分集介绍：
第1集 变种人克拉丽丝正在城中上下逃窜，躲避警方的追捕。自从变种人内战事件后，变种人便被普通人类看作是威胁，无论本身是好是坏，都一概要被关押起来。克拉丽丝因为自己变种人身份而入狱，心有不甘的她，利用自己空间转移的能力逃了狱。躲避追捕的变种人不只有她，还有洛娜和马可斯。在逃离时，变种人组织搜寻到克拉丽丝的踪迹，把她救到了墨西哥的变种人基地里。然而，洛娜却因为恋战而被人抓了。负责变种人案件的检察官里德·斯特拉克家里也发生了极不寻常的事。他家的小儿子安德鲁因为在学校被人欺凌，于是和棋子凯特琳来到学校，想要为儿子争取公道。当他在校长室，威胁校长尽快联系作出欺凌行为的学生家长时，一通电话把他叫回了工作岗位。洛娜站在他眼前的透明囚室内，不屑地看着他。里德看惯了变种人的伎俩，他崇尚以暴制暴的方式。他的以暴制暴不是指身体上的暴力，而是从心灵上，直接摧毁对方的意志，比如这次他拿出了一份医学检测，发现洛娜怀孕了，以此来击溃洛娜的意志。然而，对变种人深痛恶绝的里德，上天给他开了个玩笑。他的儿子安德鲁和女儿劳伦都是变种人。安德鲁被同学欺凌后，想跟姐姐一起到舞会好好疯一把，想发泄发泄。没想到冤家路窄，在舞会上，安德鲁再次遇见了欺凌自己的坏同学。恶霸同学因为欺凌安德鲁的事，被父母知道了，自然不会好过。现在看见安德鲁，他们绝不就此放过他，把他拉到储物间里想为早上的事进行复仇。害怕不已的安德鲁，精神近乎崩溃了，失去理智的他，唤醒了体内的潜能。突然，周围的墙壁、金属都随着安德鲁的尖叫而变形崩塌。舞会现场变得一片狼藉。劳伦看见安德鲁被人拖进了储物室，立即施展特殊能力放出屏障，想冲进储物室救出弟弟。在见到弟弟后，劳伦才发现弟弟不仅毫发无损，他还是造成事故的始作俑者。安德鲁和劳伦的变种人身份曝光后，立即引来特勤局的追捕。里德和凯特琳为了一双儿女，不得不摒弃之前对变种人的观念，带着安德鲁和劳伦去求助马可斯。马可斯表示可以帮助里德，但作为交换，他必须帮洛娜逃走。两人达成了共识，并展开行动。特勤局的队伍一刻也不让他们松懈，很快便锁定了马可斯和劳伦等人，并派出特殊的武器去抓捕他们。在千钧一发之际，克拉丽丝利用空间移动的方式转移了大家，里德却晚了一步，进不去新的空间。
第2集 一年前，斯特拉克一家正在保龄球馆享受着天伦之乐。彼时，劳伦已经发现了自己的变种人天赋，不时地悄悄使用，在游戏玩乐中作弊。离劳伦他们不远处，有一位变种人少女，因为能力失控，弄得自己的身体不断颤抖，遭到了一些顽皮小孩的嘲笑。越被嘲笑，情绪便越难控制，最终变种少女不小心释放了能力，在球馆造成了损坏。当时，专门处理变种人案件的里德不顾是非对错，直接就把变种少女“请”出了保龄球馆。风水轮流转，当日不管是非黑白，唯变种人是错的里德，今日竟然因为自己的变种人儿女，而被同事们抓了起来。另一边厢，由于克拉丽丝过度使用能力，现在神志不清。曾经是护士的凯特琳查看了她的情况，认为她的状态十分糟糕，必须立即送医。但变种人并没有医疗福利，尤其他们现在的逃犯身份，去医院根本是不可能的事。凯特琳虽然会一些急救知识，但巧妇难为无米之炊，没有药物和设备，她什么都做不了。克拉丽丝是为了救他们而受伤的，马可斯不能看着她死，于是让凯特琳跟自己一起去诊所里，把药物偷出来。马可斯把凯特琳带到一所偏僻的医疗机构，此处可以向变种人提供医疗服务。马可斯假装急病，直接跳过了资料登记的环节，来到了诊疗室。而凯特琳则假装是他的女朋友，一起混进诊所，再伪装成护士，在里面偷取药物和工具。特勤局的速度比他们想象中还快，不一会儿，追兵便找到诊所这儿来，两人只好立即逃回基地。这时，失去神智的克拉丽丝开始能力失控，一些空间的缺口开始在她身边出现，而连接的地方正是之前出事的街区。街区此时正被警方封锁起来，一批批的警员正在现场调查，空间缺口的出现简直就是送羊入虎口。劳伦利用自己操控空气的能力勉强把缺口关闭起来，但克拉丽丝的能力释放太多，劳伦招架不住，终究是被特种部队闯了进来。