在解放战争前夕，郭汝珍和董必武秘密会面，成为中共方面的高级情报工作人员后，作为张治中上将的助手，参加了美国五星上将马歇尔参与仲裁的国共谈判。陈诚，此时担任参谋总长，非常感谢郭汝静，当郭汝静已经有中将军衔时，仍然被任命为秘书长办公厅所长副厅长。另外，蒋介石
保荐郭汝瑰为主管作战的国防部第三厅（即作战厅）中将厅长，并一度派赴徐州，担任顾祝上将为总司令的陆军总部参谋长。解放战争期间，郭汝瑰中将冒着生命危险，通过来往于宁沪之间，为我党我军提供了许多国防部的核心军事情报，为解放战争的胜利做出非常特殊的重大贡献。
在解放军由贵入川时，蒋介石电令第72军军长郭汝瑰为第22兵团司令，直接指挥第21军、第44军、第72军和三个独立师，作为防堵解放军进入四川的前哨兵团，与解放军进行所谓的决战。
此时，郭汝瑰已提前剪除了第72军中的特务，做好了所部官兵的思想工作，按照与我军商定的计划，于解放军入川之际，在宜宾地区通电起义，破坏了蒋介石固守大西南的计划。
1981年5月，杜聿明因病住院，对前来探望的郭汝瑰说，“我就想听句真话，当时你是不是共产党？”直到人生的最后时刻，杜聿明对自身在淮海战败，仍然放不下当年对郭汝瑰的怀疑。
为了探索真相，杜聿明苦等了30余年，面对曾经的黄埔军校学长和同僚，一个将死的原国军徐州“剿总”副总司令兼第二兵团中将司令官，郭汝瑰不想杜聿明带着遗憾而去，就对杜聿明说，”当时的我们，只是立场不同。”杜聿明随即非常感慨说，“我早知道，我是对的，可是校长他们都不信啊！”
1948年，杜聿明在蒋介石的授意下，先后指挥了辽沈、淮海战役。国军在这两大战役时的很多作战计划，其实，都是郭汝瑰主政的“国防部”三厅制定的。
杜聿明，是国军中难得少有的明白人，他总是觉得这些计划有问题，会把国军引向绝路。特别是在淮海战役中，杜聿明怀疑国防部三厅内有“共谍”，最怀疑的对象就是中将厅长郭汝瑰。
解放战争时，有一次，杜聿明到郭汝瑰家中做客，在客厅的沙发上落座时，发现沙发竟然打着补丁，这一现象震惊了杜聿明，就在在心里琢磨像我这样的人，已经是国军中最清廉的了，郭汝瑰居然比我还要清廉，八成是个“共谍”。
对此，杜聿明并没有声张，而是多次向蒋介石建议，不要让国防部三厅制定作战计划。淮海战役时，杜聿明向蒋介石进言，称郭汝瑰是“共谍”，理由是过于清廉，结果被老蒋痛斥了一顿。
郭汝瑰，我党出于保密的原因，对这位1928年就入党，此后失去了组织联系，脱党进入日本陆军士官学校深造，直到1970年才恢复党员身份，在此之前，郭汝瑰的身份只是国民党起义将领-第22兵团中将司令兼第72军军长。
