风云三部曲的故事结构是有许多雷同的地方的，我们先从故事情节入手
《风云一》的雄霸“一遇风云便化龙”，却又因“九霄龙吟惊天变”而利用孔慈挑拨风云二人的关系，其结果，步惊云得绝世好剑，风云变色，龙游浅水；《风云三》绝心处心积虑，挑拨神锋与易风的关系，利用易风，铸成败亡，夺四凶器欲成大邪王，但其结果败于武无敌之手。
二者皆急急如丧家之犬，夺路而走，雄霸终死于步惊云剑下，绝心为易风（败亡剑）算计而撕肉扒皮，这是大反派定位上的相似。
《风云一》，自从雄霸死后，步惊云逐因楚楚而淡化了戾气，隐居山村。其后东瀛强势入侵，步惊云在无名引导下担起拯救神州的重任；
《风云三》，绝心失踪后，易风因易老大而重回市井，重振易天赌坊。其后东瀛阴谋渗透，易风则因易老大伤逝，在圣王的主导下“被成邪王”。还有其他情节，如步惊云因仇恨而与无名的不断碰撞，易风因杀步天而引来“风急云怒”，步惊云之于无名，易风之于风云，都是共通点。
再对比主线的布置
《风云二》，一方面交代围绕在天皇遗骸上的神州与东瀛的争端，一方面以铁门怀氏兄弟展开中原新一代江湖，这两条线索——前者属于老一辈恩怨，后者属于后起之秀——彼此偶尔有交点，但又相互独立，在无名与皇影刀剑诀后汇集于一。
可这么说，《风云二》在经受了一段时间的考验后，终于摒弃了传承于《风云一》中门派恩仇与东瀛神州的世俗之争，而专心一志的编写玄幻情节的天门篇章。即便后来天皇之子欲夺龙元振兴日本皇权，也是围绕着“龙元”线索而展开的，依然同帝释天与四大瑞兽的保持一定的关联。
《风云三》从败亡剑篇后分为——以易风神锋为代表的新一代，以风云无名为首的老一辈——新老两代人的两条线索，终在绝心与风云血战的一招“天哭灭绝”下交汇，“大邪王”作为与“龙元”同样的标志物，贯穿全局。与《风云二》一样，这次“双线合流”也是一个小拐点，只不过，《风云二》是艳阳高照，《风云三》却是走向夕阳。
其后，圣王集“三桓七宿”破“九星藏龙穴”夺苍龙舍利，与帝释天东海屠龙夺元一役，无论是攻方还是守方，无论正面立场还是反面立场，又是重叠。最后《风云二》帝天灭，《风云三》圣王死，都死于雄心难酬，也是一一重复。但比起帝释天，圣王这个毫无资历与说服力的反派，只能是“拾人牙慧”的“盗版”罢了。
以事论事，马荣成在主编《风云二》时天下正处于巅峰期与稳定期，而《风云三》却碰上了天下公司的商业转型与几次人事变动。前者是专注自信，后者是分心忧虑。两个阶段，两种不同的心态，谁输谁赢，大家心中有数。《风云一》敢拼敢闯，《风云二》有资本尝试创新，而《风云三》只能“吃老本”了。
