左起:麦克塔维什、普莱斯、睡魔桑德曼、幽灵西蒙·莱利
一个敌人倒下了，意味着另一个更为强大的敌人将会取而代之。伊姆兰•扎卡耶夫的死并未稳定住俄罗斯动荡的局势，这位前叛军头目被人们奉为了民族的英雄。而扎卡耶夫忠实的追随者，弗拉德米尔•马卡洛夫则成为了俄罗斯极端主义党的新任领导者。
为了遏制极端民族主义势力，由普莱斯担任行动指挥的141特遣队与“睡魔”桑德曼带队的美国三角洲“金属”小队联合，共同执行代号“王鱼”的刺杀行动。旨在抓捕或击毙马卡洛夫。但是由于行动情报被泄露，所有人被迫撤离，撤离途中麦克塔维什被落在身边的火箭弹炸成重伤。普莱斯随即拔枪帮助队员撤离，敌人一拥而上，撤离飞机机身遭到了猛烈枪击，飞行员被迫紧急起飞，而普莱斯寡不敌众身中数枪，倒地被俘。
短片《王鱼行动》中的普莱斯形象
“王鱼行动”之后，谢菲尔德重组了141特战队，由麦克塔维什担任队长。入队后的首次任务就是前往哈萨克斯坦天山山脉的俄军基地取回美军坠毁卫星的攻击识别模块。麦克塔维什与加里•桑德森中士有惊无险的完成了任务。
为了更好的获得有关马卡洛夫的情报，总指挥谢菲尔德在手下“游骑兵”军团中挑选出约瑟夫•艾伦，成为美军安插在马卡洛夫身边的卧底，艾伦随马卡洛夫参与了扎卡耶夫国际机场的屠杀事件，但随后艾伦的身份曝露，在撤离时被马卡洛夫灭口。这是一场经过精心策划的阴谋。俄罗斯方面，因为艾伦的尸体是以CIA探员的身份被发现，以此为讯息，机场惨案的矛头自然指向了美国，美俄矛盾迅速激化。尽管此前141特遣队已经顺利夺回遗落的攻击识别模块，但俄军却早已成功破解，失去了卫星侦察的美国防御体系形同虚设，而俄军趁机全面进攻，美国本土遭到入侵。
《COD6》发售时饱受争议的机场屠杀关
而此时，141特遣队为化解两国矛盾，根据现场遗留的弹壳，追根溯源，在巴西的里约热内卢活捉了机场事件的军火提供者——亚历桑德罗•罗哈斯。虽然没能获得什么有价值的情报，不过还是从他口中得知了一位马卡洛夫总是挂在嘴边的人——代号“犯人627号”。
这一切就像一场赌马，绝不容许押错。而谢菲尔德认为“犯人627号”就是最后制胜的关键，随即命令141特遣队前去解救。
解救627号
令麦克塔维什做梦都没想到的是，这位“犯人627号”竟然就是此前杳无音讯的约翰•普莱斯上尉。成功解救普莱斯后，谢菲尔德将军要求141特战队继续追查马卡洛夫的下落，但普莱斯要求利用极端手段先解决美囯和俄囯的战争，中断了与谢菲尔德将军的联系。
之后，141特遣队前往西伯利亚阻止俄军潜艇前往美国。扑灭燃油大火的最好办法往往就是在旁边制造一场更大的爆炸，耗尽氧气，熄灭火焰。为了扭转美军在战争当中不利的局面，普莱斯只身一人进入了潜艇，开启了导弹发射井，一枚核弹飞向了美国领空，并在美国东海岸高空引爆，核爆制造的大面积电磁脉冲使得美俄两军的电子武器设备失去了作用，俄军失去了战局优势。
扭转战局的核爆，可惜了无辜的宇航员
通信的闭塞，使得美军总司令部误以为华盛顿区已经沦陷，准备发动毁灭性空袭。游骑兵团得知这一消息后，福利中士带队夺回了白宫，点燃了信号棒，终止了空军对白宫附近一带的空袭……
美俄之战的形式显然得到了逆转，为了撕下马卡洛夫的面具，谢菲尔德将军提供给141特遣队马卡洛夫最后两处藏身点的位置信息，小队兵分两路，由“幽灵”西蒙•莱利和加里•桑德森前往马卡洛夫位于格鲁吉亚与俄罗斯交界处的藏身屋；普莱斯与麦克塔维什则前往阿富汗坎大哈西南的废旧机场。幽灵等人虽然在藏身屋没有抓捕到马卡洛夫，但是截获了他的重要情报。
有信任就有背叛。
在撤离过程中，幽灵和加里•桑德森被前来接应的谢菲尔德杀害，情报也被拿走。而在阿富汗，普莱斯和麦克塔维什也遭到谢菲尔德手下的阻击，二人最终在尼古莱的接应下成功撤离。
小强、幽灵惨死
原来谢菲尔德将军才是真正的幕后黑手。5年前谢菲尔德指挥的抓捕阿拉萨德的行动中，因为核爆损失了3万陆战队员，而美国政府却只是冷眼旁观。在对极端组织夺取俄罗斯控制泉后美囯的弱势态度，让谢菲尔德决心利用马卡洛夫引起战争，在战争的洗礼下使得美囯改变颓废的现状。正是他将艾伦的卧底的身份告知马卡洛夫，造成了艾伦的死，引发了美俄大战。
此时普莱斯和麦克塔维什被谢菲尔德列为了全球通缉犯，141特遣队不再被承认。为了替幽灵和加里•桑德森报仇，普莱斯利用马卡洛夫手下的步话机与马卡洛夫取得了联系，敌人的敌人亦是朋友，虽然马卡洛夫对普莱斯等人怀有当年杀死扎卡耶夫的仇恨，但仍将谢菲尔德秘密基地的坐标透露给了普莱斯。
最高通缉
次日，尽管装备落后，寡不敌众，普莱斯与麦克塔维什为了牺牲的战友执意进行了一次自杀性质的任务。二人潜入了谢菲尔德影子部队的秘密基地，终于发现了将军的行踪。打斗中，麦克塔维什被谢菲尔德制服并用刀刺中了胸部，子弹上膛，千钧一发之际，普莱斯及时赶到，和谢菲尔德搏斗起来，却渐渐处于下风，此时身受重伤的麦克塔维什拔出了胸口的军刀，飞刀杀死了谢菲尔德。
此时尼古莱的“小鸟”直升机前来接应，并表示要带他们前往印度的避难所，为麦克塔维什治伤……
结尾的奋力一掷
COD6中最喜欢的角色 单选 0人 0% 普莱斯 0人 0% 肥皂 0人 0% 幽灵 0人 0% 小强 0人 0% 尼古莱 0人 0% 谢菲尔德 0人 0% 艾伦 0人 0% 福利中士 0人 0% 邓恩下士 0人 0% 拉米雷斯 0人 0% 马卡洛夫 投票