成员放下兵器束手就擒，以表没有谋逆之心。玉漱病得昏迷不醒，王后焦急地亲自喂药。小川托小月将腰牌给玉漱表白自己的歉意和思念。夜里项羽冒险潜入行辕，只为离开咸阳前再见小月一面。小月慌乱中用簪子刺伤蒙面人，知道是项羽后大惊，项羽把半支断簪按入伤口，笑着说这是小月给自己的礼物。黑袍人趁着高岚昏睡来到她身边为她盖好被子，罗拉吃醋，告诉黑袍人自己爱上了他，可是却被黑袍人冷漠拒绝，并告诉她只有高岚无可比拟。行刑室中，小川和众举贤堂义士们被打得遍体鳞伤却依然不屈不饶。三宝也被抓到狱中，吓得战战兢兢，看到赵高以为救星来到。赵高却告诉他小川也被抓，他要三宝易帜对自己效忠，提拔三宝接手小川的位置，做监视皇宫消息的眼线。三宝领命离开，举棋不定地来到驿馆找小月，终于鼓起勇气告诉她小川被赵高抓了。小月十分震惊。
神话第29集
第二十九集小月找到赵高追问小川之事，赵高拿出小川的衣服还给小月，谎称小川已死，小月捧着衣服痛哭失声，随后坚定地向赵高磕了三个响头与他断绝兄妹关系，赵高不愿失去小月，便带小月到狱中探望小川，并保证会让小川活着。小月告诉玉漱小川的情况并且要她坚强振作，尽快康复。蒙恬在回咸阳的途中遇到赵高派来的刺客，一刺客飞出暗器扎伤蒙恬。恰好金将军也路经此处，躲林中将一位刺客从后面打昏带走。大殿中，赵高禀告儒生四百六十人已经被坑杀，经过调查已经找到举贤堂中谋反的证据。李斯则趁热打铁，要把举贤堂的人都处决了。这时蒙恬出现在大殿之上，赵，李吃了一惊。蒙恬指出此案较多疑点，并弹劾赵高违背律法宦官干政，弹劾李斯和朝中每位大臣明知律法却不指出，任由赵李二人作乱，理应全部治罪。秦皇大怒，下令严查蒙恬遇刺一案，所有官员罚去三月俸禄，并待蒙恬伤愈后重新会审举贤堂一案。玉漱为救小川全力养病，王后宽心不少。奉国王之命前来协助王后的金将军带来了了蒙恬遇刺这个意外的好消息。王后见玉漱痊愈，要她回宫将刺客一事透露给秦皇，借机除去赵高和李斯两位重臣。玉漱答应一试，却改道去赵高府上，厉声冷语用刺客要挟赵高放出小川。小川终于获释，却又成了一介平民，他来到行辕与玉漱相见，两人和解如初。
神话第30集
第三十集王后知道玉漱用刺客作交换去救小川，叹言教女无方，更无颜面对图安父老，气得向桌角撞去，鲜血直流。玉漱心痛，答应母亲从此忘记小川，履行自己的使命。蒙恬终于醒来，却得知自己身中剧毒，时日不多，要小川在自己死后以弟弟身份接手蒙家军。小川不愿卷入权力斗争，更不愿失去玉漱，再次拒绝。蒙恬押来十个美貌匈奴女子作为给小川的礼物，其中一个女孩坚决不跪被士兵抽打，小川看不过去便点名要下了她。谁知这女孩非但不言谢还要杀小川，小川不解，女孩告诉他明日她们姐妹就要被凌迟处死，只要被他要下的人才能够活下来，质问他为什么只要一个。小川去求蒙恬，蒙恬告诉他原来谁都不用求，只要他接手蒙家军，就成为了她们命运的决定者。何况将来若大秦两千万的子民在别人的刀俎下，又能求谁成全，小川哑口无言。小川冒雨彻夜跪求，却还是挽救不了另外九位女子的生命。德香却依然对他十分感激，因为她们被直接处死而免除了凌迟的痛苦。北方戎狄再次进犯，蒙恬带伤请缨，并请秦皇下圣旨任命小川为其副将，小川只得接旨。出征之日，蒙恬忍着病痛顶盔冠甲，精神抖擞地出现在全军面前，一面是为了鼓舞军心，一面也是为了让小川学习。赵高来到假惺惺为蒙恬送行，言语中刺探蒙恬的病情，却被蒙家军的军威震慑。
神话第31集
