黑衣组织的骨干力量琴酒，可以说是黑衣组织中最靠谱的人，但是他这一生中犯了两个大错误，那就是他不应该对这两个人下杀手。这两个人分别是工藤新一与宫野明美。
先说说工藤新一，是琴酒在第一集遇到的人；由于新一发现了他们在进行不可告人的XX交易，所以这个高中生侦探就尾随了过去，然而，他没有发现身后还有个人。琴酒一个闷棍放倒了新一，还给他喂下了APTX4869，这就是潘多拉魔盒啊。
这个高中生并没有因此而死，而是变成了小学生。变成小学生的柯南，为了变回工藤新一，一直在找变回新一的方法；并且为了复仇，而想击败黑衣组织。这个高中生展现出了无与伦比的实力。他在对抗某组织的过程中，结识了小强命FBI探员赤井秀一，喜欢穿女装的大佬黑羽快斗，也就是怪盗基德；来自大阪的剑道侦探服部平次，4重身份的安室透这群大佬，再加上黑科技研究生阿笠博士。这个战斗力会不会让琴酒开始颤抖？
所以说，琴酒在那个晚上，就不应该玩什么药物研究，直接开一枪，整个世界都安静了。怕警察？可以用消音器啊，实在不行，就用那根打晕新一的铁棍多来几次。这样一来，大屏幕上就会出现《名侦探柯南·完》的字样，琴酒先生就可以好好休息了。
另一个人就是宫野明美了，她原本也是组织的成员，只不过是外围成员，连个酒名都没有，对组织的了解也知之甚少。不过她却是第一个对柯南透露组织存在的人，柯南此后才知道这是一个只穿黑衣的组织，不过对琴酒的影响不止如此，真正产生影响的是因为宫野明美的妹妹。
宫野明美是宫野志保的姐姐，明美的死让志保对组织愈加不满，甚至暂停了对APTX4869的开发。志保的抗议被组织镇压了。被关了小黑屋，志保为了逃跑，YE 吃下了APTX4869，变成了某位死神小学生的坚实伙伴。不过很心疼志保，失去了最后的亲人。
除此之外，琴酒还得罪了明美的（前）男友，被贝尔摩德称为银色子弹的赤井。本来两人之间就是敌人，这一枪，让赤井干掉琴酒的决心越来越强了。再加上部分小道消息传闻：琴酒对着志保有特殊感情；杀了明美就相当于逼跑了自家老婆。不过从琴酒枪杀明美这点来看，琴酒应该对灰原没有那种感情。
