第一集
一九三八年八月，西安八路军办事处高级参议宣侠父突然失踪，绑架暗杀的舆论甚嚣尘上。警察局侦缉队长师应山奉命调查，因涉及日本特工组织菊剑，特去请教赋闲休养的前中统特工武仲明。武仲明虽一副病态，但其专业推断让师应山折服。国民党欲草草结案，引发中共抗议。为平息事态，中统元老葛寿芝被派到西安灭火。葛寿芝向中共推荐三名查案人选，只有武仲明得到认可。西安八路军办事处主任云渠，惊悉武仲明是昔日战友武伯英的孪生兄弟。武仲明旧伤复发被实习医生蒋宝珍所救，并垫付了药费，蒋宝珍毫无顾忌的对话引起武仲明的猜忌。师生重逢，葛寿芝听取武仲明对西安政局的分析，极为赞赏，宣布任命他为军委派驻西安破反专署专员，专门查处宣侠父失踪案。西安军统徐亦觉、中统刘天章听闻成立破反专署，或惊讶，或跃跃欲试。行营联席会议上，武仲明横空出世接受任命，又提出由西安军、警、特、八办四方联合办案，惊动各方。葛寿芝离开西安前，与弟子深谈，要求他以此为契机巩固地位，师生联手创立国民党特工第三方势力。武仲明遣散家仆，进入行营。
第二集
破反专署的办公地点被安排在了行营四科的三楼小会议室，徐亦觉手下丁一安装窃听器用来监听电话，武仲明心里有数，并不揭穿。西北最高军政长官、西北行营主任蒋敬文接见武仲明，指示宣案方向是日本特工。十八集团军的沈兰的破获敌台的能力受到徐亦觉的青睐，徐亦觉试图把沈兰调派到手下做事。武仲明亲赴警察局接出师应山，又赴十七军团求见军团长胡慕雄。胡慕雄傲慢不见，表达了他对于国共内讧中突然出山的前中统特工的蔑视。武仲明指出此案两统皆有嫌疑，师应山是唯一可以帮助破案的人。武仲明赴八办重新调查，发现新线索。武仲明向云渠询问沈兰身份，云渠以武伯英试探。武仲明调查得出宣侠父失踪当天的活动轨迹。武仲明提出要昔日同事石孟来破反专署帮忙遭拒。中统刘天章，加以探望武仲明实则暗中试探。沈兰被正式派遣到行营工作，云渠问及武伯英，知道了沈兰和武伯英的夫妻关系，有些后悔派遣沈兰去行营。武仲明知道宣侠父失踪案未必是菊剑所为，但是依然选择顺应这个说法，让军统和中统松口气，以此来让破反专署立足。丁一向徐亦觉汇报武仲明动向。
第三集
徐亦觉嘱咐丁一务必留住沈兰。武仲明昔日中统同事石孟来访，对自己调到四科原因讳莫如深，却称沈兰监听到的信号，与当年“菊剑组”有相似之处。武仲明当即闯入电讯室，徐亦觉闻讯赶到，对武仲明提出要第一时间掌握监听的要求，非常不屑，不料武仲明当场译出机要电文，显示专业素质。西安城遭到轰炸，石孟向徐亦觉介绍武仲明的功绩，徐亦觉非常惊讶，开始重新看待武仲明。武仲明在会议上将调查目标直指日特。刘天章派人给蒋宝珍送花，遭拒绝。当夜神秘信号出现，不断呼唤急于联络。电台测向锁定信号发射区域，破反专署首次出击，一举捣毁日特潜伏电台，报务员服毒自尽，留下一本残缺不全的密码本。经过紧急破译，发现一个针对西安行营主任蒋敬文的暗杀计划，破反专署几方成员，冲入正在举行庆功会的长安大戏院。
刘天章保护蒋敬文撤离，徐亦觉寻找定时炸弹。武仲明指挥疏散。空袭警报来临，武仲明一行意外发现地下室，徐亦觉踩上一颗地雷。武仲明冒险留下，帮徐亦觉排除地雷。徐亦觉下令羁押戏院所有的人员，企图找出凶手。
第四集
沈兰完成任务离开行营，收到国军同行欢送。徐亦觉亲自参加破反专署联席会议，反驳云渠提出的排除日特说法，又提出让沈兰回破反专署工作。蒋公馆设宴庆功，请来唱堂会的白牡丹封箱明志，声言日寇不除，再不唱戏。蒋敬文极为赏护，命令将其留在府中。胡慕雄临时赴宴，言语间对破反专署尤为不屑，更公开质疑武仲明能力。武仲明对战局发表独特见解，让胡慕雄刮目相看，立刻留下精兵供他差谴。蒋宝珍现身，向武仲明发起挑战，两人枪法打成平手。武仲明始知蒋宝珍是蒋敬文侄女，当场致歉。蒋宝珍大胆示爱，武仲明逢场作戏，巧妙引导其说出，宣案与日谍无关。蒋敬文心生不快，事后责怪，蒋宝珍言称对武仲明感兴趣，徐亦觉分析利弊，建议武仲明尽快找个理由结束宣案。刘天章暗中调查武仲明与沈兰关系；中统眼线——侦缉队副队长侯文选也命手下跟踪武仲明。武仲明放任手下在蒋公馆附近案件重演调查取证，受到警卫阻拦，罗子春鸣枪解围被关押。武仲明闯入军统监狱接出罗子春，指出哑巴更夫有鬼。
第五集
武仲明为罗子春设宴接风，邀刘天章、石孟等中统旧同事。蒋宝珍不请自到，再展热情，武仲明表现冷淡。蒋宝珍提出拜师，武仲明敷衍介绍刘天章。刘天章送蒋宝珍回家，被蒋宝珍的心理分析所降服，蒋宝珍声称要与其做个交易。武仲明从罗子春口中得知石孟有共嫌，遂找来石孟，直问其政治倾向。石孟讲述当年从中统来军统的经过，和自己对其他人的看法，最后说出与师应山的堂兄弟关系，希望武仲明早日放他离开特务机关。蒋敬文认为武仲明冥顽不灵，蒋宝珍表示想到武仲明身边工作。雨夜行营，武仲明与沈兰相遇，沈兰质问武伯英去向，得知武伯英已经过世。沈兰情绪失控，石孟与之接头，认定她不适合在行营工作。沈兰说出了自己的故事，并保证这样的事再不会发生。武仲明从师应山的调查得知，刘天章的一个手下和宣侠父失踪的时间相近。破反专署案情分析会。刘天章和徐亦觉互相推诿，刘天章最后断言：宣侠父或被八办藏匿，或不在人世。沈兰指责国民党阵营冷漠态度。蒋宝珍突然闯进会场，声称自己是目击证人。蒋宝珍描述案发当夜，宣侠父的确在蒋公馆参与了诸暨同乡会。她由此推断，第一个可排除的怀疑对象，就是蒋敬文。蒋宝珍提出以特邀记者身份跟踪采访，再遭回绝。回家路上，蒋宝珍说出武仲明救她时隐藏的情绪，声明是认真想和他谈一场恋爱。戏院老板突然招供，武仲明感觉可疑，徐亦觉却不以为然，武仲明提出要刘天章加入审讯。会议上，听说武仲明要带沈兰去问蒋敬文，徐亦觉马上离席报信。武仲明命刘天章查清蒋宝珍的来历，又命师应山查戏院老板。