第三十一集蒙家军行军在沙漠中，却出现内奸扎破营中所有水桶，蒙恬料定是赵高要置蒙家军于死地。田伍长等人自认守卫失职，要按军法自我处置，小川劝他们将尊严和生命等同视之，并保证会为他们洗脱罪名。蒙家军的兵将因为干渴倒下不少，蒙恬飞鸽传书向学生李由求援。小川按捺不住，向蒙恬提出建议，蒙恬却打断他，除非小川接任蒙家军，否则他不会听小川的任何建议。小川怒责蒙恬置三万士兵性命于不顾，蒙恬提醒小川，如果全体三十万蒙家军将来因群龙无首而覆灭，国门被戎狄、匈奴踏破，二千万人就将生活在水深火热之中，玉漱公主也一样要遭受流落之苦，被人糟蹋。与之相比，这只是小数目。蒙恬终于牵着小川的手向众将士宣布，他就是自己失散多年的弟弟蒙毅，蒙家军今后的新统帅，并将随自己征战多年的盔甲传给了蒙毅。蒙毅利用沙漠的昼夜温差教士兵们变出了“天水”，威信大增。为了快速制胜，蒙毅派田伍长用苦肉计混入敌营，一面又让士兵们躺在地上诈装奄奄一息。戎狄果然中计，以为可一举获胜，于是倾巢出动，却陷入秦军埋伏，转头却发现兵营也被一把火烧毁，田伍长拿下了首领帕甲阔的首级。戎狄慌乱溃逃，蒙毅却命令麾下停止追击，蒙恬不解，他告诉蒙恬，自己的战术是擒贼擒王而不是大开杀戒。
神话第32集
第三十二集李由驰援赶到之时，军中已开始举行庆功宴。蒙恬告诉李由自己将不久于人世，请他不要就自己遇刺一事责问父亲李斯，并全力帮助蒙毅。大殿上秦皇大悦，封赏蒙毅位上卿，辅佐蒙恬总揽军务，正式接手了蒙家军。李斯与赵高不满，窃议要在其和丽妃头上做文章，好一箭双雕除去二人。小月出宫为玉漱捎话，见到了蒙毅的女仆德香大吃一惊。蒙恬送给蒙毅一批良驹，蒙毅想起自己曾经向大哥项羽许下的诺言，命庞副将将良驹送去会稽，这便是日后的乌骓。蒙府上，挂起了一面半烧焦的旗帜，这是蒙家时代忠良与荣耀的见证……蒙毅托小月将自己的分手告白交给小月。不料小月在宫门被太监截住。陈永厉在小月身上搜出手机交给赵高，赵高发现了小川和玉漱的秘密。大殿上，秦皇将蒙毅，玉漱同招来，赵高启奏，蒙毅暗中勾结丽妃，并且要呈上真凭实据。 赵高得意洋洋打开手机呈到秦皇面前，手机却没电了。他气急败坏地问蒙毅要充电器，蒙毅装作什么也不懂。赵高情急，令人押上小月，要她供出两人奸情。小月为了保护小川，竟供认自己违反宫规，爱上了蒙毅，才出宫探望。秦皇对赵高十分不满，令他自己按宫规处置妹妹，廷杖百下，逐出皇宫。小月被打得死去活来。赵高痛哭流涕，向秦皇苦苦哀求，秦皇丝毫不为所动。玉漱和蒙毅站出求情，秦皇这才放过小月。
神话第33集
第三十三集寝宫内的玉漱迫不及待地打开充完电的手机，听到的却是小川的分手告白。罗拉生日，黑袍人送她礼物，并为她带上，罗拉吻了一下他的脸，他却依然冷漠。罗拉终于控制不住，道出自己对高岚的嫉妒，这回黑袍人终于有反应了，却是一个耳光。罗拉来到健身房找到高岚，要与之对决。没想到高岚一脚，罗拉躲开，踢在大川脸上，装着窃听器的牙齿被踢飞。演武场上，士兵们正在蒙毅设计的石头杠铃，哑铃鞥进行肌肉训练。德香害羞，蒙毅便让庞副将脱下军服给德香穿，庞副将不情愿，却只得从命。德香来还军服，庞副将他打落在地，憋了一天的火终于发作：将军服借给一个女奴隶穿，本就是对蒙家军和自己的侮辱。蒙毅提醒他自己和他也曾经是奴隶，庞副将的态度终于有所缓和，向德香一躬以示歉意。德香将庞副将的军服的大破口缝补后归还，周围士兵取笑庞副将，弄得他好生尴尬。德香捡起两颗石头弹入两个士兵的嘴巴，蒙毅看在眼里。蒙毅盘问德香，德香交代自己是经过特殊训练的女刺客。蒙毅受到启发，决定来搞个古代版的特种兵部队。
