《如懿传》因为过审原因，删减了不少的内容。此前网上有传闻，起初发布的版本是99集，而最终是87集，足足删减了12集。实际上剧情并不是“拦腰斩”，而是从第一集开始过滤，将不合适的镜头，情节给删改了。
1.血腥镜头
《如懿传》原著中有较多残酷的宫刑，例如如懿处置阿箬用的“猫刑”，还有官加贴；海兰被诬陷偷红萝碳时被抽脚心，还有待播情节中较多诸如此类的刑罚全都被删减了，所以有些情节看着有点不连贯。
例如海兰被接到延禧宫的时候，太医说她的脚受重伤，恢复很难，经过删减没看过原著的观众就不知道她的脚到底怎么回事。而在之前发布的预告片中就能看到海兰的脚被抽打的镜头。然后阿箬被处死的情节也没有，后来阿箬棺材“冒鬼火”和延禧宫“闹鬼”的情节，也删改的较为突兀。
2. “黑暗”人格
后宫剧将人性无限的放大，这也是难以过审的理由。至今为止剧中没有详细说明导致二阿哥死掉的芦花到底从何而来。太医说如果永琏能熬到第二年夏天便能好转，而海兰对纯妃说：”倘若熬不过，也就算是天命，对吗？“此时的海兰已经决心复仇，所以这句话本来是一种很明显的铺垫。还有素练回去的时候让莲心自己一个人看着二阿哥，然后当晚二阿哥就毙命了。
看过原著的都知道永琏的芦花是海兰跟纯妃做的，莲心因为憎恨皇后将自己献给王钦对食而将芦花放出，直接导致了二阿哥的死。这些“冤冤相报“在电视剧中全都没有透露，删减的只剩海兰的铺垫，还有莲心最后看皇后哭丧时的意味深长的眼神。[page]
对没有看过原著的而言，自然看的云里雾里，实际观剧体验就差了一些。但也没有办法，害死小孩子这样的剧情影视化确实不太好，互相陷害也就罢了，稚子无辜啊。而后面还有很多魏嬿婉和金玉妍等人残害皇嗣的情节，应该都会被删减。
3. 敏感情节
看过原著的读者在论坛或者贴吧内都会称乾隆为“渣龙”，他在小说里的所作所为影视化影响会很不好，被人说是“诋毁乾隆”。诚然，如果作为网络小说来讲，你这样去杜撰是无可厚非的，但是如果将其影视化传播意义就不同了，再怎么样也还是要尊重历史啊。所以关于乾隆的情节，不仅做出了删减，实际拍摄很多情节也做出了改动。
原著中敏感情节很多，比如受到慎刑司酷刑后的状态小说描写的让人起鸡皮疙瘩；小说中的一些香艳情节，比如嬿婉用鹿血酒秽乱宫闱等；乾隆因为国家大事跟如懿争吵的一些台词，这些剧版都会改动或者删减。
因为《如懿传》太长，情节不可能一一都罗列出来跟电视剧对比。但目前应审核要求，《如懿传》已经呈现给我们最好的状态了。那些残酷的，不好的情节不看也罢，小说一些情节读着都觉得不适，倘若影视化你能受得了吗？本来改编小说作品就是要取其精华去其糟粕，毕竟我们还是要助长正能量的。