第六集
刘天章找出武仲明过往病历，罗子春暗自给武仲明换了日常用药。师应山向石孟疑称，武仲明更象是要利用破案，达到自己目的。戏院老板在监狱自杀，武仲明愤怒指责徐亦觉后，突然发病，被秘密送往医院抢救。武仲明向罗子春感慨，称自己有未竟的事，所以现在很怕死。罗子春虽不懂武仲明话中深意，却自感内疚。武仲明赴十七军团取证，受到杨辉的热情接待。蒋宝珍引武仲明到茶馆，武仲明意外从老魏身上，看到与组织接头的信物。蒋宝珍展示偷出来的蒋敬文日记，武仲明感激之余不堪其扰。武仲明与老魏在茶馆接头并探讨案情、拿到了哥哥的遗物。刘天章密见罗子春，威胁他继续留意武仲明。蒋宝珍进入专署，对武仲明公开大献殷勤。蒋宝珍推理出是哑巴更夫可疑，众人惊讶。
第七集
刘天章假借武仲明之名暗中调查蒋宝珍身世，并告知蒋宝珍，意图离间。武仲明同时命罗子春将沈兰送回八办，转告她任务完成，不需要再留在专署。沈兰向云渠复命，说武伯英已经去世，而且直觉丈夫没有背叛革命。云渠说真相早晚会水落石出，让沈兰安心回延安。沈兰、郝连秀看望孩子阳阳，青帮头目洪老五派人监视。云渠得到上级指示，亲赴八办提出：活要见人，死要见尸。武仲明随即宣布：军警特总动员，与八办联合搜查西安城，悬赏寻找宣侠父。得知宣侠父曾看牙医，武仲明想到牙齿可以作为辨别的依据。洪老五手下拿着寻人启示，并提前一步获取了宣侠父的牙科资料。八办等工作人员全城搜查宣侠父尸体无果。刘天章对于沈兰身份产生怀疑。蒋敬文回归行营，对武仲明严加申斥，命令停止全城搜查。武仲明同师应山分析案情，怀疑中统与失踪案密切相关。徐亦觉出主意让蒋宝珍以专职医生身份进入专署。蒋敬文命令侄女可以笼络监视，但不能谈婚论嫁。徐亦觉事后向蒋宝珍邀功，讲述武仲明的能耐和脾气。蒋宝珍正式加入破反专署。蒋宝珍要开香槟派对庆祝，被武仲明严厉制止，蒋宝珍亮出武仲明病历，两人单独交谈。蒋宝珍分析武仲明心理，说他心中潜藏很深的罪恶感。武仲明感觉震撼，终于认可蒋宝珍的能力，允许她留在专署工作。
第八集
蒋宝珍提出对哑巴更夫的怀疑，刘天章申请由他来审讯。是夜，正在进攻中原的日军谷夫岩部，接到“菊剑组”电报，请求杀死在押日谍。信号被军统截获，石孟怀疑又出现新的日谍电台。蒋敬文命徐亦觉与八办沟通，紧急借调沈兰。石孟赴八办接沈兰，向云渠讲述了他眼中的武仲明。最终决定先配合武仲明。沈兰重回行营，武仲明厉问原由，徐亦觉得意声称奉命而为，武仲明烦躁，沈兰却主动安慰，武仲明与蒋宝珍合手审讯，哑巴更夫却毒发身亡。武仲明下令封锁军统监狱，关联者皆要接受隔离审查。。徐亦觉大发雷霆，直指武仲明是故意为难他，报告显示更夫所中毒药，为菊剑特用的河鲀毒素。武仲明也感动蒋宝珍的支持，亲自送她回家，两人感情增进。武仲明向徐亦觉明确提出不与四科争功，并讲述唇亡齿寒出处，徐亦觉感念他的大度。八办接到洪老五的绑架勒索信，破反专署把目标锁定黑帮和近郊土匪。师应山介绍情况。刘天章出言谨慎，徐亦觉却一反常态，积极配合。勒索信接踵而至。
第九集
八办自己组织营救的计划让师应山很开心，劝武仲明早点脱手遭到拒。云渠拿到赎金，被告知不能与破反专署的人同行，于是只身赴户县交付赎金。武仲明跟至户县，看到云渠与化妆为钟馗的绑匪交接一幕。与此同时，户县工作站遭到土匪偷袭。武仲明抢先拦住绑匪汽车，化装的丁一等惧怕暴露身份，将赎金箱砸向武仲明后逃离。户县八办工作站陷入火海，现场遗下一具焦尸，对比特征遗物，确认是宣侠父遗体。因为钱箱，武仲明受到质疑，仍要求亲自验尸，险被愤怒的宣侠父警卫员开枪打中，被云渠救下，喝令离开。刘天章在八办的卧底密报，户县工作站的尸体特征，与林组长相符，刘天章心惊肉跳，禁止手下声张。蒋敬文召集各方开会，称宣案调查终结，由警察局善后，并准备召开记者会。云渠怒指国民党办案不力。武仲明逐一反驳，会议不欢而散。蒋敬文命武仲明把工作重心转到侦破“菊剑”上，并让徐亦觉配合他，徐亦觉手下皆感觉气闷。师应山请辞，武仲明拒绝，声称不能认定遗体是宣侠父。武仲明意识到宣案可能是两方力量互相配合又互相制约导致的，蒋敬文的目的是想让他远离宣案，把武仲明拉到他们的体系中，调查最好的时机到了。武仲明与老魏分析案情，认定疑点转向军统，请求继续向国民党高层施压。
第十集
侯文选报告说书人可疑，刘天章觉得老魏什么话都敢说，直觉特工不会如此招摇，遂放松警惕。武仲明直入机要室发报。沈兰获得电文告之石孟遗体有疑。武仲明中途叫停记者招待会，蒋敬文震惊问责，武仲明拿出军委让继续查案的电令，蒋敬文大怒，停止对破反专署一切供应。刘天章就当年弑兄过程试探武仲明，却被武仲明反问林组长去向。刘天章震惊声称怕中统会成为众矢之，保证中统与此事毫不相干。武仲明表示相信，他让刘天章把此情泄露给徐亦觉，以敲山震虎。徐亦觉醉酒试图对沈兰用强。武仲明忍不住与徐亦觉动手。蒋宝珍回家，发现叔父已知武徐内讧。她建议让沈兰蒋敬文命令徐亦觉送沈兰离开行营，徐告知沈兰是唯一可以听出日本间谍电台的耳朵，即便争取不成，也不能放她回八办！蒋敬文默许，并要求四科独立出来。老魏约见武仲明，批评他的冲动。武仲明承认失控，又说对刘天章确是有意为之，因为他想把水搅得更混，让刘天章早点暴露。他又说徐亦觉虽然气盛，反而更好把握，因为他们有共同的目标。武仲明请求让沈兰知道真相，老魏以亲身经历说特工的身份没有真相。军统监狱在押“看守”失踪，徐亦觉找武仲明出主意，始知武仲明早在监狱外布下天罗地网，以防“菊剑”逃离。武仲明亦声称菊剑是死敌，只要一息尚在，绝不会放弃。“看守”乔装刺杀蒋敬文，被武仲明和徐亦觉及时阻止。
第十一集
