大脑主要包括大脑、小脑、脑干和肝脑。在这里，大脑也称为单脑，是人体的司令部，管辖人体的身体活动、精神活动、感觉行为等。脑干和小脑位于枕骨的位置，脑干自上而下分为中脑、脑桥和延髓，脑干也被称为生命中枢，对人体至关重要。因为脑干具有管辖呼吸和循环的初级生命中枢。
其中大脑分为5个脑叶，分别是额叶、顶叶、颞叶、枕叶以及内侧面的岛叶。间脑分为上丘脑、下丘脑、后丘脑、背侧丘脑和底丘脑，背侧丘脑是一个重要的结构，是感觉传导路的重要中继站。颅脑包括颅骨和颅骨内的脑组织。颅骨由顶骨，颞骨，枕骨，额骨，以及颅底骨构成。颅骨构成的颅腔主要作用是保护脑组织。颅内的脑组织主要包括大脑，小脑，脑干。表面覆盖有软脑膜和硬脑膜，大脑分为左右两侧大脑半球，根据解剖位置又分为颞叶，枕叶，顶叶，额叶，各脑叶功能不尽相同。小脑也分左右半球。脑干分为延髓，脑桥和中脑三部分。颅脑磁共振可提供冠状位、矢状位和横位三维的图像，图像清晰度高，对人体没有放射性的损害，尤其是可以清楚的显示脑干、小脑及后颅窝的病变，颅脑磁共振平扫可以用于诊断脑梗死、脑炎、脑肿瘤、颅脑先天发育畸形、颅脑外伤等。
脑部磁共振动脉成像可以用于诊断颅内动脉的狭窄、动脉瘤、动静脉畸形等等。颅脑磁共振静脉成像，可以用于诊断静脉窦血栓或静脉窦的狭窄。磁共振增强扫描，可以用来显示肿瘤或炎症等病变。
磁共振磁敏感成像可以用来诊断微出血，磁共振弥散张量成像可以用来诊断各种神经纤维束的损伤，比如渐冻人症的运动神经纤维的损伤，可以用弥散张量的方式来诊断。弥散成像可以用来诊断急性脑梗死和脑肿瘤，而磁共振波谱分析可以用来诊断各种脑的肿瘤。
颅脑磁共振目前在临床上应用非常广泛，和头部CT相比较，对软组织分辨率更高，尤其是对脑梗塞的早期，诊断率是非常高的。颅脑磁共振检查结果如何阅读，主要还是要通过专业的影像科医生，以及临床医生进行解读。需要通过观察脑沟裂池，脑室是不是有明显的形态异常，脑实质是不是有异常的信号等进行判断。比如急性脑梗塞在t1wi呈低信号，t2wi呈高信号，在flair以及dwi上呈明显的高信号。而脑部肿瘤，在颅脑磁共振上会表现为，混杂在异常信号，同时出现病灶周围水肿。颅脑磁共振病变信号，相对来说是比较复杂的，必要时还是要结合磁共振增强扫描，才可以确定病变的具体性质。1.5T颅脑核磁共振平扫费用是468元，如果需要增强，一个月内做增强扫描费用是208元，增强还需造影剂，价格不等，200多至1000多不等，留置针留置贴及高压注射器费用约300元左右。颅脑核磁共振检查除了对急性期脑出血不敏感外，在其它颅脑疾病的诊断上都较其它影像学检查具有优势，分辨率高，可以观察病灶波谱分析成分变化情况来明确诊断。