基地混入了一场激战，变种人组织暴露了，大伙儿在迎击的同时，必须开始做撤离计划。洛娜被关进一个变种人和普通人的监牢之中。每一个监牢都会出现一些团伙和头目，变种人被戴上屏蔽能力的跳蚤项圈后，大部分都不是普通人恶霸的对手。洛娜使用不了能力，一开始在监牢中被欺负得很惨。在放风时，狱犯的女头目想命令洛娜帮她干活，洛娜不畏强权所迫，施展浑身解数使出了能力，把头目教训了一下。然而她这个举动，却遭到单独禁闭的惩罚。克拉丽丝经过凯特琳的治疗，脱离了生命危险。而凯特琳和变种人们经历了一系列的事件后，开始对这些特殊的人种改观，她决定为了儿女，参与到这场抗争中来。里德被关起来后，特请局的人不断向他施压，甚至把他的老母亲带回来审问。在这行经验老道的里德决定振作起来，他知道特勤局的负责人走投无路，才这么对自己，他可以把知道的一切都说出来，作为交换条件，他必须走正常的法律流程。对方也不甘示弱，他可以答应里德，但他的目标，是摧毁变种人组织。
第3集 洛娜孤身一人被关押在监狱的独立房间中，回忆着三年前刚刚和马可斯恋爱时的片段，以此来获得心灵的慰藉。哨兵特勤处的杰西·特纳刚刚和里德谈好了条件，随后便来打扰洛娜难得的好心情，想最后给她一个合作的机会。然而，杰西的条件不仅不吸引，甚至让洛娜觉得有点侮辱。杰西告诉洛娜，如果合作的话，就送她去另一个监狱，但总比送去更糟糕的地方要好。洛娜深信着同伴们一定会来营救自己，对于出卖同伴的想法，她毫无意向。变种人地下组织正在策划着营救洛娜的行动。洛娜是因为救克拉丽丝而被抓的，因此克拉丽丝十分想帮忙，但她现在还不能完全控制自己的能力。平时能力发挥到最大时，是因为自己熟悉的场景、人物，又或者是遇到让自己恐惧的事而作出的应激反应。约翰想通过引导，让克拉丽丝靠自己去操控能力，但时间有限，其他小伙伴感到十分焦急。凯特琳在一旁观察着变种人们商量事情的手段，认为这样太暴力了。一向奉公守法的她认为美国是个法治社会，应该求助律师、有能力的政客让他们帮忙。她的提议刚说出来，便遭到了所有人的反对，包括儿子安迪。尽管很多人都认为她太过于天真，但凯特琳依旧一意孤行，她决定联系自己的弟弟丹尼，他在上流社会有不少人脉，希望能帮助自己。安迪和劳拉知道后，便陪母亲走这一趟。凯特琳已经很久没见丹尼了，大家没有花费太多时间寒暄，便直入主题。丹尼一早便对凯特琳的情况了解一二，他很快便表了态，不想趟进这摊浑水，这会影响他的仕途。此时，安迪和表亲被丹尼和凯特琳叫到房间里自己玩游戏了，三个孩子打打闹闹，劳拉突然在社交媒体上翻到了恶霸同学在安迪家门口写了侮辱性涂鸦的照片。安迪立即按捺不住自己的情绪，能力随即爆发，不小心在表亲的房间里造成了破坏。正当凯特琳意兴阑珊，想再劝劝丹尼时，附近街区的一些居民便围到了丹尼的家门前，要他把变种人交出来。原来安迪的表亲把安迪释放能力后差点弄坏的雕像拍照发了上网，这事便让附近的人知道了，凯特琳三人的行踪被发现了。安迪、劳拉只想逃命，但居民们却想把他们往死里打。地下组织的人知道这事后，约翰便立即去救凯特琳他们。然而对方十分凶残，变种人都不想闹出人命，他们都希望克拉丽丝能使用自己的能力，帮他们空间转移。约翰的女朋友为了尽快让克拉丽丝控制自己的能力，她把自己和约翰的记忆植入到克拉丽丝的脑海中。克拉丽丝一想到“男朋友约翰”正陷入危险，立即自如地使用能力，把大伙儿都移到另一个空间，逃过了居民们的追杀。里德答应杰西的条件后，便假装自己逃走了，来到马可斯之前带他进行接头的酒吧，先从酒保下手。此时，杰西把追踪器放在里德身上，一直监视着他的行动。里德顺利地混入了酒吧，这时，他遇到了一对变种人母女。这对母女的善良和纯真，让他再一次对变种人改观了。他突然觉得，可怕的并不是变种人，而是普通的人类。他不想害变种人，于是故意从酒保前往地下组织的车子上跳下来，阻挠杰西的追踪。