神话第34集
第三十四集趁着高要不再，虚弱不堪的小月悄悄来找蒙毅，小川却感激她救玉漱的恩情，令小月更为痛心。秦皇来看玉漱，见她对着一片桃花伤悲，心中关切，就吩咐安排狩猎，让玉漱散心，并传旨令蒙毅将军陪同保护。围场上，玉漱的坐骑突然受惊疯跑，众人催马追赶，却只有蒙毅的黑风追上。蒙毅上前制服受惊黑马，玉漱问蒙毅是不是变心了，蒙毅告诉她，为了彼此的责任，他们都没有选择，除非有一天这个世界不再需要蒙毅。众人赶到，玉漱看着蒙毅骑马从身边飞驰而去，突然晕倒。夜晚，蒙毅院中惊现刺客，蒙面的飞虎队在第一时间出现，出奇制胜活捉了刺客。庞副将认出刺客所使用的暗器和刺伤蒙恬的一模一样，原来又是赵高！这时被捆绑的刺客们突然痛苦尖叫，纷纷死亡。原来他们是服下了定时的毒药，不论刺杀成败，都是死无对证。赵高听说刺杀失败，蒙毅的神秘卫队让他们损失惨重，不禁心惊肉跳，怕蒙毅也派秘密特务来刺杀他，遂一夜未合眼。王后与金将军再次潜入咸阳，密谋在秦皇的寿宴上下毒刺杀秦皇。寿宴上，秦皇请出琴师高渐离击筑为乐，所有人听得陶醉。病中的玉漱也被乐音吸引而来，这让乔装成太监的王后和金将军始料未及。眼看着玉漱和秦皇同时夹起有毒的菜，金将军飞出筷子，同一时间高渐离居然将筑琴向秦皇砸去 。
神话第35集
第三十五集秦皇拟旨升赏蒙毅，赵高诋毁蒙毅一双筷子可以打破古琴，刺杀秦皇也是轻而易举。秦皇大恐，正好此时边疆告急，他决定立刻派蒙毅出征。夜里，一封匿名信出现在蒙毅门外，上面写着“举贤堂有难“。蒙毅表示宁可信其有不可信其无，于是心生一计，向秦皇表奏，出征匈奴的兵源不足，不如将狱中的举贤堂囚犯充军，跟随自己出征匈奴，让他们戴罪立功，必会英勇奋战。秦皇同意。赵，李二人暗暗跺脚。德香来到蒙毅身边举起匕首，庞副将以为她要刺杀蒙毅，不料德香将匕首高举过头顶向蒙毅跪下，要蒙毅赐其一死。蒙毅接过匕首，庞副将再也控制不住，挡在德香面前，说绝不会让任何人伤害德香，两人终于衷情相吐。赵高调查出此次下毒可能是是图安所为。他派属官来到王后面前，谎称自己的主人是高渐离故友，要与其共谋刺杀打击。金将军劝王后谨慎，王后眼看玉漱已经不能指望，决定铤而走险，前往会见对方，可是，等来的却是秦始皇！赵高带人来到玉漱宫殿，搜查出早已被事先藏在宫中的兵器毒药。毫不知情的玉漱被带到秦皇面前，看到母后和奶娘被押上。王后为了保护玉漱，一把将其推开，厉声斥责。王后不愿受赵高小人审讯，凛然喝下毒酒死去，倒在玉漱怀中的王后告诉女儿一定要活下去。
神话第36集
第三十六集秦皇命将玉漱暂投冷宫。战场上，德香手持匕首与自己族人并肩作战。杀着杀着，德香遇到了曾一起玩闹的蒙家军士兵，却是看着他死去。一战结束，匈奴丝毫不退缩，两军伤亡惨重，蒙毅虽有把握取胜，却不愿付出更多的牺牲，于是决定：撤退！第二天早晨，匈奴人发现秦国大兵已经完全消失了，只留下撤兵前祭拜的木雕巨虎。匈奴人高呼胜利，德香也在城头上双手合十感谢老天，一边呼唤着庞副将的名字。匈奴人把巨虎作为战利品拉入了城池，彻夜狂欢庆祝，广场上醉倒了一片。这时，田伍长带着飞虎队从虎肚中鱼贯而出。他们见到德香，但都不想伤害自己的队长，德香却让他们不要手下留情。庞副将进城后拼命找寻德香，却终见德香寡不敌众而倒下，在自己的怀中死去。蒙毅凯旋归朝，秦皇为他举行庆功宴。庆功宴上，蒙毅却得知玉漱被投入冷宫，一时无法遏制怒气，居然一把抓住了赵高的衣领要揍他。秦皇十分生气。赵高趁机进谗蒙毅居功自傲，让秦皇更加对其不满。冷宫中的玉漱重病却无人问津，这时小月来到玉漱身边，因为她答应过蒙毅要好好照顾玉漱。朝堂之上，赵高借蒙毅病倒指责蒙毅连上朝都怠慢了。李由却以性命担保蒙毅不会如此，不惜与父亲李斯力争。秦皇嘉赞李由忠良，让他前去探病。赵高李斯商量让李由取代蒙毅，这样便可高枕无忧。