谷夫岩得知菊剑接连折于宿敌之手，急电命令清除武仲明！沈兰捕捉到这个稍纵即逝的电波，虽不知其意，但仍留下记载。刘莉莉身份暴露，原来是戴老板派来监视徐亦觉的。徐亦觉清查内部，主动宴请武仲明，声称如助他锄除菊剑，他会把所知全盘托出！丁一偷听后惊恐万状，称要先下手为强！刘天章得知沈兰即将参加募捐会，提醒武仲明赴蒋宝珍约会。武仲明临时出门，躲过日本特工在家门前的刺杀。抗日募捐会上，武仲明与蒋宝珍翩翩起舞，沈兰感触流泪，此景被刘天章拍下。云渠演讲引发全场掌声。武仲明失落离场，蒋宝珍追出，再度表达感情。云来茶馆，中统、军统和日本三方特工汇集。此景皆被老魏看在眼中。蒋宝珍谈论西方颅相学，令武仲明茅塞顿开。
第十二集
军统杀手在茶中下毒，老魏向武仲明示警，引发日本特务开枪。武仲明受伤，师应山及时赶到，击毙日特。武仲明也随即救下老魏。武仲明疗伤后，发现刘天章已经赶到，把老魏“保护”起来。武仲明急返专署，有意公开遇刺过程。沈兰和郝连秀商议，让他把消息传回八办。郝连秀露出叛徒面目，他先到刘天章处接头，告知说书人的共党身份。刘天章命令手下控制茶馆，以吸引更多大鱼落网。八办得到消息，云渠暗中与茶馆老板接头，老板称国民党特工已经把茶馆彻底封锁，他说老魏曾与武仲明有过接触，但不知武仲明身份。云渠急赴行营求见武仲明，期望放过老魏。武仲明知道谈话被窃听，只能婉拒。徐亦觉建议蒋敬文，对武仲明先行栽赃，再施怀柔，以彻底收服他，得到肯定。徐亦觉和刘天章为了老魏，在蒋敬文面前争执不下。蒋敬文权衡之后，把人交给徐亦觉，又将刘天章控制在蒋办。刘天章急中生智，向蒋宝珍透露，徐亦觉要抓老魏，又说只有武仲明才能阻止。蒋宝珍当即致电武仲明，要他去救老魏。武仲明推演种种可能，下令手下出动，抢先一步逮捕老叫花。师应山带领警察封锁了整条街，八办意武装营救，只能止步于街外。武仲明与徐亦觉谈判，直指刺杀与军统有关。徐亦觉向丁一问出真相，恼羞成怒，下令撤离。刘天章突然现身，出示蒋敬文手令，要将老魏带走；蒋宝珍随后赶到，指责刘天章出尔反尔。刘天章假意请示，武仲明咬牙说公事公办。蒋宝珍斥武仲明忘恩负义，武仲明冷然声称自己使命重大，蒋宝珍的想法根本不在他考虑范围之内，蒋宝珍几乎气疯。徐亦觉事后向武仲明道歉，说欠武仲明一个人情，一定会惩处手下；他又提醒刘天章才是真正的小人。
第十三集
云渠接到中央密电，将遗体转给破反专署。众人得知武仲明要重新验尸，表现各异。刘天章被武仲明逆天的一意孤行惊呆，同时还受命寻找宣侠父与人合影。很快，宣侠父与胡慕雄、武伯英的分别合影，摆到众人面前。为了证实尸体身份，武仲明请蒋宝珍帮忙，并承认武伯英是孪生兄长，坦然说正好从自己查起，因为他们的头骨最接近。蒋宝珍震惊之余，私下询问刘天章，被告之武仲明曾经击毙中共兄长，蒋宝珍更为震惊。蒋宝珍态度转冷，但仍配合工作，将遗骸颅骨与胡慕雄对比检查。胡慕雄表达倾慕，蒋宝珍与之周旋，以他曾经说过“匈奴不灭，何以为家”为理由，再度拒绝。胡慕雄秘书杨辉则向武仲明透露，宣侠父失踪前，正在为胡部制定肃奸计划。武仲明单独面见胡慕雄，制定了一个新的锄奸计划。中统审讯室，老魏痛快承认身份，说自己负责策反监视武仲明，并且已成功，刘天章却质疑是否有诈。蒋敬文惊悉宣案再启，训斥徐亦觉不及时报告，徐亦觉以蒋宝珍参与为由，企图搪塞。蒋敬文恼怒之余，电话追逼刘天章加快审讯进度，以给武仲明定罪。刘天章企图让老魏指认武仲明是共党老牌情报人员，被老魏拒绝。
第十四集
蒋敬文禁止侄女再去专署，因为武仲明通共。蒋宝珍笑说不信，因为武仲明曾轼兄。蒋敬文称早知此事，蒋宝珍吃惊。徐亦觉也翻脸，声称只承认茶馆杀手是日本特务，又称武仲明想要自保，应全力以赴侦破“菊剑”，而非宣案。武仲明开会通报，经两次颅骨对比，遗体绝非宣本人，宣布案件从现在起，重新进入调查程序。师应山此刻已经掌握重大情报，迟迟不敢报告。石孟建议师应山密报案情。师应山遂以匿名信的方式告诉武仲明：宣侠父当夜回家路经的平民坊，有个孙大午离奇暴毙，且与案件有直接关联。武仲明锄奸行动在即，急于破案，从军统调出沈兰，上门吊唁。沈兰果然出手不凡，顺利做通遗孀工作，开棺验尸，查出死者为毒毙。孙大午遗孀也交待出了洪老五。武仲明立刻布置抓捕洪老五， 沈兰回行营将此事通报郝连秀，并要求跟随武仲明前往。郝连秀第一时间密报刘天章，刘天章报告蒋敬文，蒋敬文命令徐亦觉阻拦。武仲明冲破徐亦觉阻拦，强行破出行营却再次被蒋敬文秘书截下，出示手令，命武仲明即刻赶到中统站。蒋敬文携蒋宝珍听审，下令只要武仲明被指认，就当场逮捕。不料，老魏在审讯中被武仲明当场“击毙”。武仲明独自开车回奔，一路回忆和老魏的死亡约定，回忆老魏留下的泣血遗言，心痛欲裂。
第十五集
武仲明急返现场指挥抓捕，洪老五早已逃之夭夭。武仲明急火攻心，旧伤发作，被送往医院急救。沈兰跟随照料，到了医院，沈兰听到武仲明呓语，突然锁住了病房门，大声质问武仲明。罗子春破门而入，两人对峙逐渐冷静。武仲明醒后懊悔，交佩枪给罗子春，命令以后昏迷时再说胡话，就帮他了结。沈兰回八办讲清过程，称要为夫报仇，被云渠制止。这时消息传来：老魏在审讯中牺牲，沈兰持枪冲出八办。武仲明返家，沈兰手藏上膛的手枪等在门前，八办汽车赶到，也将枪口对准了沈兰，沈兰最终被八办同志下枪。沈兰向云渠等讲述了自己对武仲明的怀疑。是夜蒋宝珍探病，武仲明命令罗子春送回家。罗子春转向刘天章报告沈兰异常，两人接头情形被武仲明看在眼中。罗子春的背叛，让武仲明更添心痛。罗子春清晨发现武仲明神秘失踪，刘天章秘密搜查，寻找蛛丝马迹。蒋宝珍赶到医院，得知武仲明并未完成治疗，随时可能再发病。两人都找蒋敬文要人，蒋宝珍愤怒指责刘天章，蒋敬文警告侄女不要动真情。蒋宝珍负气离家，白牡丹提醒武仲明随时可以死亡。刘天章截下蒋宝珍，说出沈兰昨晚异常，两人达成一致，联手调查武仲明失踪。
