要问到团藏哪些地方最可恶？很多人都会说到他自私，卑鄙，崇尚个人权利，对木叶只是表面上的忠心，其实最根本的目的就是想当上火影。他私自笼络自己的势力，在木叶危难的时候，想到的是如何自保。而且团藏暗中派人对鸣人和佐助都进行过监视，在五影会谈的时候，还暗中拉拢控制三船，曾经还想利用半藏的手，除去最初的晓组织。
从政治者的角度来看，这样的做法一定程度上是为了村子的安危，特别是宇智波的灭族，虽然事情做得干净利落，手段也比较狠辣，但是团藏终究给人留下了不光彩的形象。如果说这些勉强算作是团藏的罪孽的话，其实他的罪孽还远不止这些。因为团藏是一个很自私的人，要想达到自己的目的，就要用一些非常的手段。他为了以后的成功，精心培养了许多部下，还特别成立了根组织。
作为团藏的属下，很多都是从小就跟在他的身边。要想成为精英，很多时候甚至要冒着付出生命的危险，就算活下来也要变成一具行尸走肉，没有自己的感情。佐井就是一个例子，其实在根里面还有很多像他这样的人。他们的感情从小就被团藏禁锢住了，变得只有理性，没有情感。
不仅如此，团藏手下有许多特殊能力的人，有的甚至是利用活体实验培养出来的。就比如大和，团战不仅对于宇智波的写轮眼十分感兴趣，当然，对于千手柱间的力量，他同样也不会放过。所以他也想拥有这样的能力，为自己所用。但是他一个人无法做到这一点，那么他就还有另外一个帮凶大蛇丸。
可是要培养一个像大和这样的人，需要牺牲很多无辜小孩的生命，因为实验总是要失败很多次才会有成功。但这些罪过终归要归结在团藏的身上。有了团藏的支持，大蛇丸才能够大胆地做这些实验。而且团藏为了得到最大的利益，基本上调用了身边可以调用的一切资源。包括木叶的孤儿院，他也没有放过，这里面全是一些妇女儿童。
但正是因为这些妇孺，是作为间谍最好的材料，所以，在团藏的威逼之下，他们也被迫得充当起了木叶的间谍。比如孤儿院的院长野乃宇，就被迫当起了间谍，最后还死在了自己曾经抚养的孩子兜的手下。而兜也因为杀死了自己曾经最亲近的人，最后变得迷失自我。
最后团藏没能够逃过佐助的复仇，不知道他在临死之前所做的挣扎是出于正义还是自己极度膨胀的野心。但是在他死之后，根的残余势力仍然存在。团藏的余党仍然在秘密地筹划着一些阴谋，他们曾搞出了一个牛头天王计划，想要在自己失败的时候，能够拉木叶下水，因此苋瑾差点成为了牺牲品，不过最后她总算没有因此成为受害者。可见，团藏在死后，他的罪孽仍然在延续。