黑色裂变剧照
在群雄逐鹿，山河日变的“大争之世”，在英雄辈出，百家争鸣的战国时代，华夏大地的西陲正经历着一场亘古未有的“黑色裂变”。 古老的秦部族正是在这裂变的阵痛中重生。他们用一段段血与泪、爱与恨交织的悲壮故事，推动着整个时代前行。电视剧《大秦帝国黑色裂变》主要写秦国由弱变强的崛起历史并穿插回顾秦早期历史与六国历史，中心事件是商鞅变法，中心人物是商鞅、秦孝公与战国初期的一批伟人名士。以车裂商鞅、旧贵族复辟势力抬头、秦国命运重新陷入危机悬念而结束。
公元前三百六十二年，满怀壮志发誓要夺回老秦故土河西的秦献公赢师隰，在黄河西岸的少梁山与魏国大军进行了一场惨烈厮杀。尽管秦军斩敌无数并一举擒获对方主帅公孙痤，但秦献公却身中毒箭而死。嫡子嬴渠梁灵前即位，史称秦孝公。
秦国此时已陷入四面楚歌之绝境：辎重耗尽、兵源匮乏、国力虚弱；六国在山东聚集密谋分秦，秦国面临内忧外患的生死存亡之境。秦孝公嬴渠梁清醒地认识到秦国的落后与六国亡秦之心。为了稳定最急于灭秦的魏国，他在所有大臣的反对下释放了本应斩首为先父祭灵的魏国丞相公孙痤，并拿出国库与皇室私库的所有财产，用秦国不世珍宝以及巨大商利相诱六国权贵，力保秦国三年无战事，为秦国赢得了一丝喘息之机。
秦孝公手刻国耻碑，以血涂字，立于宫门，誓以变法强国。秦孝公大召天下贤士、六国学子入秦为官。在与贤士与学子的反复切磋度量之中，卫鞅脱颖而出。卫鞅只身一人游遍秦国穷山恶水，深入荒村野镇，了解当地民风民俗，努力寻找秦国落后的根源并竭力暝思治秦方略。同时他也被朴实、坚毅的秦风深深吸引。在短短的三个月里，他便明确了此后二十年自己与秦国要走的道路。
渭水船头，他一展其为政主张，以法家思想折服了秦孝公，以《强秦九论》使秦孝公看到了秦国未来的希望。促膝长谈三天三夜后决定：实行变法、以法制国；立下“君臣相知，永不相负”的誓言。
秦孝公拜卫鞅为相，开始了君臣二十年的大变法。卫鞅拜相后，颁布法令：禁止私斗，平民有战功可以封爵；取消封地，废除井田等一系列主张。朝野之间，不止于天翻地覆：平民封爵，开三皇五帝之先例；废除封地，动摇封建基础；开阡陌、废井田，让六国守旧之士顿足大骂。对卫鞅来说，压力最大的莫过于秦国内部的贵族势力长公子赢虔、长史公孙贾、上大夫甘龙、杜挚等前朝权倾朝野的大臣对他的刻骨仇恨。在秦孝公的支持，只能在背地对卫鞅变法下手。
卫鞅通过城门徙木立信，在民间赢得百姓信任。适逢河西村村民群斗，以身试法，村民们仗着是太子封地，不肯伏法，卫鞅亲自监斩，一次斩首七百余众，天下哗然。犯人临死前幡然悔悟：“秦人莫忘，私斗罪死耻辱！公战流血不朽！”。在秦人的内心深深地烙下了“法”的烙印。此事震惊了主张 “非战非攻，除暴政暴君”的政侠墨家子弟。墨家向来以“除暴天下”为己任，闻知卫鞅的暴行，召集门下弟子，发出除暴令，准备对他们认定的“苛政”、“暴君”、“酷吏”进行大规模的刺杀行动。秦孝公为了变法不在初期夭折，舍弃一己的生命的危险，亲至墨家驻地神农大山拜见墨子。在墨家论政台上，孝公慷慨陈词，他的英雄气概与王者风范折服了身居幕后的老墨子，老墨子最终决定与秦国冰释前嫌。秦孝公又要与恋人别离并立下了至死不渝的誓言 ：“天地合，乃敢与君绝。”变法使得秦国国力蒸蒸日上。农人力耕、百工勤奋、商市通达、民风日新；人人踊跃参军准备杀敌立功、授官封爵。新法法制逐渐深入人心。
为了能够得到秦王室更坚定的支持，在白雪的理解和劝导下，卫鞅与秦孝公的妹妹荧玉公主举行了大婚。卫鞅的第二批变法令陆续颁布以后，更是朝野沸腾。取消贵族封地，是破天荒的创举，秦国贵族视他为仇寇。河西村村民给太子交私粮的时候，私粮全部被调换为泥沙。太子一怒之下，杀死了几个村民，触碰了新法法令。这是一次比以往都更艰难的考验，最终秦孝公废黜了太子并流放至秦国边境之地，无征召不得回来。太子的两名师傅公孙贾被放逐陇西牧马、长公子嬴虔被施劓刑。
经过这次事变，朝野的风波平息了，卫鞅深知自己的处境，这段仇恨已无法化解也不须解。他正带领着秦国一步步接近他理想中的大治之世。秦孝公不顾卫鞅的反对，将商地在名义上封给卫鞅，国人尊称卫鞅为商君，后世称商鞅。
变法整整持续了二十年，秦国的新军练成，国富民强，百姓勇于公斗，平民争立战功。秦孝公和商鞅都老了，虽不足五十岁却都已心力交瘁。秦孝公召回了流放二十年的太子嬴驷，撒手而亡。嬴驷即位，六国趁机向秦国施加压力，要求秦国杀商鞅以谢天下。朝堂内外陈渣泛起，新仇旧恨都浮上来。一直在秘密破坏变法的老臣们听说新君嬴驷也有杀商鞅的想法，争先恐后地跳出来。商鞅将手中的政权、兵权交出，带领弟子们最后一次修订秦法，坦然被捕，被五马分尸。嬴驷出兵函谷关，进取河西之地，扫清所有反对变法的旧贵族，将商鞅之法立为万世国法。
而在那充满霸气的咸阳皇宫里，一个比他任何先辈都要更加冷俊的铁碗君主，正在谋划着将怎样扫平一切胆敢阻挡他完成霸业的朽物。一场新的血雨腥风又将开始……
