三代之死
三代佛永元崇非一参是在位时间最长的火影，也是第一次担任两次火影的忍者。他从年轻的时候开始背负着整个树叶的重担。
当年他只是二代火影身边的护卫，面对云隐村追兵只能眼睁睁看着二代火影指定自己为三代后，主动诱敌而死。二代的牺牲给三代火影留下了深刻的印象，让他下定决心不辜负二代的期望。
此后三代火影励精图治，把二代火影在管理村子方面留下的遗产一一发扬光大，忍者学校也越来越完善，村子开始走上正轨，三代火影却不贪恋权势，在认为时机已到的情况下把火影位置让给了波风水门。哪料到波风水门英年早逝，九尾作乱毁了村子不少地方，如此重大的压力下三代以年老之躯再次披挂上阵。
可猿飞日斩再怎么强大也始终只是个普通人类，人类抵挡不过岁月的流逝。终于在一个表面和平的日子里，三代火影猝不及防地遭到风影的攻击，风影脱下伪装，原来是自己曾经最喜欢的徒弟大蛇丸。在保护村子和不忍心杀徒的抉择之间，三代火影选择杀死大蛇丸保护村子，同时把自己年老生命的最后一刻贡献给木叶。
自来也之死
自来也跟三代年轻时很像，都曾被指定担任下一代火影，但是自来也生性放荡不羁，做不来火影这种苦差事，就喜欢云游四方写写书偷偷窥之类的，木叶高层也曾经因此不喜欢自来也。
但表面洒脱的自来也内心深处无时无刻不在惦记着木叶，所谓的满世界旅游，其实是在满世界搜寻情报，他找到了关于晓的线索，当时晓组织还是隐藏起来的黑暗组织，却被自来也发现，自来也明白这个组织的目的后立刻回到村子，寻找四代留下的遗产——鸣人，并负责保护好他。
这段时间里自来也跟鸣人建立了父子般的感情，跟木叶的关系也有所好转，更是替木叶找到了第五代火影纲手，可谓居功至伟。就在我们以为自来也要跟纲手一起把木叶变得更好时，自来也却死了，跟三代一样死在自己曾经最喜欢的徒弟手上——长门。他留下了鸣人和纲手黯然神伤，却在自己生命最后一刻还想着要把情报送回木叶！
鸣人父母之死
鸣人的父亲波风水门、母亲漩涡玖辛奈，本是郎才女貌的一对儿璧人，波风水门当年还是最年轻的火影，事业爱情双丰收，亲生孩子也即将诞生，这是一个男人一生中最幸福的时刻。谁都想不到这个最幸福的时刻竟然在转眼间变成最悲伤的时刻。
波风水门曾经的徒弟带土来到村子里，做的第一件事就是把九尾从漩涡玖辛奈体内解放出来，这导致了漩涡玖辛奈身为人柱力必定会死亡的命运。波风水门在不知情的情况下救走了儿子和老婆，跟昔日爱徒大战后终于将其击退，可是解放的九尾却无法解决。
这时候波风水门本可以带着老婆孩子一走了之，说不定能找出让漩涡玖辛奈不死的方法。但他是火影，他有保护木叶的责任，漩涡玖辛奈也不想临阵脱逃，这对夫妻在自己的儿子面前封印了九尾，还从九尾的爪下保护了鸣人，代价则是两个人的同时死亡。
