《盲探》讲述的是女警察阿彤(郑秀文饰)因为好友小敏的失踪而一直有心结，而从上个世纪90年代开始，每年香港都会有一名少女无故失踪从此找不到踪影，面对好友似乎卷入了这宗多年未破的离奇案件，毫无头绪的阿彤无能为力。终于在一次通渠水伤人案中，阿彤认识了前“破案之神”阿庄(刘德华饰)，阿庄在之前一次执行任务中发生意外导致失明，已提前退休。阿彤发现阿庄虽然眼睛看不见，但听觉和嗅觉却加倍的灵敏，“破案之神”的能力犹在，于是请求阿庄协助她一同追查小敏的去向[5]。剧中阿庄一共破了6个案子，分别是通渠水伤人案、殓尸房杀人案、大脚劫匪案、出租车司机连环杀人案、小敏失踪案、小敏祖孙三代情杀案。同时，阿庄也向阿彤展现了自己独特的破案风格——通过多次自导自演来还原犯罪现场，再加以想象作出判断。
何家彤找到阿祖问小敏的事情，阿祖否认认识小敏，引起了两个人的怀疑。对阿祖进行了监视，发现阿祖与搭档的老婆及铁板烧的女经理有婚外情，两人的奸情也被阿祖怀孕的老婆和搭档合伙抓住了。在混乱中阿祖和搭档从二楼掉了下去，并都受伤了，在医院内阿祖承认与小敏曾经拍拖过，但是没有杀害小敏，在他移民巴西的那天晚上，小敏追车追了几条街，从司徒法宝整理的的士司机资料中，庄士敦决定到元朗进行调查陈广。在元朗，庄士敦和何家彤找到了陈广，但是陈广变的精神失常，只穿了一条女式网球裙和一双女式运动鞋，家里到处都是女性衣物，还带着两人找曾经被他杀害的人的白骨，何家彤将陈广铐住，精神失常的陈广突然袭击了何家彤，并将其打伤。小庄捡起手枪将陈光击毙，把重伤的何家彤送到了医院。
小庄独自去珠海找阿祖，只看到了阿祖的老婆，小庄对阿祖的老婆讲了他的推论：小敏害怕再也见不到阿祖，通过躲到阿祖家的柜子里被运到了巴西，改名换姓追到了阿祖并结婚，阿祖的老婆听到庄士敦的所讲非常的伤心，此时何家彤担心小庄被害离开医院跑到了珠海。小庄无意中踩到了地上的血迹，原来阿祖和铁板烧的经理都已经被小敏杀害了。小庄故作淡定想要离开，小敏突然间肚子阵痛，在庄士敦要帮助她的时候拿刀刺伤了小庄，何家彤及时赶到救了庄士敦，也知道了阿祖的老婆就是小敏，帮助小敏生下了一名女婴，小敏因为难产死亡。
多年之后，小庄和何家彤结婚了，小敏的女儿也在两人的抚养下长大。