第十六集
蒋宝珍、刘天章就联手调查武仲明失踪达成一致，却发现沈兰被军统劫持。沈兰被送往秘密基地，被威胁要求留在军统西北秘密电讯基地。蒋宝珍向徐亦觉要武仲明，无功而返。胡慕雄部青训班开学，武仲明以日本籍教员身份现身。武仲明受到以王力为首的东北流亡学员集体排斥。谷夫岩部亦接到“菊剑”电报，要求核实教员中村身份。回电称确有此人，掌握重大军事机密，立即清除。沈兰在基地捕捉信号，发报手法让她吃惊，开始有了一个可怕的猜测……王力鼓动东北籍学员，密谋处决“日本教员”。武仲明与之斗智斗勇，危机关头再度发病。丁一等坐视不管，徐亦觉及时赶到，救下武仲明。武仲明病发、王力被捕。沈兰通过辨认发报手法，指认打入胡慕雄部机要室的日本间谍。报务员服毒身亡。武仲明被军医误诊，即将不治。徐亦觉倍受煎熬，蒋宝珍及时赶到，将武仲明从死亡线上拉回来。与此同时，八办也在紧急查找沈兰的下落。
第十七集
刘天章感受到蒋敬文对其态度的转变，决定给老魏加上日特共党双重间谍的身份，以求自保。蒋宝珍彻夜守护，武仲明转危为安，两人感情加深。蒋宝珍知道了这次行动是蒋敬文和胡慕雄批准的，并且徐亦觉知情。蒋宝珍斥责徐亦觉见死不救，徐亦觉只好坦告，要置武仲明于死地的，是她的叔叔蒋敬文。胡慕雄探望褒奖，坦诚说出与宣侠父的交往和友情，并透露宣侠父失踪可能与他有关。武仲明激动不已。武仲明把肃奸功劳皆归军统，徐亦觉再度感到武仲明义气可嘉，愧疚之余要结拜，以兄弟相称。徐亦觉将武仲明带往基地，途中说出对沈兰不留则杀的想法，武仲明内心震惊。“菊剑”报告：胡慕雄部菊剑分组，全军覆灭。谷夫岩部回电，西安“菊剑”组暂停一切行动，电台静默。沈兰再次监听到稍纵即逝的可疑信号，通报说这部电台的发报手法，与长安大戏院刺蒋案发前，自杀身亡的日本发报员是同一个人！武仲明据此推断，他们可能进入日本间谍设好的圈套，长安大戏院那场暗杀行动，是声东击西一场戏。蒋敬文知悉，逼迫武仲明据此反推宣案与日特相关。徐亦觉以武仲明手术后不便说话为由，要求替他宣布。武仲明表面答应，暗中提前拆线，宣布以汉奸通敌破坏抗日罪，通缉洪老五！
第十八集
丁一得知武仲明竟以大烟麻醉止痛，遂命令搜查，蒋宝珍出面为武仲明遮掩，武仲明却看出罗子春的真心。武仲明提出要给罗子春在胡慕雄那里谋份差事，让罗子春很纠结。洪老五震怒自己成了汉奸。命令手下报复孙大午孀妻，正中埋伏，被捕徒弟供出洪老五藏身之地。武仲明再度组织抓捕，消息又一次提前走漏，洪老五踏上逃亡之路，发誓报复。武仲明向蒋敬文复命，称追捕洪老五一再失手，是因为行营内部有鬼。蒋敬文训斥武仲明办案不力推卸责任，要赶他离开行营。武仲明正告徐亦觉，他知道洪老五不是汉奸，宣案与日本特工无关，但是洪老五背后一定还有主谋。刘天章知道武、徐的联手锄间行动，连师应山都知道，只瞒他一人，备感嫉妒，把自己关在办公室内，反复研究钢笔上的刻字，突然如梦初醒……蒋敬文斥责蒋宝珍包庇武仲明，蒋宝珍承认爱情，却被告知说武仲明喜欢沈兰，蒋宝珍质问武仲明是否在利用自己。武仲明将计就计，对着窃听器强调，他理解蒋敬文的做法，他最终会让军部和蒋敬文满意。武仲明拒绝了蒋宝珍，蒋宝珍哭着跑掉，武仲明歉意追赶，两人情之所至拥抱，被刘天章手下拍照。
第十九集
武仲明分析当初日特制造大戏院混乱目的，可能是为了潜入行营，现在菊剑也许就隐藏在他们身边。徐亦觉惊讶，武仲明告诉他行营建制较乱，所以不宜打草惊蛇，建议他先上报总局，此事在西安只限于他们和蒋敬文三人知情。专署开会，武仲明当众请郝连秀和他一起去接回沈兰。徐亦觉再度气疯。武仲明进入基地接出沈兰，发现她仍然误会极深，只好把她交给郝连秀。郝连秀抓住她急于破获菊剑电台的心情，假传命令，让她寻机再度潜返基地。师应山也误解武仲明囚禁了石孟，质问了他一番，误会解除后师应山报告了宣侠父案的进展。徐亦觉发泄之际，得知自己立功晋升，意外又不安。 武仲明列举事实，称军统与洪老五几番逃脱皆有牵连，借此警示徐亦觉。沈兰再回行营，徐亦觉心情大好，主动找武仲明和解，又警告不许再坏他好事。武仲明心急如焚，以通报为名亲赴八办，向云渠出示接头古币。向云渠出示接头古币，非但没得到回应，反被指调查进展缓慢，又被问及沈兰去向及老魏的生死。武仲明失望中再赴茶馆，同样亮出古币，茶馆老板也无动于衷。武仲明彻底绝望，知道八办内部出现问题，他和组织也完全失去了联系！武仲明手持兄长留下的密码书，进入机要室，来到沈兰面前。沈兰认出此书，说一切都可以既往不咎，但她希望看到真相，这是她来行营的初衷，也一定是武伯英的愿望。徐亦觉出于内疚，没有打断两人交流。武仲明经过痛苦思考，最终烧毁了密码书。他知道，自己只能把情感深埋心底，孤军奋战，不辱使命。
第二十集
嘉奖会上，四科全体都获得了奖励，而蒋敬文拨款两千万给破反专署作为私下对武仲明的奖励。石孟和师应山谈论这次嘉奖，师应山表现出对武仲明的欣赏，并为他不平。武仲明下令抓捕洪老五手下家属，关进军统监狱，逼看各方反应。徐亦觉对武仲明的行动极为恼火。武仲明与蒋宝珍相拥的照片出现在蒋敬文桌上，蒋敬文当着蒋宝珍的面找来武仲明，声称同意结婚，要求速战速决。武仲明婉言回绝，让蒋宝珍极为难堪。武仲明向罗子春提出让他尽早结婚，想看他过上正常的生活。罗子春发现中统控制了小玲，不得已再次向刘天章透露武仲明的信息。蒋宝珍摔出照片让刘天章解释。刘天章发泄说他也不想这样做，因为他不想看着自己喜欢的人，和别人在一起。武仲明亲赴中统，与刘天章破冰。他说认同刘天章对自己的调查，如果放在自己身上，也会有这样的怀疑，又把审讯“王力”的任务交给刘天章。