神话第37集
第三十七集李由在蒙府上撞见为玉漱取药的小月，一见钟情。病重的蒙毅告诉李由有心让他接手蒙家军。李由坚决推辞。李由前来提亲，赵高喜滋滋叫出小月，小月却甩下两个字“不嫁”，李由不死心，小月告诉他心中已有意中人，就是蒙毅将军！赵高恼怒，命人将小月关在房内，逼她成亲。小月以死抗从。赵高痛心疾首。皇陵工程一再延误，秦皇怒斩了监造官。在旁的赵高灵机一动向秦皇推荐由蒙毅去监造皇陵，绝对保质保量，而且还可一举两得削去其兵权。至于蒙家军，则可以由李由接手，由李由调遣。秦皇欣然同意。蒙家军将士议论纷纷，蒙毅提醒他们所谓忠魂是对国家忠诚，而不是对他个人，众将士齐送蒙毅离开。来到皇陵，蒙毅感叹这工程果然恢宏，他和监造官提起兵马俑，监造官却是一脸漠然，只告诉他这些坑洞精选数千最精锐的将士的殉葬坑。蒙毅大吃一惊，他不能让这样的事情发生。大川他们根据《茧人心经》的线索来到西安考察兵马俑，发现了一尊和小川长得一模一样的将军俑。易妈妈找高岚聊天，问她喜欢大川还是小川，高岚有些尴尬，告诉自己不要胡思乱想。
神话第38集
第三十八集小川向秦皇献上宝物——兵马俑，可以不用将士陪葬而动摇军心，损失战斗力；又可以万年不朽地守护皇陵。秦皇大喜之下又升赏了蒙毅，赵高却气得无可奈何，又和李斯商量起下一步对策。图安向大秦发起战争，秦皇派李由前去平定。赵高提醒按照祖制，应将玉漱贬为奴隶。李斯看出秦皇为难，便提议只让玉漱与黔首一起做工。工地上，赵高得意地告诉蒙毅自己给他找来了一个苦力。赵高带了两个太监和玉漱来到了工棚，特意派玉漱在蒙毅面前做最脏最累的苦力，让蒙毅看着自己心爱的人在自己面前受苦受罪。蒙毅心痛万分，却无能为力。而赵高则借此达到了他报复蒙毅的目的。一夜间，工地里的民夫工匠都开始生病，四肢无力倒在床上呻吟，大夫却无法找出缘由。蒙毅则开始怀疑其中有蹊跷。正当蒙毅为玉漱的病情干着急时，崔文子来了，也被太监挡在外面的他略施小计，迷晕了两个太监，借此为玉漱治病。同时，让那些中毒的工匠按时按量喝下井中的水。解了所有受害者的毒。夜晚，蒙毅和崔文子又守在井边，等待凶手出现。果然不出他们所料，两个太监被蒙毅和崔文子恶整一番。民伕都恢复了健康，而且工期按时完成。赵高十分气愤。蒙毅收到密诏后，请求崔文子帮忙，希望能按照秦皇的意愿，在地下建一座天界星宫。崔文子将北岩山人介绍给蒙毅。
神话第39集
第三十九集兵马俑的烧制终于完成，然而此时蒙毅却收到秦皇的密旨，要将所有的民伕给他殉葬。蒙毅陷入沉思中。秦皇告诉赵高，他最近感觉身体开始不适，颇为怀念故人，觉得是时候召扶苏回宫。不仅如此，还让赵高从现在起小心照顾玉漱，等图安战事的风声过去，他就会重新召玉漱入宫。赵高听到此事后，惊恐万分，回到府邸正暗自琢磨，一把剑突然上了他的脖子，原来是金将军。两人决定联手加害秦皇，金将军将毒药交给赵高。秦皇自知身体每况愈下，催促赵高加紧长生药的寻访，并将丽妃再次召回宫中，恢复她的封号。