42集：
郑伟找到了医院，终于等到给先先送饭的刘苗，甜言蜜语地让刘苗给他筹一点钱。刘苗没地方筹钱给郑伟，郑伟于是游说刘苗，让她跟自己一起去南方开夫妻店，并说明刘苗这么好的身材和脸蛋，不应该回老家去埋没了。刘苗对郑伟的话心动了，她答应郑伟再想想办法，然后便去给先先送饭。
李东海和刘国林的家属因为不懂输液的情况，直觉地认为糖尿病人不能输葡萄糖，所以两位家属便大喊大叫地把医生给叫来了。何建一知道家属的担忧，便替他们解释了一下，然后继续巡房，没想到意外得知晓晓的妈妈，当日看到江晓琪救赵老师的过程，于是让海洋留下晓晓妈妈的联系方式，自己则去找江晓琪，为自己那天怀疑江晓琪的事情道歉。
秦宇宁回到家中，看到郑岚拿着相框躺在沙发上，便过去把相框拿走，没想到郑岚的手一下子就掉了下来，秦宇宁这才知道妈妈自杀了。秦宇宁看到妈妈自杀，不知道怎么办才好，只能打电话给江晓琪。江晓琪知道郑岚过世，马上去秦宇宁家里，因为匆忙她连手机也没有带上，让何建一没办法找到她。郑岚留下了一封遗书，说明当年着火的事情是意外，而她当年却一心想把科研资料带出火场，等发现江晓琪父母的时候，已经来不及救他们了，所以因为内疚收养了江晓琪。
赵蕾去监狱看方志军，方志军非常后悔地跟赵蕾说了一些关心的话语，让赵蕾如果不想在医院继续工作，就去国外陪儿子。赵蕾告诉方志军，她这一辈子都在别人的照顾下生活，这一次是她第一次独立面对生活，她会试着重新开始的。方志军听到赵蕾的话很是欣慰，他鼓励赵蕾坚强，让赵蕾下次把离婚协议带来给他签，这是他欠赵蕾的。
急诊科送来了一对出车祸的男女亮亮和芳芳，据送来的救护同志说明，亮亮和芳芳是在车里亲热，被大货车给撞了。芳芳被送来之时，就一直开始嚎叫，等海洋来给她检查之时，她便一直吵着要告亮亮强奸。何建一让海洋先不管其他的事情，要对患者先进行检查，处理患者的伤口为先。亮亮妈妈知道儿子受伤，马上就急着到医院看儿子，看到儿子没事亮亮妈妈很放心，听到何建一说有别的受伤女孩，亮亮妈妈也答应一起出医药费。
何建一在给亮亮妈妈说情况的时候，也把芳芳要告亮亮强奸的事情告诉亮亮妈妈，亮亮妈妈一听马上伸手进包里放特别的音乐，示意亮亮装晕想借此脱身。亮亮晕倒，何建一便把亮亮妈妈叫走，然后给亮亮注射一半的镇定剂，让他可以先休息一下等警察来录口供。亮亮妈妈一直吵着亮亮的情况很严重，何建一早就识穿了他装晕的事情，只是不想明言，所以一点也没有理会亮亮妈妈的话。
江晓琪向院长递交了辞职信，可院长却拒绝接受她的辞职，用心挽留江晓琪，让江晓琪先去散心一段时间，他等着江晓琪随时归来。郑伟为了拿到钱，再一次跟刘苗七保证八发誓的，让刘苗一定要从先先那里拿钱，跟他一起远走高飞。刘苗听信了郑伟的话，去求先先借钱，可先先必须让刘苗说出借钱的原因，才肯把钱给她。刘苗求着先先借钱又不肯说原因，先先马上就明白刘苗是为了帮郑伟，于是让刘苗打电话报警，可刘苗却因为郑伟对她有救命之恩，就是不肯报警抓郑伟。
就在刘苗求先先放过郑伟之时，郑伟拿着刀进了病房，逼着先先拿钱给他，先先身上有伤又有刘苗在场，他不得不把钱包里的钱给先先。先先拿到钱，就拉着刘苗离开，没想到一转身就被经过的魏宏伟给认出来了。魏宏伟叫了一声郑伟，郑伟马上就拿刀挟持刘苗，逼魏宏伟扔掉枪，刘凯为了救刘苗只能把枪踢过去给郑伟。
刘苗被郑伟割伤晕倒，郑伟便扔下刘苗捡起了枪，而这时有一名保安正想接近之时，被郑伟开了一枪。郑伟开枪之后，就躲进了亮亮所在的那个检查室，将亮亮妈妈给赶了出去，将自己关在里面。
43集：
