楔子
龙汉历一万三千年前，黄帝蚩尤大战，搅得人间不宁，混沌主宰天帝帝俊令应龙下界，助黄帝战蚩尤，蚩尤虽为兵主，又为十二祖巫之首，但是在面对应龙这个上古强者的存在的时候，败下阵来，被应龙斩下头颅，化为饕餮遁走，而黄帝依仗手中轩辕剑也是斩下刑天之首，葬于常羊山下，封印了起来。
本来以为天地就此安宁，但是十二祖巫之首蚩尤和刑天的折损，让其余祖巫心有不甘，虽心不甘，但是有鉴于女娲大神的态度，一直隐忍，后混沌妖师混鲲祖师，唆使火神与水神大战，一伤一亡，天塌地陷，女娲心惊自己创造人类会生灵涂炭，斩鰲足以立天，拿出混沌五色神石补天，才让天地重回安定，而女娲此时也是对混沌帝俊天帝心生不满，决意不插手天地之争，让其余九大祖巫决心与天帝一战。
毕竟当初混沌主宰帝俊与十二祖巫早有事先约定，三十三重天为混沌一族管辖，十九重地为十二祖巫属地，但是帝俊贸然插手地界争端，帝俊如此一来，不难看出其心早已打算将十二祖巫除去。
果然有一天十二祖巫后羿斩九金乌，报复帝俊杀父之仇，要说这后羿其父是何人？自然是那刑天，苦于后羿法力最弱，被帝俊斩于九幽之境，本以为九幽是那极阴之地，后羿可藏身，但是不想帝俊拼着多年修为，被极阴之地压制，竟将后羿斩杀。
由于十二祖巫之中，虽兵主蚩尤声望稳居第一，但是论修为最数烛九阴强大，无限接近与帝俊，传与东皇太一一个战斗级别，不过烛九阴却极为的低调一直随天地气运沉睡，却被这一场场变故惊醒，后被众祖巫说服，决意携众祖巫趁混沌天帝帝俊重伤，反攻妖庭。
这一场战争极为惨烈，帝俊深知自己重伤，很可能会遭倒众祖巫反扑，用记载着自己毕生修为的河图洛书，为阵眼，设大阵加持法力，以抵众祖巫疯狂攻击，携妖皇东皇太一，妖师混鲲祖师及众妖祖大战祖巫及巫祖。
一场战争下来，死伤无数，可是突然混鲲祖师背叛，趁帝俊和东皇太一不觉，私自将河图洛书抢去，逃遁而去，没有大阵加持，帝俊和东皇太一独战众祖巫，陷入了苦战，自知不敌，帝俊首当自爆，吞噬掉了水神共工等一众巫祖的肉身，东皇太一见身后一众妖祖死伤惨重，趁其余祖巫不察，将一丝法力注入了从三清手中抢夺而来的一枚菩提籽中，破开虚空将众妖祖及这枚菩提籽，送入山海境之中，隧自爆而亡。
实则此时女娲紧盯三清动向，却不想混沌妖族除了混鲲祖师这个叛徒，一气之下，将其擒拿，并将其封印在了混鲲祖师自己的小世界当中，也就是清明世界。
至于河图洛书，被女娲封印在了洛河之下，龙马龙龟之背，安天地定数，后十二祖巫只剩下重伤烛九阴，隐匿于黄河之下，滋养华夏龙脉，定九州乾坤。
后巫妖大劫之后，天地逐渐明朗，素有繁华人界、山海妖界、地陷魔界、九幽鬼界、被女娲和三清以法力结界所隔，以免大战再起，却不想被一个小道童，斩菩提再次引起了一场人、妖、魔之间的大战。
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