金将军得知玉漱再次回宫，甚感担忧.他与赵高进行一番商讨后，将计就计，引秦皇出城。秦皇大喜，立刻召蒙毅随行，亲自出城寻访长生药。无奈，蒙毅拯救70万人性命的愿望，还是未能实现。赵高计算秦皇所中之毒中途便会发作，为以防万一，让金将军带着忠义馆的秘密部队尾随，随时听从他的调遣。蒙毅利用一切关系寻访长生药。秦皇则立扶苏为太子，由赵高李斯和蒙毅共同辅佐。并且要在他死后，把他所有嫔妃和喜欢的东西都一同陪葬，包括玉漱。赵高为保自己，煽动李斯修改诏书，改立胡亥为太子。长生药终于制成，被举贤堂的人快马加鞭送往秦皇那里。不料途中遭遇袭击，伤亡惨重。
神话第40集
第四十集李由浑身是血杀出重围，送上长生药，却报告蒙毅和全体将士阵亡，说罢昏倒在地。赵高喜笑颜开，打开药盒共有三颗长生药。秦皇担心药有毒，要找人试药，玉漱万念俱灰，心中但求一死，好去追随蒙毅，于是主动要求试药。赵高拿起另一颗药，却送进自己嘴里。玉漱想到小川，想到死去的父母和图安百姓，亦不愿将药递给秦皇。秦皇眼睁睁看着长生药死去。李斯宣读秦皇“遗诏”：胡亥登基，为秦二世。朝堂上，大臣们纷纷启奏事项，赵高就在背后对着胡亥指导，胡亥就听一句说一句。大臣文开实在看不下去，站出来指责赵高原本是个宦官，不应该参与政事。赵高极为恼怒，利用当年的小川曾经讲过的“指鹿为马”的故事将大臣分为“鹿”帮与“马”帮。赵高把回答是鹿的大臣名字写在一张绢帛上，威胁金将军除去绢帛上的大臣，否则玉漱就要为秦皇殉葬。金将军按着绢帛一一杀死了那些大臣，名单的最后一个大臣竟然是李斯！他夜闯李斯书房，谁知这个李斯竟是李由假扮，矫捷躲过他一剑，几张大网从天而降，金将军就擒。李斯和赵高走入，金将军才知上当。
神话第41集
第四十一集审讯中，金将军自断静脉，一息尚存临死前金将军告诉李由一个秘密。原来蒙毅还活着。李斯亲自上门向赵高提亲，赵高想起小月的以死明志，面露难色。谁知小月居然主动同意嫁给李由，只要求赵高隆重办理婚礼。赵高喜出望外。赵高看到小月身着红嫁衣，分外美丽，希望小月明白他所做的一切都是希望小月能幸福。并将长生药作为贺礼送给小月。洞房之中，李由发现小月留下的信件，小月打算随蒙毅而去。蒙府祠堂内，小月摆起“蒙毅”与“蒙毅夫人小月”的牌位，举起匕首自尽，李由及时赶到，解救了小月。他带着小月前去药铺，小月看到蒙毅竟然还活着激动不已，但此时的蒙毅已经是个活死人。李由本打算带小月离开，而小月坚持要留在蒙毅的身边，并恳求李由为自己的行踪保密，李由无奈。小月从掌柜口中得知，唯有长生药才能救回蒙毅，小月毫不犹豫地将药放入蒙毅口中。忠义馆中，赵高质问三煞为什么还找不到小月的下落。三煞担心小月已死去，赵高大发雷霆，在咸阳城中张贴布告，通缉举贤堂的成员。这一切，让项羽大怒，决心同举贤堂的人与赵高斗争到底。蒙毅突然苏醒了。小月大喜，然而蒙毅始终对玉漱念念不忘，让小月很失望。蒙毅恳求小月，带他去救玉漱。
神话第42集
