风过留声，雁过留痕。对于潜伏在保密局南京站的中共地下党情报员李梅而言，在敌明我暗的斗争环境里，行动轨迹稍有不慎，就会被敌人嗅觉到蛛丝马迹。轻则成为敌人的嫌疑对象，遭受一轮又一轮试探与非人调查，重则直接暴露陷入万劫不复的深渊。
接到密报，将有共党在一家咖啡馆秘密接头，保密局南京站二科科长孙立德，早早在此布下陷阱，想要一举抓获前来接头的共党要犯。
对于保密局南京站的此次秘密抓捕行动毫无知情的李梅，正按约定的时间前去咖啡馆与中共地下党特派员接头，接受新的任务。但她所不知的是越靠近咖啡馆，面临的危险就越大。
当李梅推开咖啡馆的门时看到全是特务，他们乔装成客人或服务员时，内心大惊：此次行动已暴露，有埋伏！多年训练有素的特工经验让她面无改色地跟孙立德打招呼，心里却急速在盘算着：撤退已经是不可能，如何见机行事帮还未到的特派员脱离危险。此次秘密接头的情报是怎么泄露的？是哪个环节出了问题？组织内部出了内鬼？自己又如何脱身？
敌人的抓捕行动失败，中共特派员程光明在李梅的暗中帮助下顺利逃走。本想破获共党立大功的孙立德却是竹篮打水一场空，但他把怀疑的目光盯上了李梅，她为什么出现在咖啡馆？她是前来接头的共党吗？
尽管李梅在这次行动中头部受重伤，患了选择性失忆症。保密局胡站长对当晚行动李梅的出现也产生怀疑，这次秘密行动是他安插在共产党内部代号黑鹰的潜伏特务发来的绝密情报，此次任务他并没有安排她行动，她是怎么知道的？
侥幸逃脱的特派员程光明清楚：他此次前来的目的就是，他必须尽快与潜伏在南京站代号孤雁的地下党取得联系。找出并铲除潜伏在共党内部代号黑鹰的内奸，因为代号黑鹰的内奸对地下党组织的破坏力太强了，前不久因为黑鹰的出卖，共产党员林志华惨遭人暗杀，现在又是由于黑鹰的出卖，他的接头行动被敌人察觉，险些被抓。
摆在程光明面前的是困难重重，李梅已经失忆，怎么帮她恢复记忆与她联系上？自己已经在特务面前露过脸，满大街都是抓他的特务，身处险境行动步步受阻，怎么完成任务？
李梅虽然暂时性失忆，对自己的共党潜伏身份一无所知，但对孙立德秘密调查自己是共党嫌疑的事却针锋相对，极力洗清自己身上的嫌疑。
随着对李梅的深入调查，孙立德发现李梅的共党嫌疑越来越可疑，但苦于没有实证，不敢轻易对她下手。当孙立德再次发现特派员程光明的踪迹，在一家客栈将他抓获，并把程光明来不及烧毁的文件如获珍宝小心翼翼地收集，以为找到了李梅是共党嫌疑的突破口时。他不知道的是被抓的共党程光明，脸上露出了一丝诡异的笑容，难道他的被抓是他故意为之精心布下的局？
对于程光明的审讯出乎意料的顺利，经过一番斗智斗勇地较量，孙立德很快从程光明身上得到了口供：此次来南京所要执行的任务是与一个叫孤雁地下党取得联系，他不知道来咖啡馆接头人的底细，只知道她是一个女的。
所有的线索与矛头都指向的李梅，孙立德不再忌惮李梅父亲是国民党元老的深厚背景，对她直接动用各种酷刑，想要撬开她的嘴。然而事态的发展却不是他所预料的那样，李梅被释放出来，而他被停职调查，这到底是为什么。
嫌疑还没洗清的李梅频繁以审讯的名义接触程光明，似乎她的失忆症正在逐渐好转。难道程光明的悔过叛变是假的?他中计了……。
《孤雁》是由李辉执导，朱泳腾、程愫、程煜等主演的谍战剧，再现了解放战争时期我党优秀情报工作者的风貌。该剧无论是中共情报员佯装叛变设计让李梅的记忆复苏，一直被南京站胡站长一直暗中监控李梅几次险象环生窃取情报，还是与中央陆军大学战术教官高峰出生入死，擦出了爱情火花的剧情，都是在情节设置上的环环紧扣、跌宕起伏。而实力派演员程愫在《与狼共舞》中饰演反派人物梁海棠，演得特别好赢得一大批谍战迷人缘。在此剧中她演绎的是一位优秀地下党女性情报工作人员的潜伏斗争，也非常出彩为剧情增色不少。