第4集 洛娜因为在狱中过于特立独行，且老是动坏脑筋想逃跑，不断被哨兵特勤处转移监房。这次的监房转移让她遇到了一位老熟人——害她被抓的里德。里德想跟洛娜好好谈一谈，因为这时的他已经不像以前那样讨厌变种人，但洛娜完全不买他的帐，反而听见他说连累了马可斯后，对他更加厌恶了。另一边厢，变种人地下组织正激烈地讨论该不该冒险救洛娜。有部分变种人认为这个行动太危险了，很可能不仅救不出洛娜，还把自己的命也搭进去。马可斯受不了自私的大家，于是把话摊开来说，告诉在座的人都欠洛娜一份人情，大家都或多或少接受过洛娜的帮助。约翰和他的女朋友索尼娅自然义不容辞地帮忙，而凯特琳知道里德和洛娜现在同坐一条船，于是也同意这次的营救计划。大部分变种人达成共识后，便开始商量营救的方式。虽然他们可以借助克拉丽丝空间瞬移的能力，但现在特勤局盯得十分严，要找到囚车把洛娜和里德移走，就必须知道他们的行进路线。为了得知准确的消息，马可斯不得不找回以前的损友——一个洗黑钱兼贩毒集团。马可斯回到一个肮脏混乱的夜场，想向老熟人求助。此时犯罪集团原来的老大已经退位，目前的负责人士马可斯的前女友卡门，以前老大的女儿。原本卡门对马可斯当年抛弃自己还有点怀恨在心，但想到马可斯的能力，便答应了这个交易。获知囚车的出现地点后，大伙儿还面临一个难题，就是要如何把囚车停下来，好让他们得手。劳拉知道后，立即告诉弟弟安迪，让他施展能力担起这个重任。里德在狱中，向洛娜坦白了一切，并为之前自己的所作所为作出惭愧。虽然里德之前犯下的过错无法挽回，但洛娜也明白里德之前也只是职责所在，于是默默地接受了与他结盟的事。与此同时，克拉丽丝脑海里不断浮现和约翰之间的回忆，她不知道这其实都是索尼娅的回忆，只是为了让她因为在意约翰而更好地施展能力。
第5集 变种人组织里应外合，成功地劫了囚车，把洛娜和里德救回变种人基地。然而特勤局并不是省油的灯，他们有先进的器材，还有一个替他们效命、叛变的变种人“脉冲”。里德到了变种人基地后，受到了大家的热烈“欢迎”。联络处的酒保一看见他便给了一拳，为之前里德在身上放追踪器，引来特勤局追踪的事报了仇。大伙儿现在毫不信任里德，里德也表示理解，这个心结必须由他自己去解开才行。因为里德之前的行为，让他在基地的去留问题产生了争议。如果大部分人都不同意他留下的话，就要由索尼娅用超能力去改变里德的记忆，让他忘记变种人基地的事。克拉丽丝此时和索尼娅在一起工作，她听见索尼娅的能力后，便想通了一件事。之前索尼娅为了让克拉丽丝奋不顾身地救约翰，在她脑海中植入了自己的记忆，让克拉丽丝以为自己和约翰是恋人。但克拉丽丝脑海深处却隐隐觉得不妥，在得知索尼娅的能力后，她认为自己的记忆可能被做了手脚。变种人组织通过监听特勤局的通讯设备，得知他们正在部署搜寻变种人基地，立即变得警觉起来。洛娜和马可斯此时正在外开着车替组织探风，一路上有说有笑，谈着属于两人的孩子，还有未来。前方不远处出现的特纳和一批特勤局特工打断了这场愉快的谈话，原本马克斯想绕路逃走，但洛娜却不依，她用超能力控制车子，正面驶向特纳面前，把其他特工都控制住后，便抓走了特纳。变种人组织现在又多了一条罪名——绑架特勤局探员。洛娜有此妄举，一来是为之前的事复仇，二来是想通过他去查探“脉冲”叛变的真相。如果特勤局做了什么手脚让变种人产生内讧，那后果将不堪设想。特纳被洛娜控制着，不得不面对洛娜的审问。在此期间，特纳把自己讨厌变种人的原因说了出来。原来在四年前的变种人大战中，他七岁的女儿格蕾丝在毁灭性的意外中无辜丧生，自此之后他便视所有变种人为仇敌。马可斯不禁同情特纳，但洛娜却道出了真相——在那次战争中，变种人的伤亡更为之惨重，他们其实不相伯仲。哈利在营救洛娜的行动中受了枪伤，凯特琳利用自己的护理知识，在加上儿女的配合，帮哈利做了手术，把他从鬼门关救了回来，获得了变种人们的信任。而里德为了补偿之前对变种人们犯下的过错，主动提出自己成为诱饵，走到街上把特勤局的人引到错误的方向。行动尚算成功，里德把特勤局的人引到错误的地点后，其他同伴便把特纳带到那里，外加索尼娅的能力把特纳的记忆改动了，这样便成功地把基地的位置隐藏起来。克拉丽丝对索尼娅的能力耿耿于怀，在行动后终于忍不住问她，到底自己和约翰的感情是不是真的。纸包不住火，索尼娅知道再瞒下去对大家都不好，只好把自己的苦衷告诉克拉丽丝。克拉丽丝知道后十分生气，认为索尼娅无视自己的感受，只会利用自己。特纳的记忆被改回了四年前，格蕾丝还在的日子。但他回到家后，想找自己的女儿，却被妻子告知了女儿已死的真相。听见真相后的特纳，对变种人的恨比以往更深了。