第四十二集正当玉漱入皇陵之时，小月匆匆赶来，告诉玉漱蒙毅吃了长生药，并没有死，玉漱请小月带话给蒙毅，如果长生药真的起作用，她会一直在皇陵中等着蒙毅。蒙毅彻底绝食，要随玉漱而去。小月无奈把玉漱的话告诉了蒙毅，欣喜之后，责问小月为什么不早点告诉他。这时，药铺里传来吵闹声，蒙毅得知情况后，想到了营救玉漱的方法。蒙毅向小月道歉，而小月此时也终于想通。蒙毅即将离开咸阳，让小月回到哥哥的身边，小月无法面对自己的哥哥，决定同蒙毅一起离开。李由来到药铺，听掌柜说蒙毅已经康复离开，李由极为震惊。蒙毅和小月乔装打扮来到城门，守门的兵手里拿着小月的画像在挨个盘查。两人幸遇三宝，灵机一动为他们解围，掩护蒙毅小月过了关。蒙毅询问小月的去向，小月不知，蒙毅让小月一同前往会稽。两人在路上，突然遇到李由在道路中间摆了酒席挡住去路。李由同意让蒙毅离开，但小月必须要留下。小月掏出一封信，请李由转交给自己的哥哥。于是两人互相斟酒畅饮。天亮之时，李由让蒙毅和小月一同离开咸阳。赵高看到了小月的信，痛苦至极。健身房里，高岚在与大川的斗嘴中，不慎摔跤受伤，高岚非常尴尬和郁闷。研究所里，高岚也向其请辞。小川和小月来到吴中县城，遇到了项羽。
神话第43集
第四十三集项羽见到小川和小月，一度以为自己在做梦。项羽将小月带到自己的书房，将所写的信交给小月。小月被项羽打动。小川和项羽、项梁商量，他要北上沛县，在那里组织起义，配合会稽起义。小川来到吕宅，告诉吕公此次前来用意，希望刘邦能同小川一起揭竿起义，完成一番大业。吕家没有钱财拿来举事，小川将夜明珠交给吕雉让其变卖，将所得的钱用来起义，自己上山找刘邦商量起义之事。小川略施小计，在山上找到了刘邦。小川劝说刘邦同他一起揭竿起义，推翻赵高当道的朝廷。不料，刘邦搪塞，为了她和孩子的安全考虑，向小川推脱了起义之事。小川不解，历史中的刘邦就是在沛县起义，变成汉高祖，而如今却与事实相反，担心无法救出玉漱。起义军大会之上，大家列队聆听台上小川的发言，正当大家议论纷纷时，刘邦上前自荐，决心与小川一同完成大业。在吕雉的协助下，煽动台下的人群，最终刘邦成了沛县的新首领。正当小月为项羽带上平安符时，刘邦求见。花园里，刘邦、项羽和小川三人同桌喝酒。刘邦借机让三人缔结兄弟之盟，项羽提出谁先打入咸阳，谁就做关中王，为公平起见，借给刘邦三千兵马。
神话第44集
第四十四集吕雉看着刘邦的战报，非常着急，刘邦告诉吕雉自有打算。刘邦有自知之明：论武力他不如项羽，计谋他不如小川，他只好想别的招术了。一路上他到处行善，现在天下都知道他是仁义之师。所以，他就让小川和项羽的军队在前面势如破竹，他的部队就在后面不紧不慢跟着，积蓄力量等待时机。小月在房中为小川和项羽祈福，捷报频传。小月满心欢喜，却见到了满脸哀戚的项羽归来，原来项梁阵亡沙场。小月陪伴项羽守孝，温柔地安慰着项羽，两人更加走近。李由率部下向小川投降，自己却自刎殉国，临终交代小川照顾好小月。刘邦不费一兵一卒率先来到咸阳城下，无奈咸阳久攻不下。小月来到小川帐下求见，担心咸阳被破，刘邦对老哥不利。小川告诉她函谷关被刘邦封锁，即使他想救也救不了赵高。恰好庞副将和田伍长带着飞虎队前来投奔小川，小月在一旁听了更是心焦如焚。吕雉密入咸阳与赵高做交易，只要他献出咸阳，以前的仇怨便一笔勾销，但如果让易小川或者项羽得了咸阳，两人绝不会放过他。因此，只有让刘邦坐上关中王之位才是他唯一生路。赵高迎刘邦入城。刘邦，吕雉携手步入大殿，坐上秦皇宝座，俨然已经拥有了全天下。小川破函谷关兵临咸阳城下，守城士兵只准小川和小月两人入内。
神话第45集
