1856年9月,接到洪秀全“诛杨密诏”后,正在江西前线督师北王韦昌辉召集本部3000精兵,星夜兼程赶回天京勤王。在陈承瑢配合下,3000勤王军顺利进入京城,而后直奔东王府,手起刀落解决了杨秀清。次日,韦昌辉、秦日纲与傅学贤率领的东殿士兵在京城大战,双方互有胜负,战局呈现拉锯状态。为了铲除在京东殿势力,韦昌辉以“北燕受刑”为名,吸引东殿余党前来观刑,而后将其一网打尽,6000余东殿将士全部被杀。此后,韦昌辉继续搜捕东王余党,将事变扩大化,违背了之前与石达开约定,并得到天王同意的“只杀东王一人,及兄弟仨,其余皆不得多杀”之诺言。(《李秀成自述》中提到)
闻知天京事变扩大化,石达开心急如焚,于是带着曾锦谦、张遂谋等一起回到天京劝阻韦昌辉,希望他能就此罢手,不要滥杀无辜,便宜了清妖。谁知,韦昌辉杀红了眼,连石达开都要干掉;石达开逃跑后,韦昌辉派燕王秦日纲带兵追杀,追不上时,直接拿翼王府开刀,杀了全府2000余人。此时,韦昌辉还觉得不过瘾,于是又带兵围攻天王府,想捉拿洪秀全。谁知,天王府不好攻打,韦昌辉不但拿不下洪秀全,还被天王府数千女兵追击,反被捉拿归案,被大卸八块,首级送往宁国给石达开。到此,历时近三个月,死亡2万余人的天京事变终于告一段落,太平天国也元气大伤,由盛转衰。
根据李秀成《自述》,韦昌辉与洪秀全、石达开是战略同盟关系,一起合力对抗最大实力派,集政权、军权、教权于一身的东王杨秀清。自述中提起:“东、北、翼三人不和,北、翼二人同心,一怨於东,後被北王将东王杀害。原是北与翼王二人密议独杀东王一人,因东王,天王实信权托太重,过度要逼天王封其万岁。那时权柄皆在东王一人手上,不得不封,逼天王亲到东王府封其万岁。北翼两王不服,君臣不别,东欲专尊,後北与翼计杀东王。翼与北王密议,杀东一人,杀其兄弟三人,原清辅而已,除此以外,俱不得多杀。”由此可知,诛杀杨秀清是三人共同之约定,但不能殃及无辜,扩大事态。
既然如此,韦昌辉杀了杨秀清后,为何还有追杀石达开,围攻洪秀全,向自己的盟友下黑手呢?杀杨秀清好理解,这是三人之“协定”,也是“奉命”行事,而追杀石达开,围攻洪秀全,则难以理解了。对此,传统观点认为,地主阶级出身的北王韦昌辉是混进革命阵营的害虫,其恶劣之本质,必然会仇视革命,乃至破坏之。但是,仔细研究起来,此观点压根占不住脚,因为韦昌辉根本就不想扩大事态,他也想就此收手,平息事态。要知道,北王韦昌辉是太平天国最大的赞助商,没有他倾囊相助,金田起义搞不起来,他没必要毁了自己产业,毕竟自己是大股东之一。此外,弟弟韦俊受困武昌,形势不妙,此时扩大事态,对他又有什么好处呢?所以,韦昌辉追杀石达开,围攻洪秀全,应该另有原因,即是他非常无奈,被迫如此。
按照李秀成所说,诛杀杨秀清是洪、韦、石三人共同之协定,韦昌辉是“奉诏勤王”,讨伐乱臣贼子,清君侧。正因为有约在先,且接到密诏,所以韦昌辉才敢率3000兵马回京“勤王”,向最大实力派东殿开刀,否则自己一人动手,区区3000兵马,就算杀了杨秀清,但依然会被在京东殿势力干掉。可以说,韦昌辉对盟友洪秀全、石达开是相当信任,他相信杀了杨秀清后,洪秀全会发布圣旨,指责杨秀清罪名,承认事变合法性,为天京事变画上句号;石达开也会支持自己,站到同一条战线,威慑东王余党,让他们接受既成事实。可惜,韦昌辉错了,他成了枪手,本是“奉诏讨贼”,事变后,自己反而成了“贼”。
出于维护拜上帝教信仰以及削弱各大实力派之需要,洪秀全并未宣布享有“天父代言”的杨秀清罪名,承认事变合法性,而是坐山观虎斗,保持沉默。如此一来,韦昌辉处境相当被动,自己成了“贼”,是残杀东王杨秀清之主谋,成为众人攻击之对象,在京东殿势力必然会展开报复。事实的确如此,傅学贤、吉成子等东殿尚书看不到洪秀全诏令,立刻率兵与韦昌辉展开激战,北王差点撑不住,若不是秦日纲及时投入战斗,韦昌辉估计早挂了。没办法,东殿力量太强大了,为了自己安全,韦昌辉只好先下手为强,通过陈承瑢之手假传“北燕受刑”诏令,诱骗东王余党前来观刑,而后全部屠杀。
东王余党被杀后,若是洪秀全能“壮士断腕”,承认事变合法性,估计事情还有回旋之余地。可惜,洪秀全依然保持沉默,韦昌辉如同热锅上之蚂蚁,急得团团转,不知如何是好。此时,石达开从武昌前线赶回,韦昌辉很高兴,如同“久旱逢甘霖”,认为有盟友石达开支持,不怕天王不发诏书,承认事变合法性。俗话说得好,“希望越大失望也就越大”,这话用在韦昌辉身上相当合适。石达开下车伊始,直奔北王府,劈头盖脸指责韦昌辉滥杀无辜,“其何罪之有,安得如此滥杀,岂不便宜清妖”,还将杨辅清保护起来,公然站在东王余党立场,抛弃了自己盟友。这就有意思了,说好一起行动,石达开晚来也就算,此时还站在东王余党立场,让韦昌辉情何以堪?韦昌辉可以容忍石达开“来迟”,也不想知道“来迟”之原因,韦昌辉需要的立场,是支持,而不是对错,更不是指责。
无天王诏书,没石达开支持,韦昌辉彻底孤立,彻底绝望,自己现在就是太平天国的乱臣贼子,人人得而诛之。为此,韦昌辉只能先下手为强,派秦日纲追杀石达开(难不成让石达开带“靖难之师”回京杀了自己),而后屠戮翼王府,率军围攻洪秀全,希望能擒拿天王,达到“挟天子以令诸侯”之目的。可以说,韦昌辉也很无奈,他本不想毁了自己产业,可身不由己。