第二十一集
武仲明故意言语轻佻，蒋宝珍假装气不过，当着中统特务的面，砸了武仲明一头油泼辣子。刘天章重返专署，给王力打了致幻剂。武仲明听懂了“王力”含糊的日本话呓语，推断“菊剑”就潜伏在蒋敬文身边！武仲明将此情单独通告徐亦觉，两人再度修和， 达成一致：这个机密目前不泄露给任何人，包括蒋敬文在内，直到把这支毒剑拔出来为止！徐亦觉主动找武仲明喝酒，请求他放了在押的黑帮头目，说里面有他的眼线，不要让他为难。武仲明问洪老五是否也是他的眼线，徐亦觉不置可否，却出主意让他借通缉洪老五，把宣案办成一般的民间绑架勒索案。武仲明警告说不要到时候查出来，他们丢卒保帅，弄得我也保不了你！蒋宝珍私宴刘天章，判定他人格分裂，直言他背后，掩盖着不甘居人下的野心和嫉妒。刘天章坦述自己历史。说武仲明亦分裂，他明知查宣案四面树敌还锲而不舍，不是傻子就是想要凌驾于蒋敬文之上。蒋宝珍质问问刘天章如果喜欢她，为什么把她一道卖了？蒋宝珍出枪对准刘天章！戏弄完毕，说她也怀疑武仲明不正常。所以想和刘天章一起，验证一下判断。 刘天章带蒋宝珍潜入武仲明家，惊喜称书架上有本古书被换掉，但他清楚记得扉页上有四个字，和一只钢笔上一模一样。刘天章出示钢笔，说是沈兰留给儿子的。郝连秀再次提出结婚的事情再被拒，另一边却向刘天章诉苦，说自己同时压服沈兰、欺骗八办，就象在走钢丝，随时会暴露。刘天章威胁地回忆郝连秀被捕投诚的情形，又声称沈兰身份已查清，他很快就会得到答案。石孟受命秘密转移设备，察觉气氛诡异。
第二十二集
石孟受命秘密转移设备，借机用密码向沈兰示警。蒋宝珍假借专署体检的名义接触沈兰。专署案情分析会，郝连秀在刘天章的授意下请假缺席，沈兰被临时叫来与会。武仲明公开洪老五手下证供；与此同时，一封匿名信交到沈兰手中，里面有武伯英遗体照片和武仲明大义灭亲的嘉奖令。沈兰当场拔枪指定武仲明，逼着他说出当时情形，随即扣动扳击……武仲明拔出另一把枪指定刘天章，认定是他布局。刘天章惧怕声称事先得到蒋敬文和徐恩曾的许可。武仲明立刻面见蒋敬文，要求惩办泄密。蒋敬文却让他解释与沈兰的关系。武仲明称早知沈兰是武伯英妻子，是徐亦觉一再坚持，非要沈兰来行营工作。况且沈兰确为破获间谍案立下汗马功劳，他愤怒质问不明白为什么要用这样的手段！蒋敬文尴尬称这样很好解除了通共嫌疑。武仲明问如何处理沈兰，蒋敬文冷然称可以永远消失，也可以永远为我们所用！徐亦觉报告沈兰在轰炸中殉职，蒋宝珍和刘天章皆震惊，只有武仲明知道，这是军统为沈兰早已设定的结局。武仲明在办公室枯坐至深夜，蒋宝珍再度忏悔，又把从胡慕雄处要来的特效药交给他，武仲明愤然销毁。云渠认定沈兰之死不简单，决意要追查到底，他命令郝连秀把孩子接回来！刘天章让郝连秀监视石孟。
第二十三集
武仲明称病告假，蒋宝珍再到武家探望，发现武仲明正用大烟麻醉自己。蒋宝珍痛心安抚。两人将陷亲热，武仲明却在游离中喊出了沈兰的名字，蒋宝珍伤心离开。师应山探望武仲明，发现他连日酗酒。云渠到访行营，武仲明却喝到酩酊，徐亦觉只好帮他圆场，后将其“打醒”。蒋宝珍也找刘天章买醉发泄，说聪明反被聪明误，结果害人害已。刘天章却不同意，他说沈兰这一次反应似乎过激；而武仲明在枪口下坐以待毙，也有失常理。沈兰在基地绝食，徐亦觉硬着头皮请武仲明出面劝导，武仲明无动于衷，徐亦觉只好告知沈兰有个两岁大的孩子。刘天章将孩子送至武家，称得知武家有后，抢先一步把孩子接出，希望算做补偿。沈兰被强制输液，武仲明来到病床前出示照片，强调阳阳目前安全，又说“菊剑”始终未破，电台更是谜团。他请沈兰从民族大义考虑，不要轻易放弃生命，为抗日救国出力。沈兰返回监听岗位，伺机告诉石孟：蒋宝珍要求与她合演一场戏。她要石孟尽快通知八办：郝连秀有问题！刘天章去找徐亦觉，告诉他军统内部可能有中共卧底，而石孟嫌疑最大。
第二十四集
刘天章自作主张将陈妈接回武家并试探陈妈。罗子春认为武仲明有意疏远自己。师应山登门求武仲明调查石孟去向，并给武家加上岗哨。徐亦觉接到手下报告说石孟试图离开秘密基地，有意下令将他放出以试探。石孟欲与茶馆老板接头，发现自己已被跟踪，悄悄写下告警密码，旋即被捕。茶馆老板机智逃脱，茶馆被彻底查封。徐亦觉亲审石孟，石孟声称特工生涯厌倦，只想从基地出逃，别无他图。徐亦觉骂石孟辜负他的信任。石孟声称感激知遇之恩，可派他去前线，戴罪立功，以命相报。徐亦觉犹豫间，刘天章拿中统徐恩曾命令要人，徐亦觉只好交出石孟。临行前石孟让徐亦觉立刻处决他。徐亦觉实情上报戴笠，得到答复是交给中统。徐亦觉只好照做。刘天章刑审石孟，又打了致幻剂，石孟在迷幻中只承认要策反武仲明，又说武仲明杀兄禁嫂。刘天章由此惊悉沈兰居然没死。刘天章申请处决石孟，由武仲明执行。徐恩曾回电首肯，武仲明再临危机。从师应山口中得知石孟已经失去行踪，武仲明震惊，马上找徐亦觉打听，知其已经定性为中共特工，且落于刘天章之手。武仲明感觉危险将至，向葛寿芝报告自己众叛亲离，声称蒋敬文是破案最大的障碍。葛寿芝透露军委对蒋敬文信任度降低，让武仲明放开手脚，不必有任何顾忌。武仲明放下电话，扯下窃听器，直奔徐亦觉办公室，称徐所认定的党国利益，也许就是某个人的利益，现在等着徐亦觉解释。徐亦觉纠结良久，找来丁一，让他去办一件事……刘天章将武仲明“请”到中统，出示徐恩曾决命令。武仲明和石孟最后对话。
第二十五集