第6集 约翰想着四年前的往事，独自陷入了沉思。曾经事美国军人的他，冒着生命危险，为国前往伊拉克驻兵，然而回国后，不仅没有得到应有的重视，还因为他那变种人的身份，而遭到路人的谩骂。就在他向同伴诉苦时，突然间发生了一场爆炸，是变种人大战就此展开。变故之后，变种人从此沦为被追捕的对象，约翰连仅有的尊严——自由都失去了。克拉丽丝知道索尼娅改了自己的记忆后，心里一直耿耿于怀，她质问约翰到底心里是怎么想的，约翰回答得十分模棱两可。克拉丽丝本来心里对约翰就有好感，她问约翰，之前救自己的时候，是利用她的能力，把她当作万能开锁器，还是真心有为她着想。约翰的回答再一次让克拉丽丝伤透了心，约翰对克拉丽丝充满愧疚，却没有一丝情意。克拉丽丝一怒之下，离开了变种人地下基地。脉冲的叛变让变种人组织十分在意，特勤局有能力让他们产生内讧，这当中一定有什么秘密。里德在脉冲的手臂上纹了一个图案，他认出了这个图案在巴顿鲁日的联邦大楼中看见过。为了查明真相，他决定联手和马可斯一起去一趟巴顿鲁日，找出特勤局让变种人内讧的秘密。里德的儿子安德鲁表示想跟着一起去，他的能力可以助马可斯和爸爸一臂之力。三人结伴，坐上了一辆伪装成运输农产品的卡车，向巴顿鲁日出发。路上虽然遇到特勤局的临时检查，但三人合力，最后还是顺利到达了联邦大楼。他们成功潜入变种人对策负责人的办公室，把变种人的档案资料都拿到了手。然而，事情并未就此结束，特纳锲而不舍地追踪他们，根据蛛丝马迹，追到了巴顿鲁日。三人带着资料连忙逃跑，但在路上，特勤局火力全开，三人陷入了险境。就在千钧一发之际，劳拉突然施展了控制空气的超能力，帮马可斯三人的卡车挡走了全部攻击。里德和儿子安然无恙地回到了凯特琳身边，马可斯也回到了洛娜身边，美美地睡了一觉。然而，真正的战争现在才开始。特勤局让变种人叛变的真相尚未查清，克拉丽丝离开变种人组织后，去向不明。马可斯在结束了一连串的逃忙和战斗后，想着能平静一番，却接到了前女友、贩毒集团首领卡门的电话。卡门要求马可斯要还之前欠她的人情，她帮马可斯救了磁铁女，马可斯现在要替她办事，不然的话，卡门便把变种人组织的信息告诉特勤局。
第7集 马可斯之前为了救洛娜，不得不求助自己的前女友兼前雇主、现任毒贩头领卡门。过了一段时间安静的日子后，卡门一个电话，打破了马可斯和洛娜沉静而又幸福的夜晚。是时候还卡门一个人情了，纵使马可斯前白般不愿意，还是只能遵守诺言，帮卡门在警察追查的路上制造事故。劳拉来到地下变种人组织后，和一位叫韦斯的超能力者产生了感情。然而，里德却从之前在巴顿鲁日偷回来的变种人间谍资料中，发现有一个变种人的描述，跟韦斯非常相似，而且韦斯有不少犯罪前科。作为一名前执法人员，里德担心自己的女儿被欺骗了，非常焦急地想让女儿看清楚韦斯的真面目。然而自己并未确定韦斯是否就是档案中那名超能力者，劳拉再次对父亲的自以为是感到反感。司法部来了一名官员，找到特勤局特工特纳，就利用变种人实验一事质问特勤局。然而，特纳被司法部质问时，才意识到，原来特勤局被坎贝尔教授利用了。坎贝尔教授一直在用变种人做实验，然后把他们训练成间谍，混进变种人组织中，从内部瓦解变种人组织。这种做法并未获得政府认可，但特纳脑子一转，这其实也是一种瓦解变种人组织的好方法。坎贝尔教授似乎聊到特纳的意图，于是向他抛出了橄榄枝。马可斯不想让洛娜多想，于是谎称自己去玛丽埃塔的联合变种人组织地拿补给品。但洛娜给新人做训练后，还未见马可斯回来，于是打电话到玛丽埃塔，却发现马可斯根本没有去。洛娜瞬间又气又怒，她发现马可斯以前给贩毒集团工作时的守护项链不见后，便知道他的去向。