第四十五集高要与小月重逢激动不已，见此景小川握紧的剑又松开。小川见到刘邦，告诉他若论战功战绩，关中王之位应属刘邦，因此项羽绝不会善罢甘休。刘邦却说顺应人心，不战而胜亦是取胜之道。吕雉假惺惺惋惜小川差一点就失去了这座举世无双的宫殿，小川告诉她他丝毫不在乎这些，自己和玉漱之间拥有的是永恒的感情，而不是这些过眼云烟的名利。言谈间，士兵来报，项羽气势汹汹杀到鸿门。现代鸿门宴上，黑袍人告诉易教授，自己就是资助他们考古所多年的公司的董事长，而且这个公司实际上是一个文物盗运的集团，易教授和大川一直在收黑钱。黑袍人拿出一堆照片资料，只要一公布出去，易教授父子就会被整个考古界唾弃。项羽邀刘邦赴鸿门之宴，鸿门宴果然如历史中那样发生：“项庄舞剑，意在沛公”，小川不忍吕雉母子成为孤儿寡母，起身与项庄同舞，却是为刘邦挡剑。此时项羽接到小月的信，二话不说冲出帐外。小月哀求项羽为保其老哥性命放过刘邦，因为如今天下人人想要得赵高而诛之，只有刘邦肯收容他。项羽心软答应，不过刘邦必须到遥远的汉中去。身穿王妃装束的小月来向小川拜别，小川得知小月原来就是历史上的虞姬，心中五味杂陈，人生百年又能如何，而项羽和小月会一起成为一段千古佳话！
神话第46集
第四十六集小川历经数天挖出甬道，终于来到地宫深处，找到了玉漱，他带着玉漱走出石洞重见了光明。两人终于盼来了二人世界的幸福生活。小川的现代版语言总是让玉漱摸不着头脑，但他们的游戏，他们的谈话，却让玉漱感到无比甜蜜。在易妈妈家中，一席人的聚餐上，高岚拿出从研究所偷回的宝盒以及重要文件的备份。让身边的人又惊又喜。随之，高岚又收到神秘人刻意发给她的短信，内容就是那两句重要的口诀。吕雉特意向小川辞行，只希望小川能理解自己对她的感情，能够认真对待自己一次。无奈却遭到小川极为冷漠地敷衍。吕雉因爱生恨，发誓如果得不到小川，也决不让别人得到他。于是在小川饮用的杯中下毒，故意设下陷阱迫害玉漱和小川。玉漱被逼陪葬，如果不从，吕雉同高要就在玉漱面前不断凌虐小川。玉漱无法忍受这种痛苦与折磨，只能乖乖陪葬，被逼入山洞中，无意中按动天宫机关。小川眼看自己心爱的人离他而去，却无能为力。吕雉和刘盈在楚地扣为人质，吕雉设法让刘盈逃走，却遇小川。小川因玉漱的离去伤心欲绝，早已变得甚是沧桑，面目全非。他憎恨吕雉当初的行为，发誓要为玉漱报仇，然而却遭到刘盈的誓死抵抗。
神话第47集
第四十七集因小川，吕雉，刘盈三人的争执，引来了守卫的关注，守卫田伍长本想重重处理“大胆狂徒”，竟敢想杀害项王的人质。无意中发现小川竟然是他三年前的将军。田伍长恳求小川放过吕雉和刘盈，因为他奉项王之命，提取刘邦的家眷，连夜押往广武，希望小川能体谅他的处境，不要令他为难。小川经过三思，决定看在大哥项羽的份上，暂且放过了吕雉，同往广武，顺带看望多年未见的大哥项羽。在项羽办公大堂中，项羽正同其他将士议论两广战事，为粮草的事情发愁。此时小川求见，给项羽带来大大的意外与惊喜。项羽大悦，不顾旁人劝阻，坚持放下手中的军务，同虞姬，小川三人开怀畅饮。小川借机告诉刘邦天下会被刘邦所得，劝解项羽早做打算。不料项羽不以为然，桀骜不驯。而西广武大厅内的刘邦，表面上为战争的胜利与大臣同乐，其实却为自己的家眷被挟持而担忧天下统一的大业。刘盈为救母亲，企图杀死小川。不料被小川发觉，最终未得逞。小川被刘盈的孝心及仁义所感动，最终答应刘盈放过其母亲。小川受项羽之托，将刘盈带到刘邦身边，刘邦甚是感激。在小川的规劝下，刘邦立刘盈为太子。小川劝说刘邦放弃与项羽之间的征战，却遭到刘邦的婉拒。
神话第48集
