维德拥有反物质子弹，足以对抗太阳系联邦政府，但最终他遵守诺言，交回了星环公司的权力，让程心做出了放弃曲率驱动飞船的研究决定。这件事是三体系列最大的谜题之一。在田加刚所著、科幻世界杂志社出版的《三体秘密》中对此有连续三章的讨论和分析。下文是《三体秘密》第一稿对此进行的分析（正式出版时为第四稿），脑洞开的有点太大，供诸君批评。
重温一下托马斯·维德的几句名言：1、前进！前进！不择手段的前进！！2、只送大脑。3、你会把你妈卖给妓院吗？4、失去人性，失去很多，失去兽性，失去一切。这几句话已经足够勾勒出维德的性格，那就是一个为了目标不择手段、血腥冷酷的男人。他引诱程心送云天明的大脑到三体、刺杀同事为了让云天明当选、获得星环集团研发光速飞船，可见他不但铁血无情，而且心思缜密、计谋过人。
可就这样一个大老爷们，在他组织武装部队准备对抗太阳系联邦政府完成光速飞船的研究时，被程心的一句话轻易地拦住了，十分脑残地放下武器，最后连同他的战士，一起被人类处死。直接结果，是太阳系最后的拯救机会被耽误，程心后来也为此悔恨不已。
这是维德留给世界最大的谜，他完全可以依照他一贯的风格，无视程心，宣布星环城独立，没有任何人会觉得他有何不妥。可他偏偏就因为程心一句话，放弃了数十年的努力。这不但是维德的谜，大概也是残存的太阳系最大的谜。
实际上，掩体纪元出现的本身，就是个大问题。1、三体第二舰队在三体坐标系被星舰人类暴露后，直接开赴宇宙深渊，却不再理会太阳系。实际上它完全可以顺手把地球给消灭了，要知道，那时候它消灭地球简直易如反掌，六枚水滴已经攻入地球（发现强互作用力宇宙探测器! 共六个，其中一个飞向地球与太阳的拉格朗日点，另外五个以一、二、二分为三个编队，以25000千米/秒的速度冲向地球，预计十分钟后到达地面），就连毁灭整个太阳系恐怕也费不了多少事。2、按照黑暗森林的理论，宇宙文明间根本就没有善意可言，只要发现隐藏的文明，最好的策略就是消灭之，“消灭你，与你何干”。三体舰队发现地球却不消灭，这就违背了黑森理论。3、如果说三体文明因为云天明实现了大逆转，变善良了，可人类是一个具有强烈报复心的种族啊，再说人类的科技还随时出现突变。现在三体跟人类已经结下了这么大的梁子，不怕以后在银河这么小的地方再碰到吗，那可是仇人相遇分外眼红，想躲也躲不掉了。总之，无论怎么考虑，三体也应当对人类一枪消灭，然后逃之夭夭。
再一个问题，三体都走了也还好说，却连智子也一起带走了，理由是怕碰到智子盲区，然而，盲区这么先进的东西，太阳系人类何年何月才能发展出来，而且，从三体世界遍布观测站来看，三体人的好奇心也是非常强的，它不想看看太阳系以后是怎么毁灭的吗？有人说智子是巨大的资源，放太阳系不合算。但是智子本来的用途就是探测，与其在宇宙漫无目的探测，显然不如在一个确定的目标上定点观察更为合算。
智子在太阳系最后一次出现时，是约程心茶道谈话。她的形象已经是一个温婉可人的美女，一个正经八百的地球人类，跟最初出现时的一粒看不到的质子已经发生了根本性的变化。
以上四五条线索串联在一起，有读者大概已经推论出来了，只需要一个假设，所有问题都迎刃而解——在掩体纪元，太阳系人类已经被三体实施基因改造，90%以上的人类，实际上流的都是三体人的血。因为都是自己人，所以三体没必要毁灭太阳系；因为发现绝不多数都不是自己人，所以维德对挽救太阳系失去了兴趣；三体因为智子遍地都是，还有什么必要留一个智子在这里监视。
以下分析三体文明对地球文明实施基因改造的可能性、可行性和必要性，以及证据。
按照大刘对宇宙文明的最基本设定，一是生存，二是扩张，每一种文明，都有将文明扩张到整个宇宙的根本性冲动和追求。如果没扩张，只是因为能力不足。扩张最原始的方式，就是生命复制。然而，直接将生命复制到另一个迥然不同的星系，很可能遇到环境不适应的问题，这时就需要改造。方式有两种，一种是根据自身的结构进行改造，一种是根据该星系现有的智慧体进行改造。显然后一种方式更为经济、简便。
也就是说，三体人要在地球上居住，未必能适应地球上那几百亿种病毒、微生物密布的环境，还不如直接融入地球，利用地球人孕育自己的后代，或许它们会发现这种孕育方式，比分裂自身、消灭自己为代价孕育后代的方式要好许多。
从技术上来讲，三体完全具有这个能力。不说前面提到的杨冬，最大的例子就是云天明和智子。云天明仅有一个大脑，就能复原为一个人，这表明三体的基因工程技术已经高出人类几个数量级，智子仅仅只是一个微观粒子，最后也发展成为一个与地球人毫无差异的美少女，这表明三体已经跨越到远程开展基因工程的地步了。还有基因武器、大面积种植转基因作物，等等都表明三体的生物基因技术完全具有重塑生命体、再造新人类的能力。