她找了索尼亚一起，陪自己直接找到卡门那里，逼守卫讲出卡门和马可斯的去向。但马可斯已经跟卡门出去了，两人无功而返。司法部的官员给特勤局开了会议，斥责他们的做法，并打算终止第三方军事公司特拉斯克公司的合作。突然间，主持会议的官员七孔流血，表情痛苦，似是突然发病。特纳观察了在场的人，其中一名安保人员正看着痛苦不堪的官员，露出得意的笑容。坎贝尔训练出来的变种人已经渗入到特勤局了，这让特纳又惊喜又担忧。地下组织中，负责破解档案的变种人把档案都破解出来了。她发现了一个奇怪的地方，就是这些间谍变种人组织都不是来自政府，而是来自一个第三方军事公司，特拉斯克。里德对这个名字十分熟悉，他的父亲在这个公司做了半辈子的工作。
第8集 在1952年的英国伦敦，有一对变种人兄妹匿藏在这里。这对兄妹利用自己的异能力，在世界各地制造了多个大型的恐怖袭击，正在东躲西藏逃避国际刑警的追捕。里德看见特拉斯克这个公司名字后，发现自己的命运和变种人从一开始便似乎冥冥中有所关联。他的父亲在这个公司工作了35年，和自己从小聚少离多，关系不好。里德对妻子和儿女都称自己的父亲已经死了，其实不然，他的父亲奥托还活着，开着一个古董店安享晚年。约翰终于找到克拉丽丝，向她表示了歉意，劝她回变种人组织。克拉丽丝这时虽然对约翰还有抵触，但她想回自己以前待的地方看看。那里是一对好心的夫妇经营的地方，收养了很多变种人孤儿。然而，克拉丽丝回到旧时住处时，发现这里一片狼藉，还满地血迹。约翰通过现场重现的异能，看见这里被人搜查过，克拉丽丝的养父母也丧了命。经过一番追查，克拉丽丝还是找到了从旧处逃掉的变种人兄弟姐妹。他们被一位好心的牧师收留了，目前藏在永恒恩典教堂。就在地下组织打算去把这些同类人接回基地时，其中一位有读心术能力女孩指着一个妇女，说她的想法有点奇怪。果然，约翰他们靠近这位女性，对方便激烈反抗。大伙儿费了九牛二虎之力终于把她制服了。回到基地后，这位女性情绪失控，到处乱撞，状态还十分奇怪，想犯了毒瘾。档案显示，她叫克洛伊，因为自己的女儿被特勤局的人伤害，在反抗时造成了破坏，于是被带走了。凯特琳想起她这种犯毒瘾的现象，跟变种人被打了“基克”后的反应一样。“基克”是一种变种人毒品，能让变种人迅速变强，但会上瘾。可想而知，特拉斯克对克洛伊做了多么可怕的事。里德向家人坦白了一切后，便提出要亲自去找父亲谈谈，看看能不能在他口中问出些有用的情报。约翰则和里德结伴，陪他走这一趟。再次见到父亲，里德百感交集。里德把屈藏在心中多年的委屈倾诉出来，并把自己一对变种人儿女的情况告诉了父亲奥托。奥托听到这里，突然觉得应该让儿子知道真相，于是把他带了上楼。原来，里德的爷爷、姨婆，就是上世纪中时期，臭名昭著的变种人兄妹“芬利斯双子”——安德利亚·斯特拉克、安得利亚斯·斯特拉克。他们的能力和劳拉还有安迪的能力如出一辙。奥托本身也是变种人，但从父亲安德利亚手中逃脱了，自此之后便潜心研究克制变种人的基因X，希望减少变种人的危害。这时奥托坦言，里德本来也是变种人，但是奥托希望他能过正常人的生活，于是在他身上植入抑制基因。但那次，里德生病了，自此之后，奥托便觉得自己没有脸见儿子，于是断绝了往来。原来父子间多年的隔阂都是因为误会，里德顿时感慨命运是多么会捉弄人。父子相聚没过多久，坎贝尔教授便带着一队人马来到奥托的古董店外。此时，能屏蔽变种人能力的“脉冲”按照坎贝尔的命令，施展了能力，随后坎贝尔便带着搜查令，要求搜查奥托的房子。里德和约翰在二楼带着坐以待毙的心情，等着怎么去迎战，突然间，奥托不受“脉冲”的阻碍，施展了自己的能力。古董店瞬间产生了毁灭性的爆炸，坎贝尔也受了伤离去。大伙儿合力制服了克洛伊后，总算能在她垂死之际，让读心女孩把特拉斯克对她做的行为读了出来。特拉斯克公司对变种人做的的各种非人手段，实在让人毛骨悚然。
