灵魂是怎么来的？灵魂和生命的关系是什么？灵魂存在于生命中的意义是什么？接下来，我将谈谈关于灵魂的一般疑问。
人类出现不过几百万年，如果有灵魂、有转世，那么之前人类是哪里去了？如果恐龙时代没有人类，那个时代是什么情况？
已知生命并非从物质中转化而来，随着生物技术的不断进步，科学家们深入到生命的微观层面，吃惊地发现生命体中存有大量被创造的痕迹，“指纹”、“脚印”比比皆是，就差留张名片了。当然，名片也许有，只是我们看不懂。由此可推断，在生命体出现之前，一定有某种意志存在。
同时，物理学家们也在为宇宙的高度有序性而困惑——宇宙中的所有原子结构形态全都一个模样！很少见到传说中的“反物质”，这是怎么回事？如果宇宙是随机生成的，那应当是无序而混乱的啊！只有在刻意的安排下，宇宙才能是现在这个样子。由此可推断，在宇宙出现之前，一定有某种意志存在。
这是谁的意志？通常认为这是神的意志，但《天机论》中经过详细论证，否定了这个说法，认为这种造物的意志属于另一种具有主动性的意识体——灵魂。
可以做如下设想：
在没有宇宙的时候，是一片无边无际、无始无终的混沌世界。我们这些在宇宙中住惯的人们，很难理解那个世界。那个世界是极无序极混乱的，常会发生一些莫名其妙的事情，因此某些灵质会莫名其妙产生了自我意识，俗话说就是“成了精”，这就是灵魂。由此可知，灵魂是自生的。
为什么说灵魂是自生的，而不是被创造的，或是某个“总意识”的分支呢？这很简单，不知大家发现没有，凡是大批量生产的同类产品，都是一个模样儿的，像螺丝帽啊什么的，号称标准件。可灵魂则是各个不同，哪有一大批人是同样的性格呢？如果有个神造出（或分出）这么多各不相同的灵魂，这个神一定是严重的精神分裂、性格分裂，而且是粉碎性分裂。
有人就说了，人家神的境界是人不能理解的，神是空空非非的，怎么能以人的思维去理解神呢？好，要真是这样，我警告你千万别去敬神，你敬神的话，神会用雷劈你。为啥？你想啊，假如你敬神，神就保佑你，这是人可以理解的呀，这是明明就是人的表现嘛！只有你敬神反而被神揍一顿，才是人类无法理解的。所以啊，就算真有神佛存在，也万万不可搭理他们，否则无端招来一通空拳幻腿不理解脚，把你打得到处跑。
经过种种分析，灵魂应该是在混沌界中自生的，我们个个都是孙悟空。
大家都做过梦吧？梦中有什么特点？当然是光怪陆离、因果关系混乱。这或许是灵魂在睡梦中会进入初始化状态，也就是混沌状态。由此算来，任何生命的灵魂年龄都可达一万岁。