武仲明和石孟最后对话。石孟痛斥武仲明毫无人性，武仲明被骂到狗血淋头，却真情难诉。军委急电，禁止武仲明参与任何针对中共的审讯和处决，武仲明在大雨中为石孟送行，听到处决枪声，感同身受。武仲明发现刘天章把陈妈接回家中，陈妈暗中告诉他，自己什么都没说。武仲明感动。蒋宝珍把孩子抱走，武仲明寻至公园，再度病发。武仲明被送到医院，罗子春拎枪寸步不离，言称只要武仲明说梦话就开枪。蒋宝珍骂他死心眼，将其赶离病房。武仲明醒来，发现自己在蒋宝珍车上，蒋宝珍则声称给他打了吗啡。武仲明明白蒋宝珍只是调戏，两人意味深长对话。两人同赴华清池，蒋宝珍执意要登骊山，武仲明开始怀疑她的目的。白牡丹得知武仲明上了骊山，打开封闭的化妆箱发报。沈兰终于侦听到可疑信号，对照半月前记录下的电文，电讯专家通知徐亦觉，让他跟进这两日相关联的大事件，对敌密码破译可能出现重大转机！武仲明和蒋宝珍攀登烽火台，路遇吼秦腔的采药人，唱信天游的打柴父子。武仲明和蒋宝珍貌合神离地对话，蒋宝珍有意甩开警卫。
第二十六集
天降大雨，打柴父子打死警卫换装跟进，掩藏的尸体又被采药人发现。罗子春亦被中统同事叫去喝酒，席间透露武仲明不在西安。醉后发现小玲被同事接来，醉酒的罗子春企图和小玲洞房遭到小玲强烈反抗，只能作罢。与此同时，洪老五出现在武家大门外……武仲明和蒋宝珍在烽火台避雨，武仲明厉声质问上山原因，争执中遭遇“警卫”袭击，蒋宝珍受伤。武仲明开始想弃她不顾，终不忍心返回，护着她一路与杀手搏斗。武仲明被杀手逼至悬崖，采药人突然出现，与杀手滚下深渊。武仲明心知定有来历，坚持看到尸体，终于在采药人身上发现接头古币，知道失去一次与组织联系的宝贵机会。蒋宝珍伤势严重，入院急救，师应山却急接武仲明返家。武家遍布警察和便衣，原来一夜间发生血案，陈妈被害，阳阳失踪。武仲明随师应山寻踪进入茶馆，意外发现石孟留下的密码，查后方知蒋宝珍与沈兰皆以不同方式保护过他。武仲明回想山上情形，再回想与蒋宝珍相处一幕幕情形，突然意识到蒋宝珍可能是同道，而骊山之行，既然是组织的有意安排，那蒋宝珍就是为了掩护他受伤。武仲明第一时间赶回医院，当众表白压抑已久的真情，他许诺只要蒋宝珍活着，一定会娶她为妻！蒋宝珍术后清醒，武仲明展示接头古币，蒋宝珍反应漠然。徐亦觉通报武仲明，军统怀疑蒋宝珍通敌，已经开始调查，正向刘天章索取资料。刘天章探望蒋宝珍。
第二十七集
胡慕雄得知武仲明家中血案，派兵进驻武家确保安全。他告诉武仲明，胡部将向信阳开动，叮嘱除奸务尽。武仲明说军统正在查蒋宝珍，请他帮助。刘天章趁探望之机，将此事透露给蒋宝珍。蒋宝珍负气留信出走，声称要去延安。敬文在路上截下侄女，将她重新送回医院，并告诉她武仲明的表白。蒋宝珍称之所以冷淡对待，是因为叔叔想借自己置武仲明于死地。蒋敬文声称刺客绝不是他所派。胡慕雄赴医院探望，提出订婚解围。罗子春向武仲明忏悔，自己醉酒走露消息，可能因此害了老人和阳阳。武仲明却赶他回中统。罗子春陷入痛苦纠结，小玲也拒绝和他见面。小玲向蒋宝珍诉说陈妈被害当晚的实情。师应山积极操办葬礼，蒋敬文胡慕雄皆派人吊唁，场面一时空前。云渠应邀前来，武仲明当着众人面，承认阳阳在血案中失踪。云渠则声称阳阳姓郝，是沈兰与郝连秀的儿子。武仲明出示洪老五的勒索信，让八办不要插手，云渠勉强同意。徐亦觉听到有这样一封信，当场变色，派丁一去找洪老五谈判，用一纸军统的委任状换回阳阳。阳阳回到武家，因惊吓不吃不喝。
第二十八集
蒋宝珍派人来接阳阳，用特有方式打开了阳阳的心门。又留下孩子血样，武仲明表达感谢，蒋宝珍却声称恩怨已清，再无纠葛。八办在孩子身上发现针眼，又对武仲明产生新的怀疑。小玲向刘天章通风报信，被武仲明控制，当着罗子春的面，终于问出小玲已经被郝连秀发展为中统、中共双料特工。罗子春崩溃，被武仲明重新收服。武仲明设计抓捕郝连秀，将其关进军统监狱，取血样声称验亲，并“意外地”当着徐亦觉的面，审出武家的凶杀案。八办和刘天章同时赶到军统要人，徐亦觉声称涉嫌凶杀案，已经转送警察局。云渠、刘天章和徐亦觉赶到警察局，隔门听审。铁证面前，郝连秀承认找小玲接头，结果发现武家遭劫，为了解脱怀疑，杀害陈妈。郝连秀又傲慢声称警察局动不了他，因为他是中统特工！郝连秀交待小玲是他借中共之名发展的地下人员，借以监视武仲明是否通共。罗子春持枪闯入审讯室，将郝连秀一枪毙命。武仲明事后听徐亦觉讲述整个过程，驱车前往石孟牺牲地。刘天章接蒋宝珍出院，两人关系俨然情侣，武仲明不免失落。蒋敬文给破反专署下达秘密行动，要武仲明放下其他事情以行动为主。
第二十九集
蒋敬文给破反专署下达秘密行动，要武仲明放下其他事情以行动为主。白牡丹窃取秘密行动的情报。白牡丹坐上刘天章汽车，将情报和窃听器安于车上，并借逛南货店之机，和同伙接头。蒋宝珍表现得异常吃醋，声称白牡丹勾搭刘天章，又被叔父重新打回破反专署，徐亦觉受命监管。蒋宝珍重返专署后，仍公然与刘天章打得火热，对武仲明和徐亦觉都语出刻薄，对她的喜怒无常和放荡不羁，武仲明深感痛心，又无可奈何。武仲明逼问徐亦觉阳阳被绑架幕后凶手，徐亦觉说出是洪老五干的，武仲明提出要见洪老五，徐亦觉感到为难并且提醒武仲明洪老五不好惹。刘天章送与蒋宝珍交流，说郝连秀的死疑点太多，他越来越感觉武仲明就是中共特工，提及绑架案，扬言自己做会更为出色。日特将假的军事情报，发给谷夫岩部。军统基地据此胜利译出电文，胡慕雄部按计划成功突破，占领信阳，有力支援了武汉会战。
第三十集