第9集 二十多年没有见面，再见竟是永别，父亲就在自己的眼前死去，里德一直久久不能释怀。他回到基地，把事情告诉了家人。妻子凯特琳听见里德说起自己的家族史，还有他的爷爷、姑奶奶的超能力和自己一对儿女的超能力一模一样后，不禁担心起来。更让凯特琳感到困惑的是，为什么里德没有遗传到超能力。里德思量了一下，决定把真相告诉凯特琳。里德本身也是超能力者，只是他父亲有意不让他认为自己拥有超能力。而且奥托为了阻止自己家族中的X基因，他穷尽一生研究X抑制因子，并在里德身上获得了成功。凯特琳知道真相后，似是责怪里德一直不把真相告诉她。凯特琳认为一家人不应该对彼此有所隐瞒，她决定把他们祖爷爷和祖姑奶奶的能力真相告诉安迪和劳拉。在父母的监护下，安迪和劳拉尝试拉手，重现他们祖先的能力。结果让安迪和劳拉大为震惊，他们两人的能力，一个聚合，一个分离，两人的能力结合，足以造成极端的毁坏。安迪和劳拉既开心又害怕，他们从未感受过如此强大的力量，但又很怕会伤害别人。读心术女孩埃斯梅被安置在变种人基地，但她似乎另有所图。她恳求基地的变种人能联合起来，帮她救走还被困在特拉斯克的其他变种人。起初洛娜和索尼娅都很抗拒这个提议，但埃斯梅似乎操控了洛娜的梦境，让洛娜看见，假如现在不出手，后果将会是变种人们被军队控制，她和马可斯的孩子将会有危险。最后，变种人组织决定接受埃斯梅的提议，开始部署特拉斯克的变种人营救计划。劳拉和安迪的能力非同寻常，在同伴们的劝说底下，凯特琳和里德同意让一双儿女参与这次行动。他们看准时机，先是克拉丽丝帮忙制造空间缺口，把安迪、劳拉和索尼娅和自己送进监狱，然后找机会弄坏电力安保设备，约翰、洛娜等人则在特拉斯克外围准备撤离的工作。然而，特纳很快便察觉到他们的闯入，随即带着武装部队和哨兵机器人去追赶几位闯入者。克拉丽丝和索尼娅先后被抓住了，安迪和劳拉只好落荒而逃。凯特琳和里德透过监控录像看见儿女被一群携带杀伤力武器的人追着，心里别提多担心了。姐弟两被追至穷途末路，这时，两人还剩最后一个自救方法——重现祖先“芬利斯双子”的超能力。安迪和劳拉手拉手，开始施展彼此的能力。就在两人看见了建筑分崩离析的景象时，安迪突然松开了手。他不希望这栋大厦的人会因为他俩的能力而死亡。特纳带着武装部队赶到了，把两人团团围住。
第10集 凯特琳和里德亲眼看着一对儿女被人活捉，别提多揪心了。劳拉、安迪、索尼娅和克拉丽丝被捉进特勤局的监狱后，变种人们纷纷为里德和凯特琳出谋划策，但组织中有些反对的声音，不想插手这家族的事情。热心的马可斯自然是救人行动的主力军，但洛娜怀着孩子，她不想马可斯因为救人而把自己搭进去，无论是为了她自己好，还是为了腹中儿好。刚刚被组织救回基地的读心术女孩埃斯梅，看见特拉斯克的负责人坎贝尔博士似乎想对安迪他们出手，正派人前往特勤局。埃斯梅知道安迪他们去到特拉斯克便会被当成白老鼠般的实验对象，但凯特琳和里德在埃斯梅的劝说下，试着去求助特纳。特纳虽然是特勤局的人，现在也因丧女之痛而对变种人怀有私仇，但在里德心目中他是目前唯一靠得住，能合作的人。在捉回来的变种人中，特纳尤其讨厌索妮亚，因为她夺走了自己关于女儿离世前的记忆。就在特纳打算寻求方法逼索妮亚把记忆还给自己时，坎贝尔博士的人便来到特勤局，把几名变种人带走了。安迪等人来到特拉斯克公司，他和姐姐劳拉便被关在一个奇怪的实验室，而索妮亚和克拉丽丝则被关在另一个地方。坎贝尔博士知道这对姐弟的能力，对他们十分感兴趣，加上他们家族的基因，因此要对他俩进行特殊的实验，要求他们在封闭的实验室中重现芬里斯双子的能力。安迪和克拉丽丝起初想反抗，但道高一尺魔高一丈，坎贝尔博士透过屏幕，在他们面前开枪打死了索妮亚。姐弟俩忍无可忍，终于牵了手。一瞬间，被设计得毫无破绽的实验室被扭开了一大块，而外面的办公室也遭到了损毁。虽然两人还未能破坏实验室，但他们的能力足以让坎贝尔叹为观止。凯特琳和里德劝服了特纳帮忙，特纳派了一队特勤局的人员，以非法实验的名义，把安迪他们带走了。洛娜见状，也不说什么，于是让马可斯按自己的想法行事。变种人组织主动了一队人马，埃斯梅也跟着前去。凯特琳和里德在组织中和后援人员聊天时，发现了埃斯梅的谎言。大伙儿一直以为凯特琳和里德去找特纳帮忙是自己的想法，没想到是埃斯梅的提议。与此同时，在特勤局押送犯人的行车路线中进行埋伏，也是埃斯梅的提议。原来埃斯梅并不是真心想帮马可斯他们，因为她自己有想救的人。她要救的人，是自己的另外两位姐妹。三人的力量，不仅仅是读心术，还能控制别人的思维。三人聚在一齐，立即控制了特勤局的特工们，让他们自相残杀。在囚车中的变种人们，包括劳拉、安迪，看见眼前景象后都傻了眼。埃斯梅杀了许多的普通人，连坎贝尔也不例外。
