，刑部上奏皇上，革去了刘锡彤知县之职。其他与审理此案相关的100名官员也革除顶戴花翎，永不续用。杨昌浚、胡瑞澜、陈鲁等皆被革职，刘锡彤则被从重处罚，发往黑龙江效力赎罪，且不准收赎。沈祥被判杖八十并徒刑二年，沈彩泉被判杖一百并流二千里。小白菜不避嫌疑，致招物议，杖八十．杨乃武不遵礼教，革去举人。至此，历时三年，经过七审七次误判的疑案，屡经曲折，柳暗花明，至此终于大白于天下。时为光绪二年十二月十六日。
杨乃武之案之所以能沉冤昭雪，实际上隐藏着深刻的、尖锐的官场权利斗争。审理过这个案子的浙江一干官员，从县到府到省，全都是曾国藩所统率的湘系军阀的手下，他们靠征战赢得这个职位，并没有太大学识，又缺乏严格的审判经验的教育，所以常会酿成冤案。即使有了冤案，因同处湘系，官员之间相互袒护，也会使这个案子难以翻案。其实，清廷早就想找到一个契机来弹压湘系军阀的势力，而杨乃武、小白菜案件的发生就是个绝好的机会，最后100多位官员顶戴花翎全部摘掉，永不续用，实际上是清廷借此有意压制湘系军阀。
出狱之后，杨乃武仍回余杭，以养蚕种桑为生，民国3年（1914）患疮疽不治而死，年74岁。小白菜也回到余杭，终因亲友无靠，衣食无着，入庵做了尼姑，法名慧定。民国10年（1930）圆寂，年76岁。
[相关链接]胡雪岩曾出资助杨菊贞告御状
据史料记载，杨乃武的姐姐杨菊贞准备第二次进京告状时，得到了当时非常著名的“红顶商人”胡雪岩的资助。胡雪岩自幼家贫，靠帮人牧牛为生，稍长，由人荐往杭州于姓钱肆当学徒，得肆主赏识，擢为跑街。咸丰十年（1860），因肆主无后，临终前，以钱庄赠之，乃自开阜康钱庄，并与官场中人往来甚密，成为杭城一大商绅。他为人乐善好施，仗义疏财。杨乃武冤案刚发生时，正在杭州筹办胡庆余堂药店的胡雪岩，就从他的好友吴以同口中得知这一事情。吴以同与杨乃武是同窗，他深知杨的为人，断定这次获罪定是有人暗中作梗。他将杨菊贞上京告状及准备二次进京的情况跟胡雪岩说了后，胡表示愿意资助。后来，在吴以同的引荐下，杨菊贞拜见了胡雪岩，胡安慰了她一番，不仅慷慨资助他们全家进京的路费，而且包揽了到京后的所有用度。