六个水滴进入地球，将人类全部赶往澳洲和火星，而广袤的大陆上，就成了他们大量繁衍的试验场。三体原本的政策是消灭人类，但是“与第一轮危机时不同，三体世界对人类的政策发生了重大变化，智子称三体没有消灭人类文明的计划，而是在太阳系为人类划出了保留地”。什么因素让三体决定保留人类呢，原因正是想借助人类制造三体人，人体本身就是最好的孵化器。
有四条线索可以证明这点。一是，在大移民时代，人类只剩下了5000万人，并且是吃人的人。“已经开始吃人了吗？应该不会这么快，程心相信，即使到了三个月后完全断粮之际，大部分人也不会吃人。所以大部分人将被淘汰。剩下的那五千万人无论仍然是人还是变成其他什么东西都不重要，人类作为一个概念即将消失”。这时，人类的伦理和秩序完全崩溃，人类作为一个概念已经消失。随后，程心就失明了。
二是，在引力波飞船向宇宙发射了三体坐标后，三体舰队撤离太阳系，随后“智子已经命令治安军全力疏散澳大利亚的人口，从哪里来回哪里去，疏散速度会越来越快”。问题是，三体为何此时大发善心，不毁灭地球也还算了，居然协助剩下的五千万人有序疏散、防止骚乱，保证他们的生命，并帮助重建家园。唯一的解释就是，这些“人”其实都已成为孕育下一代变种三体人的宿主，还需要他们活着。“这时，人类也出现了有史以来最低的出生率”。
三是，在大移民之后很长一段时间，智子并没有离开地球，她的主要使命，是督促地球生命向太空、宇宙转移，“请相信我，人类绝对无法在打击中幸存。逃亡吧”。但矛盾的是，她又拒绝传授技术。这可以理解为，地球生命绝大部分毕竟与他们血脉相关，他们希望能留存更多的生命。但是地球也有很多人类，又担心人类报复，所以就出现了矛盾的心理。但三体人在这时却成为了地球人的精神支柱、祷告祈求的神，其信仰者多达数百万人（占了十分之一）。
四是，联邦与星环城的冲突是维德主动挑起的。星环集团完全可以秘密地研制光速飞船，而联邦也是睁只眼闭只眼的态度。但是维德却主动宣布，自己要制造曲率驱动飞船，引起轩然大波，随后，维德又宣布星环城独立，从而引发战争。如果维德不主动宣布独立，那星环城在几十年的时间里完全可以造出几百上千艘光速飞船。但实际上，却就造了一艘。维德的真实想法是，发展光速技术本来就是为极少数真正的人类服务的，而不是服务于所有地球人的，因为那都是三体人。
在掩体纪元，过了将近100年的时间。这时，除了弥留的一些公元纪元人类，整个太阳系，看起来人口众多，实际上已经没有多少真正的人类，绝大多数都是经过三体基因改造的，改造后的人类将更加适应太空生活。甚至，改造后的三体人比地球人更加聪明、强壮，因而把控了绝大多数的资源，位于社会金字塔的塔尖。那些地球人，又蠢又笨，又不灵敏，又不适应星际空间的虫子们，自然沦为社会底层劳动人民。当然，三体并没有告诉地球人这一点，每一个地球人，以为地球人类就是如此。
太阳系早已是三体人的太阳系，大刘没告诉你而已。你们拼命要捍卫的太阳系，主人已是三体人。三体的阴谋自然瞒不了跨越了若干个纪元的特务头子维德。“消灭三体，保存人类”是维德的既定策略。但是他没办法去区分，两者外观已经一模一样。一种方案是，抛弃太阳系，发展光速飞船，带走确信为地球人类的人；另一种方案是，主动引诱神级文明对太阳系的攻击，与三体功归于尽。维德的威慑度是百分之百，这就意味着，他前一种方案无法做到时，一定会采取后一种方案。
太阳系联邦政府对星环城宣战后，维德面临选择，是对抗政府，现在就消灭以三体人为主、包括地球人的太阳系生命，还是放弃抵抗，等待神级文明消灭这个充斥外星生命的太阳系。他把这个选择权交给了程心，事实上，两个选择对他来说，并没有区别，只是前一个选择，需要更多的地球人来陪葬，后者，则更少的地球人陪葬。他知道程心会选择后者，然后他说出了那句著名的话，“失去人性（发生战争），失去很多（三体人），失去兽性（失去三体人），失去一切（太阳系）”，他所隐含的另一层意思是：以战争保留星环城，人类与三体共存于宇宙，三体尚能存留一息，而如果让外星文明消灭太阳系，三体人在太阳系耕耘的生命将全部消亡，只有部分地球生命可以留存。
程心果然不出维德所料，选择了放弃抵抗，终止光速飞船研究，过了60年之后，地球人类几乎死亡殆尽，整个太阳系都是三体人时，被歌者整体二维化了。当然，这些三体后代，对三体世界来说，因为是变种人，他们的死亡也是无足轻重。（注：本文摘自田加刚所著《三体秘密》第一稿章节，正式发表时，本章节有重大改动。）