第11集 在埃斯梅的介入之下，变种人们摆脱了特勤局的控制。尽管他们重获自由，但对埃斯梅三胞胎并无太多感激之情。因为她们造成的伤亡太惨重了，哪怕那些是敌人，但他们很多也只是为了工作，罪不至死。这次的事件，让里德好不容易争取回来特纳的信任，再次瓦解了。特勤局方面，在特纳的主持下，给命丧埃斯梅只手的特工们都给予了厚葬。变种人基地的成员也陷入了一片愁云惨雾，自从世界大规模地屠杀变种人后，他们的成员便一直在减少，每天都在提心吊胆地活着。这次的事件，索尼娅牺牲了，约翰在人前强忍悲痛，自己独处时，悲伤一发不可收拾，男儿泪流之不尽。克拉丽丝看在眼里，为他感到难过和惋惜。这次的袭击，埃斯梅三胞胎早有预谋。她们回到自己的组织，地狱火俱乐部，和接头人会面。地狱火俱乐部是历史悠久的一个组织，成员都是一些有社会地位的变种人。作为变种人，地狱火俱乐部一直密谋着与普通人类进行对抗，但他们和地下基地的成员不一样，他们采取的方式，往往更凶残，更极端。埃斯梅这次的任务，是拉拢历史上有名望的变种人家族与俱乐部结盟，比如劳拉和安迪。很多人都猜出了埃斯梅的心思，并知道她们背后有强大的势力。渐渐地，地下基地变产生了两个持有不同观点的派别。一方认为埃斯梅另有所图，另一方面则强烈要求与埃斯梅合作，保住基地。地下基地人心各异，这次的事件，安迪和劳拉有不可推卸的责任，斯特拉克一家决定暂时离开基地，寻找其他自卫的方法。劳拉把家人带到费尔伯恩职业学院，她的男朋友韦斯在此处进行接应。劳拉与韦斯分隔多日，刚见面便如胶似漆。里德看见女儿的脸上出现了久未绽放的笑容，也不再对韦斯有所偏见，认为只要女儿快乐，其他事都可以放在一旁。地狱火俱乐部的高层催促埃斯梅尽快完成拉拢重要盟友的事情，三胞胎别分别找到安迪和洛娜，劝说他们作为代表，加入自己的阵营。洛娜对埃斯梅怀有戒心，但心底里却是希望寻找有实力的盟友，对抗特勤局和实验室的人。埃斯梅为了劝说洛娜，把她一直三缄其口的身世拿出来谈。原来洛娜的父亲是变种人名门，不仅是地狱火俱乐部的成员，还是一位出色的领军人物。洛娜自从怀孕后，她的能力变越发地出众，她体内流着深厚的变种人基因血脉，维护变种人，是她的使命。特纳不知从哪里收到变种人基地的消息，带上一支拥有高科技和大量被驯化的变种人军团，一起攻打了变种人基地。大伙儿又得一边逃跑一边对抗，流离失所。就在大伙儿被特勤局的人追杀时，安迪他们和马可斯汇合后，便一起逃跑，突然间，安迪听见了一个声音，随便让大家跟着他指去的方向逃跑。事已至此，大家被逼进末路，只好信任安迪。果然，埃斯梅早已控制了特勤局的人的思想，在路上挟持了车辆，带大家撤离。大伙儿再一次欠了埃斯梅的人情，但他们不知道，这一切都是埃斯梅计划之内的事。
第12集 埃斯梅三姐妹再次介入特勤局和变种人基地之间的冲突，让基地的同伴们，产生了意见的分歧。有人意识到普通人类世界要把他们赶尽杀绝，他们必须奋起对抗才能生存。另一派的人却认为过激的反抗只会让双方的关系越演越烈，只有通过和平的解决方法，才能让双方在地球上和谐共存。洛娜、安迪听了埃斯梅对地狱火俱乐部的介绍后，虽然对这三姐妹有所顾忌，但这个强大神秘的组织，对他们有着致命的吸引力。最近的几场冲突，在人类社会一石激起千层浪。在坎贝尔教授的推动下，夏洛特市即将举行一场名为“人类权益峰会”，实为探讨对变种人赶尽杀绝的集会。会议上，众多政要、富豪都会出席，他们这次不分肤色、不分阶层，只为同一个目的，为了自己的种族而去灭绝另一个种族。基地的同伴们收到这个消息后，决定采取行动。