武仲明告知蒋宝珍“菊剑”就埋伏在蒋敬文身边。蒋宝珍带着任务返回公馆查日特。刘天章带着蒋宝珍来到办公室，扬言自己有一个新的计划，并承认自己还有杀手锏，因为沈兰还活着，现在就在军统电讯基地。而自己需要蒋宝珍配合才能见到沈兰。白牡丹窃听到了这一惊人讯息，遂发报声称菊剑沈兰在军统秘密基地面临危险，要求解救。电报被基地截获，沈兰成为日特嫌疑人，旋即被拘，受到审讯。武仲明认定是菊剑的离间计，受徐亦觉之托赴基地探望沈兰时，也被扣留。军统张毅密赴西安基地，武仲明、徐亦觉、蒋宝珍、刘天章等知情人从不同地方被带到基地，与沈兰一起受审。结果刘天章汽车被日特跟踪，基地暴露。菊剑成员扮成裁缝向白牡丹传递情报，白牡丹毫不犹豫发报，用另一套密码指示基地经纬度，要求派机轰炸。武仲明辨认出这是两年前菊剑在西安的密码，等他译出电文，敌机已经降临基地，开始报复性轰炸。武仲明在混乱中保护沈兰逃离基地。刘天章紧追不放。沈兰持枪“劫持”了武仲明，关键时刻，蒋宝珍现身开枪，并宣布沈兰死亡。武仲明痛心疾首。
第三十一集
武仲明回到医院看望受伤的徐亦觉，得知徐亦觉因为此次事件职位不保。刘天章为了坐上徐亦觉的位置，企图向蒋敬文说出自己对武仲明的怀疑，遭到蒋宝珍的反讽。白牡丹再无障碍，连夜向谷夫岩部发报，被蒋宝珍奶妈察觉，白牡丹毒杀奶妈，并把电台窃听器转移到佣人房，企图嫁祸。徐亦觉面临撤职，武仲明临危受命，接替他成为行动组长，果断命令封锁蒋府。武仲明在侦查中发现，刘天章是泄密源，而奶妈自杀前，居然挣扎着从一幅八仙年画上抠下吕洞宾。此时师应山灵光突现，联想起一出折子戏《吕洞宾三戏白牡丹》。破反专署在蒋家开宴，蒋敬文突然叫白牡丹唱戏。白牡丹狗急跳墙，刺杀蒋敬文不成，被武仲明与蒋宝珍合手反制。审讯中，白牡丹妄称自己是中共间谍，受宣侠父指派打入蒋公馆。
第三十二集
蒋宝珍主动要求去八办请云渠来参与审讯。云渠也及时找到被日特残害的真正白牡丹，带到西安，假白牡丹只能认罪。菊剑案成功告破，在武仲明的建议下，徐亦觉免于撤职处分，师应山也官至副局长。只有刘天章失意万分，因为在他汽车上找到了日特传递的情报，他和白牡丹的接触正是军统基地被轰炸的主因。刘天章面临撤职查办，蒋宝珍知情安慰。武仲明众望所归，立功晋职，并得到蒋敬文的空前信任，一时权倾行营。师应山也申请重返破反专署，武仲明知道他想报复刘天章，没有同意。刘天章下令密裁罗子春，武仲明将其救出后意图让他离开，罗子春坚定的表明自己的忠心，留了下来。
第三十三集
丁一欲暗算武仲明以泄愤，徐亦觉安抚。武仲明为防止泄密，写信希望八办来制定追捕行动。师应山开始接触八办，并积极查找洪老五下落。武仲明让云渠负责追捕，自己留下来吸引防范徐亦觉。两人在鼓楼交谈，武仲明让徐亦觉践此前之约，徐亦觉说自己让洪老王去做，只是当时武仲明不在家中，所以错过。武仲明始知洪老五绑架阳阳，是为了来向自己解释真相。徐亦觉得知洪老王被捕在即，愤怒称为救阳阳，他无奈之下给了洪老五一纸军统的委任状！他好意为武家留后，错上加错留下口实，现在武仲明反来逼他，是不讲情义！武仲明始料不及，只好安慰说终会给他一个交待。两人急赶抓捕现场。不料，半路杀出一个刘天章，先一步赶到，竟然将洪老五一枪毙命。通过审问洪老五手下，得知宣侠父尸体藏在井下，搜寻行动立即展开。这次行动的泄密，武仲明提醒师应山注意部下的情况。得到消息的侯文选开始准备跑路，师应山开始追捕侯文选。武仲明拘捕了刘天章，八办开始全城搜井。武仲明主审刘天章，蒋敬文、徐亦觉在场，刘天章显得有恃无恐，突然反客为主，开始质问武仲明。刘天章逐渐占据审讯主动。他质疑武仲明查办宣案的真实意图。指向武仲明通共。并直指他杀兄是假，送情报是真。
第三十四集
蒋敬文开始起疑，武仲明请求接直拨通葛寿芝电话。葛寿芝亲口向蒋敬文证实现在武仲明所做的一切，都是为宣案结束后，成功打入中共积累资本，他所有表现出来的亲共都是假象，都是为了之后更隐秘的使命。武仲明彻底解脱了共嫌，而且扭转了蒋敬文和徐亦觉的印象，皆震撼于他的“牺牲”精神。武仲明却心身疲惫地说他可以原谅刘天章本人，但不能原谅他的行动和使命一再遭受质疑和破坏，所以他请求中统查办刘天章。刘天章失意买醉，得到蒋宝珍安慰。刘天章醉说党国的特工名誉，早晚就要毁在武仲明这样的共谍手中。师应山指责武仲明没有致刘天章于死地。武仲明说除非刘天章是日本间谍，或是做了宣案，但目前这两种可能都不是，所以暂无死理。武仲明告知师应山也许会被任命为西安警察局副局长，这份情谊让师应山很感动。在武仲明的提示下，师应山查出侯文选曾与丁一有过钱财交易。武仲明也从中统得到证实，侯文选成为宣案的最大嫌疑人。武仲明主动找徐亦觉喝酒，劝他少参与两党角斗，把精力用在对日谍战上，因为这才是民族大义，也是留名青史的资本。徐亦觉内疚告之，他仍然不能说出真相。武仲明表示他会用自己的办法来结案。徐亦觉最后告诉他，沈兰没有死，蒋宝珍谎报死情将其救活。现在沈兰已经蒋宝珍控制之下。而蒋宝珍要走武仲明之前老路，通过沈兰打入延安。武仲明震惊之余，醉酒回家，却看见蒋宝珍站在门前。
第三十五集
蒋宝珍问他下一步的行动，武仲明虚以委蛇。蒋宝珍最后承认，她现在所做一切，都是想向武仲明证实，自己是优秀特工。两人终于有了纠结又真实的一吻。面对蒋宝珍，武仲明感觉自己也陷入了分裂。师应山打探到侯文选回商县老家，武仲明开始为走上密查之路做各种准备。行将出发之际，蒋宝珍突然上车，把他带到一个路口，他看到了八办送阳阳离开西安的情景，也猜出沈兰可能就在那部车内。出城时机已到，蒋宝珍仍然纠缠，把他引到一个别墅，武仲明情急之下将其打昏。给她注射了安眠药，让其熟睡。武仲明给胡慕雄留书一封，率罗子春赴商县追捕侯文选。两人在商县郊区大车店，被中共游击队劫持上山。游击队决定处死两个国民党特工，武仲明宁死没说出真实身份，好在游击队长认出周恩来送武仲明的皮鞋，罗子春始知武仲明是中共特工，再度崩溃。游击队为保护武仲明，提出杀罗子春灭口，武仲明将他放走。
第三十六集