郑伟挟持了亮亮，魏宏伟只能呼叫上级救援，很快医院就被警察给包围了。郑伟逃不出检察室，正好亮亮的镇定剂药性已过醒了过来，成了郑伟利用的人质。魏宏伟通过电话，想跟郑伟谈判，可郑伟却扬言再不放他走，他就杀死亮亮。
亮亮妈妈因为儿子被挟持非常的担心，一直求魏宏伟想办法救亮亮，何建一突然想到了亮亮妈妈与亮亮的信号，于是让她再使用一次信号让亮亮装晕。亮亮听到信号，照着以前的剧本演戏，晕倒在地上，让郑伟吓得不知所措，只能叫医院进去。
何建一以主治医生的身份进入检查室，检查了亮亮之后便将亮亮扶去窗户边坐下，然后不顾郑伟的反对打开了窗帘。窗帘被打开之际，郑伟被亮光反射，还不知所措之际，就直接被警察给击毙了，而他在临死之前不小心开了枪，正好打中了何建一。
江晓琪听到枪声被吓坏了，等警察破开门之后，她马上冲进去见何建一，可见到的却是中枪晕倒的何建一。何建一进手术室抢救的时候，亮亮妈妈则在想办法将亮亮留在医院，想让亮亮摆脱警察的调查，为此她把没有办成事的张律师给大骂一顿。殷翔给亮亮拿来出院遗嘱，亮亮妈妈于是跟她理论起，要让亮亮继续留在医院的事情，殷翔不肯答应也被亮亮妈妈给骂了，她只好把遗嘱交给警察。
张律师说明，一切证据证明芳芳是被亮亮强奸的，他也无能为力，亮亮妈妈一时生气便将他给炒了。张律师离开之后，亮亮因为何建一拼死救他的事情，想通了许多事情，发现自己以前做得太错，所以他想坦然面对这一次的事情，等他日出来可以重新做人。亮亮的话，让亮亮妈妈再没有理由阻拦儿子，只能心疼地看着儿子被警察给带走。
何建一做了手术，取出了子弹捡回一条命，亮亮感激何建一的救命之恩，便跟魏宏伟要求，在离开医院之时，必须见上何建一一面，好感谢他的救命之恩，让他相信自己也会改邪归正重新做人。刘苗醒过来之后，刘凯非常生气地就给了刘苗一巴掌，怪刘苗把郑伟带到医院来，还害得何建一受伤。刘苗被刘凯一打，什么也辩解不了，只能一个劲地哭个不停，加上刘凯因为她而差点当不成医生，就让她哭得更大声了。
院长来看何建一，何建一才知道江晓琪辞职要去美国，他只能不停地道歉，为自己不相信江晓琪的事情道歉，还借着自己的伤逼江晓琪心软，求江晓琪留下不要去美国。江晓琪经不住何建一又撒娇又哀求的手段，开心地跟何建一又打又闹了一会儿，便没有再坚持一定要去美国。何建一康复出院，江晓琪偷偷地把辞职书给撕了，正好何建一进了办公室，她马上就把撕碎的辞职书给藏了起来。
晓晓妈妈和张四海一起去找赵蕾，把当天的情况如实地说出来，还江晓琪一个清白。张四海知道自己错怪了江晓琪，诚挚地向赵蕾道歉的同时，又拿着花去向江晓琪道歉。赵蕾劝说张四海以后遇事不要冲动，张四海接受劝告，再诚挚地让江晓琪体谅他当时的心情，接受他的道歉。江晓琪没有再怪张四海，张四海感动地向江晓琪鞠了一个躬，表示他对医务人员的敬重。
皓月准备去西藏了，锥子也要去西藏学习，江晓琪和刘慧敏他们于是去机场给皓月和锥子送行。锥子在与江晓琪告别的时候，把自己拿走水晶老虎的事情告诉江晓琪，让江晓琪允许他带走留个纪念。随后，院长宣布，何建一正式被任命为急诊科行政主任，而急诊科也被任命为今年的先进科室。宣布完大好消息之后，院长又抛出了一个橄榄枝，说明急诊科二室马上也要创立，而急诊二科的行政主任，将在江晓琪和刘慧敏之间产生，让她们再接再厉。
海洋和党珍妮的婚礼，急诊科的所有同事都来参加，可正当海洋说完了自己的故事，准备让主婚人何建一致词之时，急诊科接到电话得知有幼儿园集体中毒事件发生，何建一不得不带着急诊科的所有同事，飞奔回他们的工作岗位之中。（全剧终）