他们认为里德的父亲奥托研究了抑制X基因的课题这么久，一定有一些具有价值的东西。就在斯特拉克一家努力回想家里发生的事时，坎贝尔教授也跟他们想着一样的东西。里德的母亲被坎贝尔盯上了，大伙儿发现时，里德他们立即赶去。在向老母亲解释一番后，总算让老母亲了解清楚奥托的所作所为，还有里德、安迪和劳拉的真正身世。然而特勤局并未仁慈地让这家人多享受一会儿天伦之乐，很快，他们便追到保险公司门口。自从索尼娅死后，安迪便恨透了特勤局，他觉得索尼娅的死是自己的错，如果那天他和劳拉施展能力，那么索尼娅就不用死。特勤局的人追来时，安迪对他们下了狠手，幸得劳拉及时阻止并拉走他，才没有让无辜的特勤局职员丧命。另一边厢，洛娜和埃斯梅还有约翰、克拉丽丝他们结伴，先是利用超能力挟持了一名拥有参会资格但行动不便的富翁，让他以换保镖的方法，把洛娜和埃斯梅换走原来的保镖，让他们混进会场。这位目标富翁是曾经参与了折磨变种人的实验，埃斯梅对他恨之入骨，在达成目的后，打算痛下狠手，可是被克拉丽丝阻止了。克拉丽丝看在眼里，觉得埃斯梅即使帮助变种人组织，但她跟大伙儿不是一路的。里德一家依依不舍地和老母亲分别，离别时，老母亲告诉了里德他们一个重要的消息，就是奥托曾经和一位叫玛德琳的旧同事经常联系，找到她可能会获取一些有用的资料。洛娜他们混进会议后，在会场里制造了混乱。特勤局的人毫不留情，约翰在一片混乱中受了伤。变种人的闯入并未让坎贝尔受挫，反而让更多的政要富豪看见了变种人的残暴，让双方的关系更加紧张了。
第13集 对于安迪来说，索尼娅就如良师益友，但他本来有能力救走索尼娅，却眼白白地看着这位良师益友就此被打死。安迪心中压抑着太多的愤怒却无从发泄，渐渐地，他的心理产生了变化。之前的几次事件，劳拉和安迪也起了不少冲突，突然间，劳拉觉得弟弟越来越陌生，甚至有点可怕。特纳这时调用了新的“猎犬”，两名擅长跟踪的变种人。特勤局局长这时也因为人类权益峰会遇袭一事，给特纳施压。幸好，两位“猎犬”并未让特纳失望，不一会儿，便通过情景再现和线索跟踪，找到了变种人基地目前的位置。经历了许多事件后，洛娜几乎总是在九死一生的边缘上行走。自从怀孕后，她觉得自己的能力越来越强，加上埃斯梅老是在她身边吹耳边风，提起她的父亲，她的能力，还有人类以前对她的折磨。她爱着马可斯，爱着他们的孩子，也正因为如此，她意识到，只有反抗，才能让自己的孩子生存下去。坎贝尔教授和华盛顿议员遇袭后，便转移地点，继续协商着扩展对抗变种人的项目计划。殊不知，他们的性命早已危在旦夕。马可斯和约翰发现洛娜不见了，他们质问了埃斯梅几句后，便瞬间明白了。洛娜和埃斯梅的另外两个姐妹已经在赶往机场的路上了。特纳带着特勤局和“猎犬”对变种人基地发起了猛烈的进攻。大伙儿立即鸡飞狗走地东躲西藏，里德和凯特琳身为普通人类，却没有贪生怕死，而是积极地疏散大伙儿，还出谋划策，为大家寻找新的出口。变种人们能力各异，但只要他们通力合作，便很容易就创造出新的出口。然而特勤局和“猎犬”也不是省油的灯，他们的速度慢慢赶上了基地的变种人，眼看就快要追上了。安迪和劳拉看着身后的追兵，他们作出了一个决定。里德、凯特琳和其他变种人尽快远离基地建筑物，安迪和劳拉在特勤局始料未及之时，牵着手，家族天赋帮他们毁灭了一整座建筑物。被毁灭的除了建筑物，还有“猎犬”们，和特勤局的精英。马可斯他们好不容易追上洛娜，可是洛娜心意已决，她使尽全力，载着议员和坎贝尔的飞机在他们头顶炸开了。特纳失去了众多手足，但换来的却是局长的一阵谩骂，说他没有尽职尽责。这么多特勤局职员的性命，抵不过权贵们的名誉和权术游戏。特纳恨着变种人，可是他累了。把证件在桌面上一搁，他就此离开自己一直坚守的岗位。洛娜回到了变种人基地，可是她没打算留下。她回来是为了召集和自己有共同想法的变种人，劳拉、克拉丽丝看着洛娜，都感到不可思议。可是在组织中，有不少人走向了洛娜，决定追寻那种以暴制暴的生存方式。安迪在是其中之一，他以自己的能力，对家人说不。变种人和普通人类之间新一轮的战役，就此开启。（本季终）