武仲明将罗子春放走，坦陈心迹，说自己在赴日之前已经加入中共，他从来没有背叛过自己的信仰，也不想伤害手下兄弟。宣侠父致力国共合作抗日，暗杀是对抗日大局的破坏。他彻查此案，于国于民于两党关系，都问心无愧。罗子春虽无法理解，却为武仲明真情打动，立下保证，不拆穿他的身份。蒋宝珍一夜未归，蒋敬文下令寻找，听徐亦觉说一直与武仲明在一起，遂放心。刘天章来找蒋宝珍，称武仲明突然失踪。蒋宝珍却突然声称要嫁给他，前提是杀了武仲明报仇。刘天章喜出望外，简直不敢相信自己的耳朵。在武仲明的安排下，化装成保安团的游击队在一座寺庙抓住了藏匿的侯文选。武仲明就地审讯，侯文选在强大心理压力下，供出他知道的宣案过程。武仲明指点侯文选在此案中，并无直接的血案，但现在知情人一个个灭口，他已然自身难保。武仲明点拨他以没得到奖金为名，直接去武汉告状。侯文选为了保命，接受了武仲明的建议，当即离开商县。武仲明请游击队暗中护送出境。武仲明返回专署，才知道在众人眼中，蒋宝珍一直同他在一起。 武仲明权衡利弊立刻报告蒋宝珍失踪，失踪前两人曾经发生冲突。蒋敬文大骂武仲明，又命令警察局和军统在全城寻找。
第三十七集
蒋敬文命令警察局和军统在全城寻找。此时，刘天章带着蒋宝珍现身，阴森询问武仲明这几天的行踪，蒋宝珍看见武仲明就打。刘天章让她当众指认，蒋敬文将他们赶出门外，只留宝珍一人问话。武仲明本以为事情败露，不料蒋敬文走出来，枪指刘天章大骂。武仲明一时也无法相信自己就此解脱。蒋敬文要办刘天章，刘天章拿出徐恩曾手书密令得以脱身。刘天章以小玲母女性命威胁罗子春，让他说出武仲明出城真相，罗子春咬牙没说。刘天章遂威胁让他刺杀武仲明或蒋宝珍中的一人，罗子春陷入痛苦矛盾中。胡慕雄秘书杨辉亮出接头古币，武仲明与组织失散近两个月，终于接上头。他担心组织误解，杨辉却告之周恩来完全相信他的忠诚，。杨辉又说沈兰和孩子已经安全返回延安。武仲明马上讲出蒋宝珍的阴谋。杨辉告诉他，蒋宝珍也是自己人，她所做的一切都是在迷惑敌人。原来蒋宝珍受命配合武仲明的行动，因为严格的组织纪律，开始对武仲明的真实身份，也并不知情。但她在接触中，逐渐猜出了武仲明的真实身份。武仲明震惊中，回忆自己在行营的几次转危为安，终于理解了蒋宝珍狂放与深情并重的内涵。他的每一步成功，都有蒋宝珍的心血。而移花接木抢救出沈兰，则是其中最惊险又最精彩的一笔。罗子春要引蒋宝珍出公馆，行动被刘天章中止。走投无路的刘天章，想得到徐亦觉支持，被嘲笑后赶出四科。丁一却与之密谋，要联手暗杀武仲明。杨辉告诉武仲明，侯文选马上抵达武汉，宣案大局已定，周恩来为他已经做出了妥善安排。武仲明决意将密查进行到底。杨辉告之师应山已经成为中共情工而小玲也在隐蔽战线为党工作。罗子春到胡公馆找武仲明，声称蒋宝珍要见他，武仲明毫不怀疑出门。罗子春突然在他身后举枪，随即倒在警卫的乱枪之下。武仲明发现罗子春枪中根本没有子弹，这次行刺，既是为了示警，也是为了保护小玲。
第三十八集
武仲明愤怒冲至行营，怒抓丁一。侯文选抵达武汉，军统刺杀宣侠父的真相，首先在国民党上层公开。张毅、武仲明审讯丁一，丁一不肯开口。武仲明点拨徐亦觉，让他劝丁一认罪。徐亦觉加入审讯，告诉丁一大势已去。丁一交待了他所知悉的宣案过程，以及三次刺杀武仲明经过。因为洪老五和侯文选都有中统地下人员的身份。刘天章随即被批捕。武仲明和刘天章最终对话，武仲明指出他对中共的仇恨，是自己心理扭曲造成。刘天章诅咒武仲明也不久人世。武仲明说要死得其所，自己要的是拯救！师应山找到刘天章要挟蒋敬文的经费批条，中统总局下令杭力将其暗杀。师应山奉命执行， 说清自己此刻身份，刘天章在绝望中死去。武仲明留存蒋敬文批条，称案件涉及中统，指点张毅让中统派人协查，以减轻军统压力。葛寿芝随即空降西安。葛寿芝得知局面失控，指示他把徐亦觉也弄掉。武仲明暗中找到徐亦觉，指明出路。徐亦觉感激之余，拿出蒋敬文的署名手令。八办终于找出了宣侠父遗体，丁一和侯文选被枪决，徐亦觉被停职。武仲明把结局告诉胡慕雄，并激动说出对宣案的真实感受。
第三十九集
武仲明把结局告诉胡慕雄，并激动说出对宣案的真实感受，得到胡慕雄共鸣。葛寿芝和张毅即将离开西安，蒋敬文赶到，听武仲明通报案情。蒋敬文蛮横指出不许再动他的人，又逼问武仲明去向，武仲明出人意料销毁了两个手令。蒋敬文自此心安，徐亦觉和蒋宝珍在武仲明家门外，窃听到武仲明与葛寿芝的谈话。葛寿芝责备武仲明操之过急，不听控制。因为他才是密裁宣侠父的真正策划者。为了图谋建立党国第三方特工势力，他向蒋介石建议暗杀宣侠父，以警诫西北军政要员，远离中共的统一战线蛊惑。现在蒋鼎文拒绝认帐，他也无力回天。徐亦觉率手下包围武家，葛寿芝交付蒋介石密裁宣侠父的手谕，让武仲明为他保管。以在关键时候，救他一命。武仲明拿到手谕，极尽悲愤，痛斥葛寿芝为满足一已私利，杀害抗日豪杰，造成两党交恶。葛寿芝也被迫承认，武仲明当年头上的一枪是他亲手所射，因为武仲明当年功高盖主。葛寿芝恨说我死了，你的伤也终将不治。而手谕公开，所有知情者都会被赶尽杀绝。这时，徐亦觉和蒋宝珍同时来到门外，同时目睹武仲明枪决葛寿芝的场面。武仲明从容面对徐亦觉，称徐不会杀自己，而他手上的手谕，完全可以让军统从此事中脱身。武仲明在枪口下安然脱身，最后回身和蒋宝珍握手，说我们也算爱一回，不论感情真假。此番我多凶险，咱们就此别过！徐亦觉前脚放走武仲明，后脚接到军统密杀令，只得咬牙命令追杀。却不知武仲明在和蒋宝珍握手之际，已经将手谕传至蒋宝珍手中。武仲明奋力逃离追杀，吸引军统特务的注意力；蒋宝珍流泪开车，终将密裁手谕送到。武仲明重伤后坚持回到行营，执意让徐亦觉结束自己的生命，并称希望自己是徐手下最后一名共产党人。
- 央视八套4月12日21：37播出第1集
- 央视八套4月13日起每晚19：30播出，每天2集