第四十八集小川来到天宫门口，默默呼唤思念不已的玉漱。在独自下棋期间，恰逢一位老者，引起了这位老者的好奇心，两人随即谈论起象棋以及楚汉战争。小川得知项羽和虞姬将遭到不测，立即前往乌江，赶着营救深陷困境的项羽和虞姬。不料为时已晚，小川只能眼睁睁看着虞姬被乱箭刺死，倒在血泊之中。项羽因无法接受失败的命运及虞姬的离去而自刎，项羽悲壮倒下，他的鲜血染红了乌江。易教授，易妈妈，大川，高岚等人来到古图所指水域，去寻求想要的答案。碰巧在河边遇见一位画家，上前与之攀谈。在高岚与他的交谈中，获得了意外的收获。此画家居然是水行者的后人，由于机缘巧遇，易教授一席人找到了第四枚戒指，等待完成各家族坚守了两千多年的任务。黑袍人此时设下陷阱，假借绑架罗拉为名，企图罗拉能博得易教授一席人的同情，获取他们的信任，假冒是火行者的后人，好潜入易教授一行人中，以此来窥探宝盒中的秘密。高岚对此有所怀疑，因此质问罗拉，但罗拉说出事先准备好的口诀，坚持自己就是“火行者”的后人。
神话第49集
第四十九集罗拉编造谎言，凭借出色的演技，博取同情，充分得到了罗教授一席人的信任。在刘邦与太子的交谈中，刘邦告诫太子要广施仁义，得民心，感慨像易小川这样懂得其道理的人却不能为自己所用。易小川与高要来到茅庐院子，赴甲子之约。高要急着让老书童交出宝盒，却被拒绝。老书童坚持要易小川和高要按照当年的老规矩，请他们饮完杯中的茶才肯交出宝盒。几经饮茶波折，老书童终于拿出宝盒，借着易小川的虎形坠打开了宝盒。不料他两未能回到现代。高要大怒，而易小川在老书童提点下明白根本没有时空隧道，想要回去，只能一天天过日子。在老书童的告知下，易小川将一封信和一张地图放进了宝盒中，而高要则放入了仇恨留给后人。老书童将信物交给五位行者，让他们前往5个秘密地点，从此要他们隐匿身份，保护好信物，直到有缘人前来寻访。五位行者的后人，终于相见，他们终于能打开宝盒。在看到易小川写给家人的信时，他们终于相信小川回到了过去。同时，他们也按照小川给的地图，来到所指地点，通过地图所述方法打开宝盒。谁知宝盒突然间破碎，罗拉见情况不妙，便露出真面目。易教授等人此时才得知原来罗拉竟是黑衣人的同伙。黑衣人夺走了地图，将易教授等人抓获，在其身上安装里面具有致命毒素的装置，加以威胁。
神话大结局
第五十集（大结局）小川来到天宫内，终于找到了玉漱，小川向玉漱承诺两人永不分开。天宫内，所有人都感叹此刻的神奇，易教授，易妈妈，大川和高岚终于找到了小川。小川向他们介绍了玉漱，并告诉大家失踪的缘由及写信的时间。小川被宝盒带回秦代，化名千年老妖同大川成为网友，时刻向他们提供信息。正当高岚责怪小川不顾他们担心时，黑衣人出现了，原来黑衣人就是高要。高要向其证明了小川活了两千年，同时和高岚久别重逢，兄妹两人真情吐露。小川玉漱高要告诉他们自己吃了长生药，并告诉大家这个天宫是依靠地下的天星悬浮起来的。易教授和大川恍然，原来秦皇36年落下的天星确有其事。高要心中只有恨，一心要报仇，在高岚的苦苦哀求下，高要终于心软，放过了大川。天宫内，高要决定同小川和玉漱玉石俱焚，此时，他们身体发出蓝光，头发瞬间变白，变得疲惫。那些蓝光受到天星的召唤，离开了他们的身体，从此无法再长生不老。罗拉想要将高要救出天宫，却被高要拒绝。天星的浮力消失了，天宫塌陷，四人面临着生离死别。电影院里播放着《神话》的主题曲，观众纷纷站起离去。影院里，只剩下最后一对男女坐在其中久久不肯离去，正是大川和高岚。对于他们，这不仅仅是一部电影，一个神话，更是一段真实。
